Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36,46■■■■□ 3,43
Treml4Q3LRV9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
Treml4Q3LRV9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
Treml4Q3LRV9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31,71■■■□□ 2,67
Treml4Q3LRV9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31,57■■■□□ 2,64
Treml4Q3LRV9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Treml4Q3LRV9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Treml4Q3LRV9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Treml4Q3LRV9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30,76■■■□□ 2,51
Treml4Q3LRV9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30,48■■■□□ 2,47
Treml4Q3LRV9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Treml4Q3LRV9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29,68■■■□□ 2,34
Treml4Q3LRV9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Treml4Q3LRV9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,47■■■□□ 2,31
Treml4Q3LRV9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Treml4Q3LRV9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29,36■■■□□ 2,29
Treml4Q3LRV9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29,28■■■□□ 2,28
Treml4Q3LRV9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Treml4Q3LRV9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Treml4Q3LRV9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Treml4Q3LRV9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Treml4Q3LRV9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Treml4Q3LRV9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Treml4Q3LRV9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Treml4Q3LRV9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28,85■■■□□ 2,21
Treml4Q3LRV9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Treml4Q3LRV9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Treml4Q3LRV9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,44■■■□□ 2,14
Treml4Q3LRV9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Treml4Q3LRV9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Treml4Q3LRV9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Treml4Q3LRV9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,28■■■□□ 2,12
Treml4Q3LRV9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Treml4Q3LRV9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,2■■■□□ 2,11
Treml4Q3LRV9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28,09■■■□□ 2,09
Treml4Q3LRV9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Treml4Q3LRV9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28,01■■■□□ 2,07
Treml4Q3LRV9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Treml4Q3LRV9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Treml4Q3LRV9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27,92■■■□□ 2,06
Treml4Q3LRV9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Treml4Q3LRV9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27,88■■■□□ 2,05
Treml4Q3LRV9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27,78■■■□□ 2,04
Treml4Q3LRV9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27,74■■■□□ 2,03
Treml4Q3LRV9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27,62■■■□□ 2,01
Treml4Q3LRV9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27,61■■■□□ 2,01
Treml4Q3LRV9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Treml4Q3LRV9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Treml4Q3LRV9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27,4■■□□□ 1,98
Treml4Q3LRV9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27,37■■□□□ 1,97
Treml4Q3LRV9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27,36■■□□□ 1,97
Treml4Q3LRV9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Treml4Q3LRV9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Treml4Q3LRV9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,23■■□□□ 1,95
Treml4Q3LRV9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Treml4Q3LRV9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Treml4Q3LRV9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,21■■□□□ 1,95
Treml4Q3LRV9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Treml4Q3LRV9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,2■■□□□ 1,94
Treml4Q3LRV9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Treml4Q3LRV9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Treml4Q3LRV9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Treml4Q3LRV9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27,06■■□□□ 1,92
Treml4Q3LRV9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Treml4Q3LRV9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,95■■□□□ 1,9
Treml4Q3LRV9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26,94■■□□□ 1,9
Treml4Q3LRV9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26,84■■□□□ 1,89
Treml4Q3LRV9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26,83■■□□□ 1,89
Treml4Q3LRV9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26,78■■□□□ 1,88
Treml4Q3LRV9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Treml4Q3LRV9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Treml4Q3LRV9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Treml4Q3LRV9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Treml4Q3LRV9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Treml4Q3LRV9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26,67■■□□□ 1,86
Treml4Q3LRV9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Treml4Q3LRV9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Treml4Q3LRV9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Treml4Q3LRV9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Treml4Q3LRV9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,51■■□□□ 1,84
Treml4Q3LRV9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Treml4Q3LRV9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Treml4Q3LRV9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Treml4Q3LRV9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,45■■□□□ 1,82
Treml4Q3LRV9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Treml4Q3LRV9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26,43■■□□□ 1,82
Treml4Q3LRV9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26,4■■□□□ 1,82
Treml4Q3LRV9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26,39■■□□□ 1,82
Treml4Q3LRV9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Treml4Q3LRV9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Treml4Q3LRV9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26,3■■□□□ 1,8
Treml4Q3LRV9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Treml4Q3LRV9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Treml4Q3LRV9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26,28■■□□□ 1,8
Treml4Q3LRV9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Treml4Q3LRV9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Treml4Q3LRV9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,21■■□□□ 1,79
Treml4Q3LRV9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,2■■□□□ 1,78
Treml4Q3LRV9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26,2■■□□□ 1,78
Treml4Q3LRV9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26,2■■□□□ 1,78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,4 ms