RNA–Protein interactions for RNA: YER128W

VFA1, Transcript of Protein that interacts with Vps4p and has a role in vacuolar sorting, yeastyeast

Gene VFA1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1YER128W YBL028CP38202 106 aa3.65□□□□□ -1.83
VFA1YER128W RXT2P38255 430 aa3.65□□□□□ -1.83
VFA1YER128W TIF5P38431 405 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
VFA1YER128W OSH3P38713 996 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
VFA1YER128W APE4P38821 490 aa3.65□□□□□ -1.83
VFA1YER128W SMC2P38989 1170 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
VFA1YER128W ESL1P40456 1118 aa3.65□□□□□ -1.83
VFA1YER128W ALR2P43553 858 aa3.65□□□□□ -1.83
VFA1YER128W IML2P47031 731 aa3.65□□□□□ -1.83
VFA1YER128W NUP84P52891 726 aa3.65□□□□□ -1.83
VFA1YER128W SHE10P53075 577 aa3.65□□□□□ -1.83
VFA1YER128W PEX14P53112 341 aa3.65□□□□□ -1.83
VFA1YER128W DIP5P53388 608 aa3.65□□□□□ -1.83
VFA1YER128W YNL144CP53907 740 aa3.65□□□□□ -1.83
VFA1YER128W ASI1P54074 624 aa3.65□□□□□ -1.83
VFA1YER128W RAD33Q04231 177 aa3.65□□□□□ -1.83
VFA1YER128W IRC3Q06683 689 aa3.65□□□□□ -1.83
VFA1YER128W BUD7Q08754 746 aa3.65□□□□□ -1.83
VFA1YER128W THO2P53552 1597 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
VFA1YER128W TSC11P40061 1430 aa3.64□□□□□ -1.83
VFA1YER128W YLR419WQ06698 1435 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
VFA1YER128W TRM3Q07527 1436 aa3.64□□□□□ -1.83
VFA1YER128W ARD1P07347 238 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
VFA1YER128W SUI3P09064 285 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
VFA1YER128W SSC1P0CS90 654 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
VFA1YER128W TOP3P13099 656 aa3.64□□□□□ -1.83
VFA1YER128W SSD1P24276 1250 aaKnown RBP RIP-Chip data3.64□□□□□ -1.83not detected
VFA1YER128W PLC1P32383 869 aa3.64□□□□□ -1.83
VFA1YER128W LHS1P36016 881 aa3.64□□□□□ -1.83
VFA1YER128W RSM22P36056 628 aa3.64□□□□□ -1.83
VFA1YER128W GRX7P38068 203 aa3.64□□□□□ -1.83
VFA1YER128W PSY4P38193 441 aa3.64□□□□□ -1.83
VFA1YER128W YBR184WP38299 523 aa3.64□□□□□ -1.83
VFA1YER128W RTS1P38903 757 aa3.64□□□□□ -1.83
VFA1YER128W SPF1P39986 1215 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
VFA1YER128W TMN3P40071 706 aa3.64□□□□□ -1.83
VFA1YER128W PFD1P46988 109 aa3.64□□□□□ -1.83
VFA1YER128W SDA1P53313 767 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
VFA1YER128W ARP5P53946 755 aa3.64□□□□□ -1.83
VFA1YER128W FMP30Q02883 468 aa3.64□□□□□ -1.83
VFA1YER128W SVL3Q03088 825 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
VFA1YER128W SWA2Q06677 668 aa3.64□□□□□ -1.83
VFA1YER128W MDM36Q06820 579 aa3.64□□□□□ -1.83
VFA1YER128W BRX1Q08235 291 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
VFA1YER128W RTC5Q12108 567 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
VFA1YER128W RPO31P04051 1460 aa3.64□□□□□ -1.83
VFA1YER128W YRF1-4O13559 1382 aa3.63□□□□□ -1.83
VFA1YER128W YML133CQ03099 1374 aa3.63□□□□□ -1.83
VFA1YER128W YLL067CQ07888 1374 aa3.63□□□□□ -1.83
VFA1YER128W YLL066CQ99208 1374 aa3.63□□□□□ -1.83
VFA1YER128W IRC20Q06554 1556 aa3.63□□□□□ -1.83
VFA1YER128W FOB1O13329 566 aa3.63□□□□□ -1.83
VFA1YER128W RPS3P05750 240 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
VFA1YER128W HOM2P13663 365 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
VFA1YER128W RED1P14291 827 aa3.63□□□□□ -1.83
VFA1YER128W KSS1P14681 368 aa3.63□□□□□ -1.83
VFA1YER128W PMA2P19657 947 aa3.63□□□□□ -1.83
VFA1YER128W AAD3P25612 363 aa3.63□□□□□ -1.83
VFA1YER128W DAL80P26343 269 aa3.63□□□□□ -1.83
VFA1YER128W CDC60P26637 1090 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
VFA1YER128W RME1P32338 300 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
VFA1YER128W RPN2P32565 945 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
VFA1YER128W ECM32P32644 1121 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
VFA1YER128W RPC34P32910 317 aa3.63□□□□□ -1.83
VFA1YER128W PXA2P34230 853 aa3.63□□□□□ -1.83
VFA1YER128W YKL100CP34248 587 aa3.63□□□□□ -1.83
VFA1YER128W PET10P36139 283 aa3.63□□□□□ -1.83
VFA1YER128W GLG1P36143 616 aa3.63□□□□□ -1.83
VFA1YER128W JNM1P36224 373 aa3.63□□□□□ -1.83
VFA1YER128W GDT1P38301 280 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
VFA1YER128W YBR259WP38338 688 aa3.63□□□□□ -1.83
VFA1YER128W RFC1P38630 861 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
VFA1YER128W STN1P38960 494 aa3.63□□□□□ -1.83
VFA1YER128W BDH2P39713 417 aa3.63□□□□□ -1.83
VFA1YER128W MTW1P39731 289 aa3.63□□□□□ -1.83
VFA1YER128W GCD10P41814 478 aa3.63□□□□□ -1.83
VFA1YER128W GAT1P43574 510 aa3.63□□□□□ -1.83
VFA1YER128W GCD14P46959 383 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
VFA1YER128W SNX4P47057 423 aa3.63□□□□□ -1.83
VFA1YER128W SGM1P47166 707 aa3.63□□□□□ -1.83
VFA1YER128W YGR016WP53209 190 aa3.63□□□□□ -1.83
VFA1YER128W COP1P53622 1201 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
VFA1YER128W IPI3P53877 555 aa3.63□□□□□ -1.83
VFA1YER128W ZDS2P54786 942 aa3.63□□□□□ -1.83
VFA1YER128W RIM13Q03792 727 aa3.63□□□□□ -1.83
VFA1YER128W POB3Q04636 552 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
VFA1YER128W ADE13Q05911 482 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
VFA1YER128W TDA5Q06417 326 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
VFA1YER128W SPN1Q06505 410 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
VFA1YER128W VAM6Q07468 1049 aa3.63□□□□□ -1.83
VFA1YER128W YPL191CQ08930 360 aa3.63□□□□□ -1.83
VFA1YER128W HOM3P10869 527 aa3.62□□□□□ -1.83
VFA1YER128W PYC1P11154 1178 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
VFA1YER128W MSD1P15179 658 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
VFA1YER128W TRX2P22803 104 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
VFA1YER128W OCA4P25366 362 aa3.62□□□□□ -1.83
VFA1YER128W PGS1P25578 521 aa3.62□□□□□ -1.83
VFA1YER128W ITR1P30605 584 aa3.62□□□□□ -1.83
VFA1YER128W YEL043WP32618 956 aa3.62□□□□□ -1.83
VFA1YER128W TAF5P38129 798 aa3.62□□□□□ -1.83
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