RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000187727.1

Gm28578-201, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Gm28578, Length 2,698 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Ighv5-12A0A075B5Q4 117 aa10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Olfr1274-psA0A1L1SQ02 309 aa10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Fthl17bA2AHC5 176 aa10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Fthl17cA2AHC6 176 aa10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Zfp160E9Q459 650 aa10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Gm21719J3KMI9 230 aa10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Rdh16O54909 317 aa10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Fosl1P48755 273 aa10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Fthl17fQ3SXD2 176 aa10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Tmem204Q7TQI0 226 aa10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Olfr1279Q8VF38 313 aa10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Zfp869Q9DC47 529 aa10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Ndufb10Q9DCS9 176 aa10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 VcanQ62059 3357 aa10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Olfr1289A0A288CFY5 326 aa10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Olfr1098A2AVB0 315 aa10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 E030018B13RikJ3QMS9 113 aa10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Sdc1P18828 311 aa10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Gpr12P35412 334 aa10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Gm20816Q5FWD4 227 aa10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 PhyhiplQ8BGT8 375 aa10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Znf146Q8BQN6 292 aa10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Znhit1Q8R331 154 aa10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Q9DAF8 208 aa10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 NagkQ9QZ08 343 aa10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 NacaP70670 2187 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Ighv5-2A0A0A6YVX8 117 aa10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Gm572B1ARY8 399 aa10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Gm15127B1AVZ5 449 aa10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Gm15091B1AZM2 449 aa10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Cryba1P02525 198 aa10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Mtnd6P03925 172 aa10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 P04943 107 aa10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Mcpt8P43430 247 aa10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Clec12bQ149M0 275 aa10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 YrdcQ3U5F4 280 aa10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Zc4h2Q68FG0 224 aa10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Tox3Q80W03 575 aa10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Cacfd1Q8BG21 171 aa10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Znf2Q8BIQ3 427 aa10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Lpar6Q8BMC0 344 aa10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Cbln4Q8BME9 198 aa10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Prss35Q8C0F9 409 aa10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Olfr187Q8VEX6 308 aa10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Rab29Q91YQ1 204 aa10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Bbc3Q99ML1 193 aa10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 PbkQ9JJ78 330 aa10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 TollipQ9QZ06 274 aa10□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Celsr1O35161 3034 aa9.99□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Trav5-4A0A075B652 114 aa9.99□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Gm10112D3YWP5 117 aa9.99□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Npffr1E9Q468 432 aa9.99□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Hist1h1eP43274 219 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Vamp2P63044 116 aa9.99□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 SgcaP82350 387 aa9.99□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Q6PIU9 354 aa9.99□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Gm884A2A9H6 3643 aa9.99□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Trav15-2-dv6-2A0A075B650 123 aa9.99□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Olfr753-ps1A0A140LHN3 164 aa9.99□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Lnp1A0A1B0GSK3 178 aa9.99□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Vmn1r224E9PWK2 298 aa9.99□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Olfr1220F7BL62 311 aa9.99□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Casp6O08738 276 aa9.99□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Vdac2Q60930 295 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Tmed3Q78IS1 221 aa9.99□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Zfand6Q9DCH6 223 aa9.99□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Fgf16Q9ESL8 207 aa9.99□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Dctn5Q9QZB9 182 aa9.99□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Tsc22d3Q9Z2S7 137 aa9.99□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 CenpeQ6RT24 2474 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Trav6-1A0A075B5Z8 112 aa9.98□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Gm2026A2ART4 498 aa9.98□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Gm20481G3UXK4 153 aa9.98□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 P01759 136 aa9.98□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Zfp72Q0VFY0 435 aa9.98□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Olfr1509Q7TQQ0 308 aa9.98□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Tmem106cQ80VP8 260 aa9.98□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Olfr1449Q8VEV8 314 aa9.98□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Rab1bQ9D1G1 201 aa9.98□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 BptfA2A654 3036 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Trav7n-5A0A075B604 112 aa9.98□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Rpl23a-ps3A0A140T8M7 156 aa9.98□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Rabl2E9Q9D5 223 aa9.98□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Gm10666K7N6B8 321 aa9.98□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Vmn1r114L7N226 321 aa9.98□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Vmn1r126L7N2C8 321 aa9.98□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 P01881 257 aa9.98□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Rpl23aP62751 156 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Olfr688Q6W049 321 aa9.98□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Olfr859Q7TRF5 309 aa9.98□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Znf787Q8BIF9 381 aa9.98□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Harbi1Q8BR93 349 aa9.98□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Rbm48Q8K2X2 371 aa9.98□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Olfr344Q8VFP9 309 aa9.98□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Olfr916Q8VG53 310 aa9.98□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Rnf141Q99MB7 230 aa9.98□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Tmem33Q9CR67 247 aa9.98□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Sh2d6Q9D413 297 aa9.98□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Cir1Q9DA19 450 aa9.98□□□□□ -0.81
Gm28578-201ENSMUST00000187727 Zfp764E9QAP1 431 aa9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 43.5 ms