Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
Treml4Q3LRV9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Treml4Q3LRV9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Treml4Q3LRV9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
Treml4Q3LRV9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Treml4Q3LRV9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Treml4Q3LRV9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Treml4Q3LRV9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Treml4Q3LRV9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Treml4Q3LRV9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Treml4Q3LRV9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Treml4Q3LRV9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Treml4Q3LRV9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Treml4Q3LRV9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Treml4Q3LRV9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Treml4Q3LRV9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Treml4Q3LRV9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Treml4Q3LRV9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Treml4Q3LRV9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Treml4Q3LRV9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Treml4Q3LRV9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Treml4Q3LRV9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Treml4Q3LRV9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Treml4Q3LRV9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Treml4Q3LRV9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Treml4Q3LRV9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Treml4Q3LRV9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Treml4Q3LRV9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Treml4Q3LRV9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Treml4Q3LRV9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Treml4Q3LRV9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Treml4Q3LRV9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Treml4Q3LRV9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Treml4Q3LRV9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Treml4Q3LRV9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Treml4Q3LRV9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Treml4Q3LRV9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Treml4Q3LRV9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Treml4Q3LRV9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Treml4Q3LRV9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Treml4Q3LRV9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Treml4Q3LRV9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Treml4Q3LRV9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Treml4Q3LRV9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Treml4Q3LRV9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Treml4Q3LRV9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Treml4Q3LRV9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Treml4Q3LRV9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Treml4Q3LRV9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Treml4Q3LRV9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Treml4Q3LRV9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Treml4Q3LRV9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Treml4Q3LRV9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Treml4Q3LRV9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Treml4Q3LRV9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Treml4Q3LRV9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Treml4Q3LRV9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Treml4Q3LRV9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Treml4Q3LRV9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Treml4Q3LRV9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Treml4Q3LRV9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Treml4Q3LRV9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Treml4Q3LRV9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Treml4Q3LRV9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Treml4Q3LRV9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Treml4Q3LRV9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Treml4Q3LRV9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Treml4Q3LRV9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Treml4Q3LRV9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Treml4Q3LRV9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Treml4Q3LRV9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Treml4Q3LRV9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Treml4Q3LRV9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Treml4Q3LRV9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Treml4Q3LRV9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Treml4Q3LRV9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Treml4Q3LRV9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Treml4Q3LRV9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Treml4Q3LRV9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Treml4Q3LRV9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Treml4Q3LRV9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Treml4Q3LRV9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Treml4Q3LRV9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Treml4Q3LRV9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Treml4Q3LRV9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Treml4Q3LRV9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Treml4Q3LRV9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Treml4Q3LRV9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Treml4Q3LRV9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Treml4Q3LRV9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Treml4Q3LRV9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Treml4Q3LRV9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Treml4Q3LRV9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Treml4Q3LRV9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Treml4Q3LRV9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Treml4Q3LRV9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Treml4Q3LRV9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Treml4Q3LRV9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Treml4Q3LRV9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Treml4Q3LRV9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms