Protein–RNA interactions for Protein: Q91V61

Sfxn3, Sideroflexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn3Q91V61 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33,87■■■■□ 3,01
Sfxn3Q91V61 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31,3■■■□□ 2,6
Sfxn3Q91V61 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Sfxn3Q91V61 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29,66■■■□□ 2,34
Sfxn3Q91V61 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29,31■■■□□ 2,28
Sfxn3Q91V61 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Sfxn3Q91V61 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28,96■■■□□ 2,23
Sfxn3Q91V61 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Sfxn3Q91V61 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Sfxn3Q91V61 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Sfxn3Q91V61 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Sfxn3Q91V61 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,33■■■□□ 2,13
Sfxn3Q91V61 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,17■■■□□ 2,1
Sfxn3Q91V61 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Sfxn3Q91V61 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Sfxn3Q91V61 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Sfxn3Q91V61 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27,41■■□□□ 1,98
Sfxn3Q91V61 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27,37■■□□□ 1,97
Sfxn3Q91V61 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Sfxn3Q91V61 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,32■■□□□ 1,96
Sfxn3Q91V61 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Sfxn3Q91V61 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27,14■■□□□ 1,94
Sfxn3Q91V61 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Sfxn3Q91V61 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Sfxn3Q91V61 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Sfxn3Q91V61 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Sfxn3Q91V61 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Sfxn3Q91V61 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Sfxn3Q91V61 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26,85■■□□□ 1,89
Sfxn3Q91V61 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Sfxn3Q91V61 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Sfxn3Q91V61 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Sfxn3Q91V61 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26,75■■□□□ 1,87
Sfxn3Q91V61 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26,71■■□□□ 1,87
Sfxn3Q91V61 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26,69■■□□□ 1,86
Sfxn3Q91V61 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Sfxn3Q91V61 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Sfxn3Q91V61 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26,37■■□□□ 1,81
Sfxn3Q91V61 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,26■■□□□ 1,79
Sfxn3Q91V61 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Sfxn3Q91V61 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Sfxn3Q91V61 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Sfxn3Q91V61 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26,12■■□□□ 1,77
Sfxn3Q91V61 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Sfxn3Q91V61 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Sfxn3Q91V61 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Sfxn3Q91V61 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25,98■■□□□ 1,75
Sfxn3Q91V61 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25,95■■□□□ 1,74
Sfxn3Q91V61 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Sfxn3Q91V61 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25,91■■□□□ 1,74
Sfxn3Q91V61 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,89■■□□□ 1,74
Sfxn3Q91V61 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Sfxn3Q91V61 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Sfxn3Q91V61 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Sfxn3Q91V61 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25,64■■□□□ 1,69
Sfxn3Q91V61 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Sfxn3Q91V61 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25,62■■□□□ 1,69
Sfxn3Q91V61 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Sfxn3Q91V61 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Sfxn3Q91V61 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Sfxn3Q91V61 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25,52■■□□□ 1,68
Sfxn3Q91V61 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Sfxn3Q91V61 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Sfxn3Q91V61 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Sfxn3Q91V61 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Sfxn3Q91V61 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Sfxn3Q91V61 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Sfxn3Q91V61 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Sfxn3Q91V61 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Sfxn3Q91V61 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Sfxn3Q91V61 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25,23■■□□□ 1,63
Sfxn3Q91V61 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Sfxn3Q91V61 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Sfxn3Q91V61 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Sfxn3Q91V61 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Sfxn3Q91V61 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Sfxn3Q91V61 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25,15■■□□□ 1,62
Sfxn3Q91V61 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25,14■■□□□ 1,61
Sfxn3Q91V61 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Sfxn3Q91V61 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25,11■■□□□ 1,61
Sfxn3Q91V61 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Sfxn3Q91V61 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25,09■■□□□ 1,61
Sfxn3Q91V61 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Sfxn3Q91V61 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Sfxn3Q91V61 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,05■■□□□ 1,6
Sfxn3Q91V61 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Sfxn3Q91V61 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Sfxn3Q91V61 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24,96■■□□□ 1,59
Sfxn3Q91V61 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Sfxn3Q91V61 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Sfxn3Q91V61 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24,9■■□□□ 1,58
Sfxn3Q91V61 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24,9■■□□□ 1,58
Sfxn3Q91V61 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Sfxn3Q91V61 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Sfxn3Q91V61 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Sfxn3Q91V61 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24,83■■□□□ 1,57
Sfxn3Q91V61 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24,83■■□□□ 1,57
Sfxn3Q91V61 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Sfxn3Q91V61 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24,8■■□□□ 1,56
Sfxn3Q91V61 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50,8 ms