RNA–Protein interactions for RNA: RDN25-2

RDN25-2, Transcript of 25S ribosomal RNA (25S rRNA), yeastyeast

Gene RDN25-2, Length 3,396 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDN25-2RDN25-2 CLA4P48562 842 aa9.91□□□□□ -0.82
RDN25-2RDN25-2 YGL039WP53183 348 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
RDN25-2RDN25-2 ORC4P54791 529 aa9.91□□□□□ -0.82
RDN25-2RDN25-2 SGO1Q08490 590 aa9.91□□□□□ -0.82
RDN25-2RDN25-2 FLO11P08640 1367 aa9.9□□□□□ -0.82
RDN25-2RDN25-2 YBL028CP38202 106 aa9.9□□□□□ -0.82
RDN25-2RDN25-2 PSY2P40164 858 aa9.9□□□□□ -0.82
RDN25-2RDN25-2 CAD1P24813 409 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
RDN25-2RDN25-2 DAL2P25335 343 aa9.9□□□□□ -0.82
RDN25-2RDN25-2 PEP12P32854 288 aa9.9□□□□□ -0.82
RDN25-2RDN25-2 YKR015CP36111 568 aa9.9□□□□□ -0.82
RDN25-2RDN25-2 SWP82P43554 623 aa9.9□□□□□ -0.82
RDN25-2RDN25-2 NOG2P53742 486 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
RDN25-2RDN25-2 INA17Q02888 182 aa9.9□□□□□ -0.82
RDN25-2RDN25-2 PSF3Q12146 194 aa9.9□□□□□ -0.82
RDN25-2RDN25-2 GPA2P10823 449 aa9.89□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 PAN5P38787 379 aa9.89□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 ALA1P40825 983 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 TIM8P57744 87 aa9.89□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 TBF1Q02457 562 aa9.89□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 PGK1P00560 416 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 THS1P04801 734 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 RPB4P20433 221 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 DBF4P32325 704 aa9.89□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 RCN1P36054 211 aa9.89□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 PPX1P38698 397 aa9.89□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 NUP82P40368 713 aa9.89□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 CAB2P40506 365 aa9.89□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 PHB1P40961 287 aa9.89□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 ORC3P54790 616 aa9.89□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 GTB1Q04924 702 aa9.89□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 YOR059CQ08448 450 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 SIT4P20604 311 aa9.89□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 RAD54P32863 898 aa9.89□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 MRX3P38172 270 aa9.89□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 APS3P47064 194 aa9.89□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 SEN54Q02825 467 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 ESS1P22696 170 aa9.88□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 MRPL32P25348 183 aa9.88□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 CCL1P37366 393 aa9.88□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 ZRG17P53735 605 aa9.88□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 RKM1Q08961 583 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 YBL055CP34220 418 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 FAF1P40546 346 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 MNN11P46985 422 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 ELA1P53861 379 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 DUS4Q06063 367 aa9.88□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 AAD3P25612 363 aa9.88□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 ACH1P32316 526 aa9.88□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 MNN2P38069 597 aa9.88□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 YBR032WP38223 100 aa9.88□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 CBR1P38626 284 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 GRE3P38715 327 aaKnown RBP RIP-Chip data9.88□□□□□ -0.83not detected
RDN25-2RDN25-2 FMP33P46998 180 aa9.88□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 YNL108CP53929 270 aa9.88□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 UBP2Q01476 1272 aa9.88□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 SWP1Q02795 286 aa9.88□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 SND1Q04007 877 aa9.88□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 COX20Q04935 205 aa9.88□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 SVF1Q05515 481 aa9.88□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 SKG3Q06315 1026 aa9.88□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 PTR2P32901 601 aa9.87□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 YHL008CP38750 627 aa9.87□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 LSM12P38828 187 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 ESL1P40456 1118 aa9.87□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 MEH1Q02205 184 aa9.87□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 ACF2Q12168 779 aa9.87□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 VCX1Q99385 411 aa9.87□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 RPA135P22138 1203 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 CAP1P28495 268 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 DUR3P33413 735 aa9.87□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 HES1P35843 434 aa9.87□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 IFA38P38286 347 aa9.87□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 YMR134WP40207 237 aa9.87□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 MTG1Q03151 367 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 TAF3Q12297 353 aa9.87□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 VPS51P36116 164 aa9.86□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 TOS1P38288 455 aa9.86□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 SDH8P38345 138 aa9.86□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 TAF6P53040 516 aa9.86□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 UTP8P53276 713 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 SHR3Q02774 210 aa9.86□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 SAM3Q08986 587 aa9.86□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 YBR298C-AQ8TGK4 73 aa9.86□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 GCR1P07261 785 aa9.86□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 HSP60P19882 572 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 SRO9P25567 434 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 ICL1P28240 557 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 JEM1P40358 645 aa9.86□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 GPD2P41911 440 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 SNZ3P43545 298 aa9.86□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 ALY2P47029 1046 aa9.86□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 SNZ2P53824 298 aa9.86□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 IPI3P53877 555 aa9.86□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 APC5Q08683 685 aa9.86□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 ILV2P07342 687 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 ATG19P35193 415 aa9.86□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 TRM5P38793 499 aa9.86□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 ASG1P40467 964 aa9.86□□□□□ -0.83
RDN25-2RDN25-2 TY4A-JP47023 414 aa9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 124 ms