Protein–RNA interactions for Protein: P32443

Meox2, Homeobox protein MOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meox2P32443 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Meox2P32443 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Meox2P32443 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Meox2P32443 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Meox2P32443 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Meox2P32443 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Meox2P32443 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Meox2P32443 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Meox2P32443 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Meox2P32443 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Meox2P32443 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Meox2P32443 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Meox2P32443 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Meox2P32443 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Meox2P32443 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Meox2P32443 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Meox2P32443 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Meox2P32443 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Meox2P32443 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Meox2P32443 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Meox2P32443 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Meox2P32443 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Meox2P32443 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Meox2P32443 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Meox2P32443 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Meox2P32443 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Meox2P32443 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Meox2P32443 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Meox2P32443 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Meox2P32443 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Meox2P32443 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Meox2P32443 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Meox2P32443 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Meox2P32443 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Meox2P32443 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Meox2P32443 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Meox2P32443 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Meox2P32443 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Meox2P32443 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Meox2P32443 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Meox2P32443 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Meox2P32443 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Meox2P32443 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Meox2P32443 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Meox2P32443 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Meox2P32443 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Meox2P32443 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Meox2P32443 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Meox2P32443 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Meox2P32443 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Meox2P32443 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Meox2P32443 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Meox2P32443 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Meox2P32443 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Meox2P32443 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Meox2P32443 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Meox2P32443 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Meox2P32443 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Meox2P32443 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Meox2P32443 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Meox2P32443 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Meox2P32443 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Meox2P32443 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Meox2P32443 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Meox2P32443 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Meox2P32443 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Meox2P32443 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Meox2P32443 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Meox2P32443 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Meox2P32443 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Meox2P32443 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Meox2P32443 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Meox2P32443 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Meox2P32443 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Meox2P32443 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Meox2P32443 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Meox2P32443 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Meox2P32443 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Meox2P32443 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Meox2P32443 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Meox2P32443 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Meox2P32443 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Meox2P32443 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Meox2P32443 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Meox2P32443 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Meox2P32443 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Meox2P32443 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Meox2P32443 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Meox2P32443 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Meox2P32443 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Meox2P32443 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Meox2P32443 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Meox2P32443 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Meox2P32443 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Meox2P32443 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Meox2P32443 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Meox2P32443 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Meox2P32443 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Meox2P32443 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Meox2P32443 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms