RNA–Protein interactions for RNA: YDL105W

NSE4, Transcript of Component of the SMC5-SMC6 complex, yeastyeast

Gene NSE4, Length 1,209 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE4YDL105W PPE1P38796 400 aa4.02□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W ENP2P48234 707 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W SPC105P53148 917 aa4.02□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W SKY1Q03656 742 aa4.02□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W YDL073WQ07454 984 aa4.02□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W LEU2P04173 364 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W RPL7AP05737 244 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W HEM1P09950 548 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W FAT1P38225 669 aa4.01□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W GPP2P40106 250 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W VID28P40547 921 aa4.01□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W YIP4P53093 235 aa4.01□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W HLR1Q04429 423 aa4.01□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W RPL7BQ12213 244 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W CPA2P03965 1118 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W TUP1P16649 713 aa4□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W DGR2P32330 852 aa4□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W DAL3P32459 195 aa4□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W BEM3P32873 1128 aa4□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W EMP65P40085 556 aa4□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W IES1P43579 692 aa4□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W NIT2P47016 307 aa4□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W YJR120WP47157 116 aa4□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W TAF4P50105 388 aa4□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W SLD3P53135 668 aa4□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W ATP23P53722 227 aa4□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W FOL1P53848 824 aa4□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W MFM1Q02783 413 aa4□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W EFR3Q03653 782 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W NSE5Q03718 556 aa4□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W STP4Q07351 490 aa4□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W YPL216WQ08964 1102 aa4□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W NOP56Q12460 504 aaKnown RBP RIP-Chip data4□□□□□ -1.77not detected
NSE4YDL105W YMR084WA2P2R3 262 aa3.99□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W KAR1P11927 433 aa3.99□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W CNE1P27825 502 aa3.99□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W PRE4P30657 266 aa3.99□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W MRPL9P31334 269 aa3.99□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W RPC34P32910 317 aa3.99□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W TOM20P35180 183 aa3.99□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W APD1P38281 316 aa3.99□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W COQ6P53318 479 aa3.99□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W COG6P53959 839 aa3.99□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W WHI2P12611 486 aa3.98□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W ACO1P19414 778 aaKnown RBP RIP-Chip data3.98□□□□□ -1.77not detected
NSE4YDL105W COX11P19516 300 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W DHR2P36009 735 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W MRPL7P36519 292 aa3.98□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W YHR033WP38690 423 aa3.98□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W PEA2P40091 420 aa3.98□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W PEX14P53112 341 aa3.98□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W YGR054WP53235 642 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W ERG13P54839 491 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W CDC26P14724 124 aa3.97□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W MF(ALPHA)2P32435 120 aa3.97□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W SER1P33330 395 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W CRG1P38892 291 aaRIP-Chip data3.97□□□□□ -1.77not detected
NSE4YDL105W FTR1P40088 404 aa3.97□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W NMD5P46970 1048 aa3.97□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W IRC8P47046 822 aa3.97□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W YNL018CP53976 612 aa3.97□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W GFD1Q04839 188 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W NGL1Q08213 363 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
NSE4YDL105W TFC4P33339 1025 aa3.96□□□□□ -1.78
NSE4YDL105W LOT5P34234 306 aa3.96□□□□□ -1.78
NSE4YDL105W SRP68P38687 599 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
NSE4YDL105W YEL025CP39991 1188 aa3.96□□□□□ -1.78
NSE4YDL105W SNO3P43544 222 aa3.96□□□□□ -1.78
NSE4YDL105W HOL1P53389 586 aa3.96□□□□□ -1.78
NSE4YDL105W BUD17P53727 317 aa3.96□□□□□ -1.78
NSE4YDL105W AIM41Q12032 185 aa3.96□□□□□ -1.78
NSE4YDL105W TGS1Q12052 315 aa3.96□□□□□ -1.78
NSE4YDL105W FRE7Q12333 620 aa3.96□□□□□ -1.78
NSE4YDL105W AQY1P0CD91 305 aa3.95□□□□□ -1.78
NSE4YDL105W CAP1P28495 268 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
NSE4YDL105W HEM12P32347 362 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
NSE4YDL105W PLC1P32383 869 aa3.95□□□□□ -1.78
NSE4YDL105W HXT4P32467 576 aa3.95□□□□□ -1.78
NSE4YDL105W PRM2P40534 656 aa3.95□□□□□ -1.78
NSE4YDL105W YJL043WP47053 257 aa3.95□□□□□ -1.78
NSE4YDL105W SQS1P53866 767 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
NSE4YDL105W TIM50Q02776 476 aa3.95□□□□□ -1.78
NSE4YDL105W PEX15Q08215 383 aa3.95□□□□□ -1.78
NSE4YDL105W HOP1P20050 605 aa3.94□□□□□ -1.78
NSE4YDL105W ATP12P22135 325 aa3.94□□□□□ -1.78
NSE4YDL105W ECM32P32644 1121 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
NSE4YDL105W PHM6Q05637 104 aa3.94□□□□□ -1.78
NSE4YDL105W TUF1P02992 437 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
NSE4YDL105W YEL076C-AP0CX16 216 aa3.93□□□□□ -1.78
NSE4YDL105W YLR464WP0CX17 216 aa3.93□□□□□ -1.78
NSE4YDL105W GRX7P38068 203 aa3.93□□□□□ -1.78
NSE4YDL105W CDS1P38221 457 aa3.93□□□□□ -1.78
NSE4YDL105W ENP1P38333 483 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
NSE4YDL105W EXO1P39875 702 aa3.93□□□□□ -1.78
NSE4YDL105W YEL076CP39971 216 aa3.93□□□□□ -1.78
NSE4YDL105W OPT1P40897 799 aa3.93□□□□□ -1.78
NSE4YDL105W RPS15Q01855 142 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
NSE4YDL105W ECM38Q05902 660 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
NSE4YDL105W CWC2Q12046 339 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
NSE4YDL105W HMG2P12684 1045 aa3.92□□□□□ -1.78
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