RNA–Protein interactions for RNA: YJL034W

KAR2, Transcript of ATPase involved in protein import into the ER, yeast

Gene KAR2, Length 2,049 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KAR2	YJL034W	LAM5	P43560	674 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	SAE2	P46946	345 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	RSM26	P47141	266 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	RTA1	P53047	317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	SHE9	Q04172	456 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	EMP46	Q12396	444 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	VPS5	Q92331	675 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	MST1	P07236	462 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	KEX2	P13134	814 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	ATO2	P32907	282 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	RIB7	P33312	244 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	SRB2	P34162	210 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	KDX1	P36005	433 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	EXO84	P38261	753 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	ERP2	P39704	215 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	FLC2	P39719	783 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	SCC4	P40090	624 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	YER186C	P40101	306 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	YIL054W	P40524	105 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	YOR389W	Q08912	624 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	ATG11	Q12527	1178 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	PRT1	P06103	763 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	CHS1	P08004	1131 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	IMA3	P0CW40	589 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	IMA4	P0CW41	589 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	PEX2	P32800	271 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	MRE11	P32829	692 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	PTH2	P34222	208 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	TBS1	P38114	1094 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	YBR032W	P38223	100 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	SMF2	P38778	549 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	YAP1801	P38856	637 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	CKB2	P38930	258 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	LEM3	P42838	414 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	SAD1	P43589	448 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	FAP1	P53971	965 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	FMP25	Q08023	583 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	IMA2	Q08295	589 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	ICL2	Q12031	575 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	AVL9	Q12500	764 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	LYS9	P38999	446 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	TAF6	P53040	516 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	RKM2	Q03942	479 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	CDD1	Q06549	142 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	VPS54	Q12071	889 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	YLL056C	Q12177	298 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	CTF3	Q12748	733 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	HSM3	P38348	480 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	ERP5	P38819	212 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	DSE1	P40077	573 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	TFG1	P41895	735 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	SKP2	P42843	763 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	STB1	P42845	420 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	ALY2	P47029	1046 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	MUB1	Q03162	620 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	ARR1	Q06596	294 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	APC5	Q08683	685 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	THI21	Q08975	551 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	GPM3	Q12326	303 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	MCM1	P11746	286 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	DBP1	P24784	617 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	ADY2	P25613	283 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	YCR015C	P25616	317 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	FRE1	P32791	686 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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