RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W PRM6Q04705 352 aa9.25□□□□□ -0.93
DDI1YER143W APC5Q08683 685 aa9.25□□□□□ -0.93
DDI1YER143W PRC1P00729 532 aa9.24□□□□□ -0.93
DDI1YER143W RGR1P19263 1082 aa9.24□□□□□ -0.93
DDI1YER143W MEI4P29467 408 aa9.24□□□□□ -0.93
DDI1YER143W MET4P32389 672 aa9.24□□□□□ -0.93
DDI1YER143W VPH1P32563 840 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
DDI1YER143W ECM32P32644 1121 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
DDI1YER143W YBR056WP38081 501 aa9.24□□□□□ -0.93
DDI1YER143W YBR053CP38235 358 aa9.24□□□□□ -0.93
DDI1YER143W SPP381P38282 291 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
DDI1YER143W RIM4P38741 713 aa9.24□□□□□ -0.93
DDI1YER143W JHD1P40034 492 aa9.24□□□□□ -0.93
DDI1YER143W CDC1P40986 491 aa9.24□□□□□ -0.93
DDI1YER143W YJR039WP47107 1121 aa9.24□□□□□ -0.93
DDI1YER143W RSM26P47141 266 aa9.24□□□□□ -0.93
DDI1YER143W EMI2Q04409 500 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
DDI1YER143W HRD3Q05787 833 aa9.24□□□□□ -0.93
DDI1YER143W MRI1Q06489 411 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
DDI1YER143W THI20Q08224 551 aa9.24□□□□□ -0.93
DDI1YER143W MRN1Q08925 612 aaKnown RBP RIP-Chip data9.24□□□□□ -0.93not detected
DDI1YER143W TAF10Q12030 206 aa9.24□□□□□ -0.93
DDI1YER143W HRT3Q12347 344 aa9.24□□□□□ -0.93
DDI1YER143W IZH4Q99393 312 aa9.24□□□□□ -0.93
DDI1YER143W PRT1P06103 763 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
DDI1YER143W GCR1P07261 785 aa9.23□□□□□ -0.93
DDI1YER143W PYC1P11154 1178 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
DDI1YER143W SLY1P22213 666 aa9.23□□□□□ -0.93
DDI1YER143W HXT3P32466 567 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
DDI1YER143W RSC8P43609 557 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
DDI1YER143W GUF1P46943 645 aa9.23□□□□□ -0.93
DDI1YER143W TCB2P48231 1178 aa9.23□□□□□ -0.93
DDI1YER143W AIM32Q04689 311 aa9.23□□□□□ -0.93
DDI1YER143W FMP25Q08023 583 aa9.23□□□□□ -0.93
DDI1YER143W LEA1Q08963 238 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
DDI1YER143W THI21Q08975 551 aa9.23□□□□□ -0.93
DDI1YER143W FAP7Q12055 197 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
DDI1YER143W RAS1P01119 309 aa9.22□□□□□ -0.93
DDI1YER143W CBF1P17106 351 aa9.22□□□□□ -0.93
DDI1YER143W DSS4P32601 143 aa9.22□□□□□ -0.93
DDI1YER143W STB5P38699 743 aa9.22□□□□□ -0.93
DDI1YER143W TAF1P46677 1066 aa9.22□□□□□ -0.93
DDI1YER143W ATG36P46983 293 aa9.22□□□□□ -0.93
DDI1YER143W HLJ1P48353 224 aa9.22□□□□□ -0.93
DDI1YER143W MET13P53128 600 aa9.22□□□□□ -0.93
DDI1YER143W BET4Q00618 327 aa9.22□□□□□ -0.93
DDI1YER143W YML083CQ04526 418 aa9.22□□□□□ -0.93
DDI1YER143W PNP1Q05788 311 aa9.22□□□□□ -0.93
DDI1YER143W SFH1Q06168 426 aa9.22□□□□□ -0.93
DDI1YER143W LCB4Q12246 624 aa9.22□□□□□ -0.93
DDI1YER143W AVL9Q12500 764 aa9.22□□□□□ -0.93
DDI1YER143W RAD1P06777 1100 aa9.21□□□□□ -0.94
DDI1YER143W AMS1P22855 1083 aa9.21□□□□□ -0.94
DDI1YER143W TPS2P31688 896 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
DDI1YER143W DUG2P38149 878 aa9.21□□□□□ -0.94
DDI1YER143W POP4P38336 279 aa9.21□□□□□ -0.94
DDI1YER143W CIN4P39110 191 aa9.21□□□□□ -0.94
DDI1YER143W SAP1P39955 897 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
DDI1YER143W SAP185P40856 1058 aa9.21□□□□□ -0.94
DDI1YER143W RRT5P43607 289 aa9.21□□□□□ -0.94
DDI1YER143W PEX31P53203 462 aa9.21□□□□□ -0.94
DDI1YER143W CEG1Q01159 459 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
DDI1YER143W RKM2Q03942 479 aa9.21□□□□□ -0.94
DDI1YER143W ECM22Q05958 814 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
DDI1YER143W RRD2Q12461 358 aa9.21□□□□□ -0.94
DDI1YER143W CDC24P11433 854 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
DDI1YER143W HEM15P16622 393 aa9.2□□□□□ -0.94
DDI1YER143W AIM26P32858 118 aa9.2□□□□□ -0.94
DDI1YER143W SMX2P40204 77 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
DDI1YER143W INA22P40576 216 aa9.2□□□□□ -0.94
DDI1YER143W CTK3P46963 296 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
DDI1YER143W KTR6P54070 446 aa9.2□□□□□ -0.94
DDI1YER143W STE23Q06010 1027 aa9.2□□□□□ -0.94
DDI1YER143W YPR109WQ06104 294 aa9.2□□□□□ -0.94
DDI1YER143W PUF2Q12221 1075 aaKnown RBP RIP-Chip data9.2□□□□□ -0.94not detected
DDI1YER143W CCP1P00431 361 aa9.19□□□□□ -0.94
DDI1YER143W ARG4P04076 463 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
DDI1YER143W PAB1P04147 577 aaKnown RBP RIP-Chip data9.19□□□□□ -0.94not detected
DDI1YER143W ADH4P10127 382 aa9.19□□□□□ -0.94
DDI1YER143W SPO16P17122 198 aa9.19□□□□□ -0.94
DDI1YER143W KGD2P19262 463 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
DDI1YER143W PGS1P25578 521 aa9.19□□□□□ -0.94
DDI1YER143W RAD27P26793 382 aa9.19□□□□□ -0.94
DDI1YER143W YKR051WP36142 418 aa9.19□□□□□ -0.94
DDI1YER143W AIM18P38884 321 aa9.19□□□□□ -0.94
DDI1YER143W FMP10P40098 244 aa9.19□□□□□ -0.94
DDI1YER143W YIR016WP40572 265 aa9.19□□□□□ -0.94
DDI1YER143W RGD2P43556 714 aa9.19□□□□□ -0.94
DDI1YER143W RFX1P48743 811 aa9.19□□□□□ -0.94
DDI1YER143W YNL144CP53907 740 aa9.19□□□□□ -0.94
DDI1YER143W HER2Q03557 464 aa9.19□□□□□ -0.94
DDI1YER143W SND1Q04007 877 aa9.19□□□□□ -0.94
DDI1YER143W TPO1Q07824 586 aa9.19□□□□□ -0.94
DDI1YER143W YOR223WQ12015 292 aa9.19□□□□□ -0.94
DDI1YER143W MGT1P26188 188 aa9.18□□□□□ -0.94
DDI1YER143W YME1P32795 747 aa9.18□□□□□ -0.94
DDI1YER143W HSP78P33416 811 aa9.18□□□□□ -0.94
DDI1YER143W DSF2P38213 736 aa9.18□□□□□ -0.94
DDI1YER143W MSC7P38694 644 aa9.18□□□□□ -0.94
DDI1YER143W FSH1P38777 243 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.3 ms