RNA–Protein interactions for RNA: YOL083W

ATG34, Transcript of Receptor protein involved in selective autophagy during starvation, yeast

Gene ATG34, Length 1,239 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG34	YOL083W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	ADH4	P10127	382 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	CDC43	P18898	376 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	VPS33	P20795	691 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	DMC1	P25453	334 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	YJL193W	P39542	402 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	MIT1	P40002	666 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	PIP2	P52960	996 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	MLC2	Q06580	163 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	HOS1	Q12214	470 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	PCK1	P10963	549 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	STE4	P18851	423 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	CBP3	P21560	335 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	SDS22	P36047	338 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	YKL133C	P36066	463 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	TDP1	P38319	544 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	SWD1	P39706	426 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	STU2	P46675	888 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	ATG36	P46983	293 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	YIP4	P53093	235 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	SPC98	P53540	846 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	MFM1	Q02783	413 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	TRS23	Q03784	219 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	NYV1	Q12255	253 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	ARP7	Q12406	477 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	PHO5	P00635	467 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	PTP2	P29461	750 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	EMP70	P32802	667 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	YMC2	P38087	329 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	TPM2	P40414	161 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	GSM1	P42950	618 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	TRI1	Q05024	226 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	SUT2	Q12286	268 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	SEC12	P11655	471 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	DSS4	P32601	143 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	TAF5	P38129	798 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	MUP3	P38734	546 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	YLF2	P38746	405 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	QRI7	P43122	407 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	HOF1	Q05080	669 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	PIF1	P07271	859 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG34	YOL083W	MSS18	P08593	268 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG34	YOL083W	BUD17	P53727	317 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG34	YOL083W	USA1	Q03714	838 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG34	YOL083W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATG34	YOL083W	TPK2	P06245	380 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG34	YOL083W	CNE1	P27825	502 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG34	YOL083W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATG34	YOL083W	STB5	P38699	743 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG34	YOL083W	HIS6	P40545	261 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG34	YOL083W	THI6	P41835	540 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG34	YOL083W	MAD3	P47074	515 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG34	YOL083W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATG34	YOL083W	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG34	YOL083W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATG34	YOL083W	STE12	P13574	688 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG34	YOL083W	RIM4	P38741	713 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG34	YOL083W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATG34	YOL083W	TEP1	P53916	434 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG34	YOL083W	UBX4	P54730	416 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG34	YOL083W	ACS1	Q01574	713 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG34	YOL083W	TRS31	Q03337	283 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG34	YOL083W	ENT2	Q05785	613 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG34	YOL083W	CCL1	P37366	393 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG34	YOL083W	YHL041W	P38730	149 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG34	YOL083W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG34	YOL083W	YEL020C	P39994	560 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG34	YOL083W	YIL166C	P40445	542 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG34	YOL083W	POL31	P46957	487 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG34	YOL083W	COS12	P53053	380 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG34	YOL083W	RTS3	P53289	263 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG34	YOL083W	AAD4	Q07747	329 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG34	YOL083W	VPS34	P22543	875 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG34	YOL083W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG34	YOL083W	LOT5	P34234	306 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG34	YOL083W	APM3	P38153	483 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG34	YOL083W	PIH1	P38768	344 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG34	YOL083W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG34	YOL083W	SAP4	P53036	818 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG34	YOL083W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG34	YOL083W	YDL073W	Q07454	984 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG34	YOL083W	CRD1	Q07560	283 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG34	YOL083W	RPN13	O13563	156 aa		4.53	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 8.9 ms