Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5Q4

Ighv5-12, Immunoglobulin heavy variable 5-12 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-12A0A075B5Q4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Ighv5-12A0A075B5Q4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ighv5-12A0A075B5Q4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ighv5-12A0A075B5Q4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ighv5-12A0A075B5Q4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ighv5-12A0A075B5Q4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ighv5-12A0A075B5Q4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Ighv5-12A0A075B5Q4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ighv5-12A0A075B5Q4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Ighv5-12A0A075B5Q4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ighv5-12A0A075B5Q4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ighv5-12A0A075B5Q4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ighv5-12A0A075B5Q4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ighv5-12A0A075B5Q4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ighv5-12A0A075B5Q4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ighv5-12A0A075B5Q4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ighv5-12A0A075B5Q4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ighv5-12A0A075B5Q4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ighv5-12A0A075B5Q4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ighv5-12A0A075B5Q4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ighv5-12A0A075B5Q4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ighv5-12A0A075B5Q4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ighv5-12A0A075B5Q4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ighv5-12A0A075B5Q4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ighv5-12A0A075B5Q4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ighv5-12A0A075B5Q4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ighv5-12A0A075B5Q4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ighv5-12A0A075B5Q4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ighv5-12A0A075B5Q4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ighv5-12A0A075B5Q4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ighv5-12A0A075B5Q4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ighv5-12A0A075B5Q4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ighv5-12A0A075B5Q4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ighv5-12A0A075B5Q4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ighv5-12A0A075B5Q4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ighv5-12A0A075B5Q4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ighv5-12A0A075B5Q4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ighv5-12A0A075B5Q4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ighv5-12A0A075B5Q4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ighv5-12A0A075B5Q4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ighv5-12A0A075B5Q4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ighv5-12A0A075B5Q4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ighv5-12A0A075B5Q4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ighv5-12A0A075B5Q4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ighv5-12A0A075B5Q4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ighv5-12A0A075B5Q4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ighv5-12A0A075B5Q4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ighv5-12A0A075B5Q4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ighv5-12A0A075B5Q4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ighv5-12A0A075B5Q4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ighv5-12A0A075B5Q4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ighv5-12A0A075B5Q4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ighv5-12A0A075B5Q4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ighv5-12A0A075B5Q4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ighv5-12A0A075B5Q4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ighv5-12A0A075B5Q4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ighv5-12A0A075B5Q4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ighv5-12A0A075B5Q4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ighv5-12A0A075B5Q4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ighv5-12A0A075B5Q4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ighv5-12A0A075B5Q4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ighv5-12A0A075B5Q4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ighv5-12A0A075B5Q4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ighv5-12A0A075B5Q4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ighv5-12A0A075B5Q4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ighv5-12A0A075B5Q4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ighv5-12A0A075B5Q4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ighv5-12A0A075B5Q4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ighv5-12A0A075B5Q4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ighv5-12A0A075B5Q4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ighv5-12A0A075B5Q4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ighv5-12A0A075B5Q4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ighv5-12A0A075B5Q4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ighv5-12A0A075B5Q4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ighv5-12A0A075B5Q4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ighv5-12A0A075B5Q4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ighv5-12A0A075B5Q4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ighv5-12A0A075B5Q4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ighv5-12A0A075B5Q4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ighv5-12A0A075B5Q4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ighv5-12A0A075B5Q4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ighv5-12A0A075B5Q4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ighv5-12A0A075B5Q4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ighv5-12A0A075B5Q4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ighv5-12A0A075B5Q4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ighv5-12A0A075B5Q4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ighv5-12A0A075B5Q4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ighv5-12A0A075B5Q4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ighv5-12A0A075B5Q4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ighv5-12A0A075B5Q4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ighv5-12A0A075B5Q4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ighv5-12A0A075B5Q4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ighv5-12A0A075B5Q4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ighv5-12A0A075B5Q4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ighv5-12A0A075B5Q4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ighv5-12A0A075B5Q4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ighv5-12A0A075B5Q4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 239.8 ms