RNA–Protein interactions for RNA: YDL107W

MSS2, Transcript of Peripherally bound inner membrane protein of the mitochondrial matrix, yeast

Gene MSS2, Length 1,056 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSS2	YDL107W	YFT2	Q06676	274 aa		5	□□□□□ -1.61
MSS2	YDL107W	YCG1	Q06680	1035 aa		5	□□□□□ -1.61
MSS2	YDL107W	MLH3	Q12083	715 aa		5	□□□□□ -1.61
MSS2	YDL107W	URA3	P03962	267 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSS2	YDL107W	TUP1	P16649	713 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSS2	YDL107W	PHO11	P35842	467 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSS2	YDL107W	PHO12	P38693	467 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSS2	YDL107W	PPE1	P38796	400 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSS2	YDL107W	SDS3	P40505	327 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSS2	YDL107W	ERR3	P42222	437 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSS2	YDL107W	RFX1	P48743	811 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSS2	YDL107W	SSL2	Q00578	843 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSS2	YDL107W	TRI1	Q05024	226 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSS2	YDL107W	BLS1	Q06071	122 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSS2	YDL107W	ARG1	P22768	420 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSS2	YDL107W	PRP28	P23394	588 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSS2	YDL107W	EHT1	P38295	451 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSS2	YDL107W	TMN3	P40071	706 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSS2	YDL107W	IML2	P47031	731 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSS2	YDL107W	ACS1	Q01574	713 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSS2	YDL107W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MSS2	YDL107W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MSS2	YDL107W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSS2	YDL107W	SEC12	P11655	471 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSS2	YDL107W	YPT53	P36019	220 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSS2	YDL107W	SPC72	P39723	622 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSS2	YDL107W	VID27	P40157	782 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSS2	YDL107W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSS2	YDL107W	FHN1	P53279	174 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSS2	YDL107W	TIM50	Q02776	476 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSS2	YDL107W	FDC1	Q03034	503 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSS2	YDL107W	YML131W	Q03102	365 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSS2	YDL107W	IRC10	Q08118	586 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSS2	YDL107W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSS2	YDL107W	PHO5	P00635	467 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	PCK1	P10963	549 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	POL3	P15436	1097 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	SSH4	P32343	579 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	NTH1	P32356	751 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	BEM3	P32873	1128 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	UBS1	P38290	277 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	YLF2	P38746	405 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	YDL183C	P48569	320 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	YAP1802	P53309	568 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	NKP1	Q12493	238 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	SSM4	P40318	1319 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	NUC1	P08466	329 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	YEL025C	P39991	1188 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	NDC80	P40460	691 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	MPS3	P47069	682 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	CIA1	Q05583	330 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	AAD4	Q07747	329 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	USV1	Q12132	391 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	KIN3	P22209	435 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	GSM1	P42950	618 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	GTR1	Q00582	310 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	CRD1	Q07560	283 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	SIR1	P21691	654 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	CLB4	P24871	460 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	SET3	P36124	751 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	PSY4	P38193	441 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	VFA1	P40080	203 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	PUG1	P40100	303 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	KHA1	P40309	873 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	PSF2	P40359	213 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	SMK1	P41808	388 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	STU2	P46675	888 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	MRPL13	Q02204	264 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	TRS130	Q03660	1102 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	CTT1	P06115	562 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	VPS33	P20795	691 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	FUB1	P25659	250 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	CTP1	P38152	299 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	STB5	P38699	743 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	YJL206C	P39529	758 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	YJL193W	P39542	402 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	LRO1	P40345	661 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	CTR1	P49573	406 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	ATG4	P53867	494 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	ARA2	Q04212	335 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	YDL086W	Q07505	273 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
MSS2	YDL107W	SUT2	Q12286	268 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	ABF1	P14164	731 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSS2	YDL107W	CDC43	P18898	376 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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