Protein–RNA interactions for Protein: Q91V61

Sfxn3, Sideroflexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn3Q91V61 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Sfxn3Q91V61 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Sfxn3Q91V61 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Sfxn3Q91V61 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Sfxn3Q91V61 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Sfxn3Q91V61 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sfxn3Q91V61 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Sfxn3Q91V61 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sfxn3Q91V61 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sfxn3Q91V61 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sfxn3Q91V61 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sfxn3Q91V61 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Sfxn3Q91V61 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sfxn3Q91V61 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sfxn3Q91V61 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sfxn3Q91V61 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sfxn3Q91V61 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Sfxn3Q91V61 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sfxn3Q91V61 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sfxn3Q91V61 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Sfxn3Q91V61 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sfxn3Q91V61 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sfxn3Q91V61 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sfxn3Q91V61 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sfxn3Q91V61 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sfxn3Q91V61 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sfxn3Q91V61 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sfxn3Q91V61 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sfxn3Q91V61 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Sfxn3Q91V61 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sfxn3Q91V61 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sfxn3Q91V61 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sfxn3Q91V61 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sfxn3Q91V61 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Sfxn3Q91V61 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Sfxn3Q91V61 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sfxn3Q91V61 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sfxn3Q91V61 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sfxn3Q91V61 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sfxn3Q91V61 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sfxn3Q91V61 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sfxn3Q91V61 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sfxn3Q91V61 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sfxn3Q91V61 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sfxn3Q91V61 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sfxn3Q91V61 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sfxn3Q91V61 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Sfxn3Q91V61 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sfxn3Q91V61 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sfxn3Q91V61 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sfxn3Q91V61 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sfxn3Q91V61 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sfxn3Q91V61 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sfxn3Q91V61 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sfxn3Q91V61 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sfxn3Q91V61 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sfxn3Q91V61 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Sfxn3Q91V61 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sfxn3Q91V61 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sfxn3Q91V61 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sfxn3Q91V61 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Sfxn3Q91V61 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sfxn3Q91V61 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sfxn3Q91V61 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sfxn3Q91V61 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sfxn3Q91V61 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sfxn3Q91V61 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sfxn3Q91V61 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sfxn3Q91V61 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sfxn3Q91V61 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sfxn3Q91V61 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Sfxn3Q91V61 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sfxn3Q91V61 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sfxn3Q91V61 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sfxn3Q91V61 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sfxn3Q91V61 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sfxn3Q91V61 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sfxn3Q91V61 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Sfxn3Q91V61 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sfxn3Q91V61 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sfxn3Q91V61 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sfxn3Q91V61 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sfxn3Q91V61 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sfxn3Q91V61 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sfxn3Q91V61 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sfxn3Q91V61 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sfxn3Q91V61 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sfxn3Q91V61 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Sfxn3Q91V61 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sfxn3Q91V61 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sfxn3Q91V61 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Sfxn3Q91V61 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sfxn3Q91V61 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sfxn3Q91V61 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sfxn3Q91V61 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sfxn3Q91V61 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sfxn3Q91V61 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Sfxn3Q91V61 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sfxn3Q91V61 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Sfxn3Q91V61 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms