RNA–Protein interactions for RNA: YJL004C

SYS1, Transcript of Integral membrane protein of the Golgi, yeast

Gene SYS1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYS1	YJL004C	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
SYS1	YJL004C	CCL1	P37366	393 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SYS1	YJL004C	EXO1	P39875	702 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SYS1	YJL004C	YJR096W	P47137	282 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SYS1	YJL004C	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
SYS1	YJL004C	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
SYS1	YJL004C	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
SYS1	YJL004C	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
SYS1	YJL004C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
SYS1	YJL004C	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
SYS1	YJL004C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	ASK1	P35734	292 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	CDS1	P38221	457 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	BST1	P43571	1029 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	YFL015C	P43578	164 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	SAP4	P53036	818 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	ENT2	Q05785	613 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	YCG1	Q06680	1035 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.89	□□□□□ -1.79	not detected
SYS1	YJL004C	RGT1	P32862	1170 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	YHR033W	P38690	423 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	YTA7	P40340	1379 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	SGS1	P35187	1447 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	OAF3	P36023	863 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	LRO1	P40345	661 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	TDA10	P42938	290 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	WAR1	Q03631	944 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	USA1	Q03714	838 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	ARR3	Q06598	404 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	CRC1	Q12289	327 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	APM4	Q99186	491 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	HXT7	P39004	570 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	YIL092W	P40497	633 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	ECM9	Q02202	377 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	YHM2	Q04013	314 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	HFI1	Q12060	488 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	YJL193W	P39542	402 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	YLR111W	Q12528	110 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	INO80	P53115	1489 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	HMG2	P12684	1045 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	MTC7	P32633	139 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	PPG1	P32838	368 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	PXL1	P36166	706 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	YPT10	P38146	199 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	EHT1	P38295	451 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	VID28	P40547	921 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	HLJ1	P48353	224 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	MRPL1	Q04599	285 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	TPO3	Q06451	622 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	YPR089W	O13585	888 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	BI2	P03873	423 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	AAC1	P04710	309 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	VPS33	P20795	691 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	DID4	P36108	232 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	YDL183C	P48569	320 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	ALG12	P53730	551 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SYS1	YJL004C	MON2	P48563	1636 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.8
SYS1	YJL004C	CDC26	P14724	124 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SYS1	YJL004C	DGR2	P32330	852 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SYS1	YJL004C	SAE2	P46946	345 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SYS1	YJL004C	YPL071C	Q02864	156 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SYS1	YJL004C	NUP53	Q03790	475 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SYS1	YJL004C	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
SYS1	YJL004C	THI73	Q07904	523 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SYS1	YJL004C	CRT10	Q08226	957 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SYS1	YJL004C	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
SYS1	YJL004C	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
SYS1	YJL004C	ADR1	P07248	1323 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SYS1	YJL004C	SEC12	P11655	471 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SYS1	YJL004C	FAT1	P38225	669 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SYS1	YJL004C	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
SYS1	YJL004C	CFD1	P40558	293 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SYS1	YJL004C	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
SYS1	YJL004C	YNL058C	P53947	316 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SYS1	YJL004C	PCL8	Q08966	492 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SYS1	YJL004C	YMR085W	P0CF18	432 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SYS1	YJL004C	BET2	P20133	325 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SYS1	YJL004C	AEP2	P22136	580 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SYS1	YJL004C	MGM1	P32266	881 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SYS1	YJL004C	MNN1	P39106	762 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SYS1	YJL004C	YIL024C	P40543	189 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SYS1	YJL004C	IRC7	P43623	340 aa		3.81	□□□□□ -1.8

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