RNA–Protein interactions for RNA: YML118W

NGL3, Transcript of 3'-5' exonuclease specific for poly-A RNAs, yeast

Gene NGL3, Length 1,518 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NGL3	YML118W	NPR2	P39923	615 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NGL3	YML118W	YJR061W	P40355	935 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NGL3	YML118W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
NGL3	YML118W	BIT61	P47041	543 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NGL3	YML118W	COX18	P53239	316 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NGL3	YML118W	YPL071C	Q02864	156 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NGL3	YML118W	PKH1	Q03407	766 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NGL3	YML118W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
NGL3	YML118W	SKM1	Q12469	655 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NGL3	YML118W	SGS1	P35187	1447 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NGL3	YML118W	YLR415C	O13578	112 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	CHS2	P14180	963 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	CKA1	P15790	372 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	YBR259W	P38338	688 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	SIC1	P38634	284 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	MSS4	P38994	779 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	AXL1	P40851	1208 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.77	□□□□□ -1.65	RIP-Chip
NGL3	YML118W	CIR1	P42940	261 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	POL31	P46957	487 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	YML6	P51998	286 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	TEL2	P53038	688 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	ATG21	Q02887	496 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	TPO1	Q07824	586 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	SWM1	Q12379	170 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	SMC6	Q12749	1114 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	SKI3	P17883	1432 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	GCN4	P03069	281 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	GAL10	P04397	699 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	RPC53	P25441	422 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	MTH1	P35198	433 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	CAB3	P36076	571 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	SAF1	P38352	637 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	YHR112C	P38716	378 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	ECM1	P39715	212 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	SIP4	P46954	829 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	PRY1	P47032	299 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	SPO1	P53541	631 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	ADY3	Q07732	790 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	NBP2	Q12163	236 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	SSN2	P38931	1420 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	YLR302C	O13544	120 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	ARG3	P05150	338 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	KIN82	P25341	720 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	CTF13	P35203	478 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	CDS1	P38221	457 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	VFA1	P40080	203 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	YDL183C	P48569	320 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	VPS64	Q03944	604 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	ADY4	Q05955	493 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	GPB1	Q08886	897 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	ICL2	Q12031	575 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	HUA2	Q12134	243 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	YDR215C	Q12240	137 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	SFI1	Q12369	946 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	MET17	P06106	444 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	PDX1	P16451	410 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	DBF4	P32325	704 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	ERG3	P32353	365 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	MAC1	P35192	417 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	SFB3	P38810	929 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	YEL025C	P39991	1188 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	COG1	P53079	417 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	TRS31	Q03337	283 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	PSK2	Q08217	1101 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	POM34	Q12445	299 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	YOR111W	Q99210	232 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	ECM3	Q99252	613 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	MRP20	P32387	263 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.74	□□□□□ -1.65	RIP-Chip
NGL3	YML118W	FTR1	P40088	404 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NGL3	YML118W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65

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