RNA–Protein interactions for RNA: YBR293W

VBA2, Transcript of Permease of basic amino acids in the vacuolar membrane, yeast

Gene VBA2, Length 1,425 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VBA2	YBR293W	RFC3	P38629	340 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	BCD1	P38772	366 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	AVT6	P40074	448 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	ESL1	P40456	1118 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	EPL1	P43572	832 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	FAR7	P43592	221 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	RPC17	P47076	161 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	YGR016W	P53209	190 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	PGA2	P53903	129 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	FYV6	P53913	173 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	MEH1	Q02205	184 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	GPI17	Q04080	534 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	ARP9	Q05123	467 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	PMT7	Q06644	662 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	GPI13	Q07830	1017 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	YEH2	Q07950	538 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	AVO1	Q08236	1176 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	SGO1	Q08490	590 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	ADR1	P07248	1323 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	CBP3	P21560	335 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	PEX1	P24004	1043 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	PLC1	P32383	869 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	ACP1	P32463	125 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	HES1	P35843	434 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	APM2	P38700	605 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	IES5	P40060	125 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	QDR2	P40474	542 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	SER33	P40510	469 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	PAC11	P40960	533 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	IES1	P43579	692 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	TY4A-J	P47023	414 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	SSN8	P47821	323 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	SKP1	P52286	194 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	MEC3	Q02574	474 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	ACL4	Q03771	387 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	ACF2	Q12168	779 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	HSP42	Q12329	375 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	TRM11	Q12463	433 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	FUS1	P11710	512 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	ATR1	P13090	542 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	RED1	P14291	827 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	PPH3	P32345	308 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	TAT1	P38085	619 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	GIP1	P38229	639 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	ALG14	P38242	237 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	STP2	P38704	541 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	CCT6	P39079	546 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	ATG36	P46983	293 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	APS3	P47064	194 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	ALT1	P52893	592 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	YGL108C	P53139	140 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	RTC4	P53850	401 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	PNG1	Q02890	363 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	EEB1	Q02891	456 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	FCP1	Q03254	732 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	ABZ2	Q03266	374 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	YDR239C	Q03780	787 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	RRN11	Q04712	507 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	YDR306C	Q06640	478 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	ATG29	Q12092	213 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	ARP6	Q12509	438 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	YPT6	Q99260	215 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	CLN3	P13365	580 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	not detected
VBA2	YBR293W	KIN3	P22209	435 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	RPC53	P25441	422 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	IMP2'	P32351	346 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	SUV3	P32580	737 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	STE5	P32917	917 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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