Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5Q4

Ighv5-12, Immunoglobulin heavy variable 5-12 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-12A0A075B5Q4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30,71■■■□□ 2,51
Ighv5-12A0A075B5Q4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Ighv5-12A0A075B5Q4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Ighv5-12A0A075B5Q4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Ighv5-12A0A075B5Q4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,01
Ighv5-12A0A075B5Q4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,53■■■□□ 2
Ighv5-12A0A075B5Q4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27,14■■□□□ 1,94
Ighv5-12A0A075B5Q4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26,62■■□□□ 1,85
Ighv5-12A0A075B5Q4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26,59■■□□□ 1,85
Ighv5-12A0A075B5Q4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26,46■■□□□ 1,83
Ighv5-12A0A075B5Q4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,81
Ighv5-12A0A075B5Q4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Ighv5-12A0A075B5Q4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Ighv5-12A0A075B5Q4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Ighv5-12A0A075B5Q4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Ighv5-12A0A075B5Q4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25,8■■□□□ 1,72
Ighv5-12A0A075B5Q4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Ighv5-12A0A075B5Q4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25,71■■□□□ 1,71
Ighv5-12A0A075B5Q4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Ighv5-12A0A075B5Q4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Ighv5-12A0A075B5Q4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Ighv5-12A0A075B5Q4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Ighv5-12A0A075B5Q4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Ighv5-12A0A075B5Q4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Ighv5-12A0A075B5Q4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Ighv5-12A0A075B5Q4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Ighv5-12A0A075B5Q4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Ighv5-12A0A075B5Q4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Ighv5-12A0A075B5Q4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Ighv5-12A0A075B5Q4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Ighv5-12A0A075B5Q4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25,18■■□□□ 1,62
Ighv5-12A0A075B5Q4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Ighv5-12A0A075B5Q4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Ighv5-12A0A075B5Q4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25,03■■□□□ 1,6
Ighv5-12A0A075B5Q4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24,92■■□□□ 1,58
Ighv5-12A0A075B5Q4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Ighv5-12A0A075B5Q4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Ighv5-12A0A075B5Q4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,85■■□□□ 1,57
Ighv5-12A0A075B5Q4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Ighv5-12A0A075B5Q4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Ighv5-12A0A075B5Q4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Ighv5-12A0A075B5Q4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Ighv5-12A0A075B5Q4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24,5■■□□□ 1,51
Ighv5-12A0A075B5Q4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24,45■■□□□ 1,5
Ighv5-12A0A075B5Q4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,42■■□□□ 1,5
Ighv5-12A0A075B5Q4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,38■■□□□ 1,49
Ighv5-12A0A075B5Q4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Ighv5-12A0A075B5Q4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Ighv5-12A0A075B5Q4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24,24■■□□□ 1,47
Ighv5-12A0A075B5Q4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,24■■□□□ 1,47
Ighv5-12A0A075B5Q4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Ighv5-12A0A075B5Q4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
Ighv5-12A0A075B5Q4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Ighv5-12A0A075B5Q4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24,14■■□□□ 1,45
Ighv5-12A0A075B5Q4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Ighv5-12A0A075B5Q4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24,11■■□□□ 1,45
Ighv5-12A0A075B5Q4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Ighv5-12A0A075B5Q4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Ighv5-12A0A075B5Q4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Ighv5-12A0A075B5Q4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Ighv5-12A0A075B5Q4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,95■■□□□ 1,43
Ighv5-12A0A075B5Q4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Ighv5-12A0A075B5Q4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23,86■■□□□ 1,41
Ighv5-12A0A075B5Q4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Ighv5-12A0A075B5Q4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23,78■■□□□ 1,4
Ighv5-12A0A075B5Q4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Ighv5-12A0A075B5Q4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23,73■■□□□ 1,39
Ighv5-12A0A075B5Q4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,72■■□□□ 1,39
Ighv5-12A0A075B5Q4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Ighv5-12A0A075B5Q4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23,71■■□□□ 1,39
Ighv5-12A0A075B5Q4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Ighv5-12A0A075B5Q4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,69■■□□□ 1,38
Ighv5-12A0A075B5Q4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Ighv5-12A0A075B5Q4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23,66■■□□□ 1,38
Ighv5-12A0A075B5Q4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Ighv5-12A0A075B5Q4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Ighv5-12A0A075B5Q4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Ighv5-12A0A075B5Q4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Ighv5-12A0A075B5Q4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,56■■□□□ 1,36
Ighv5-12A0A075B5Q4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Ighv5-12A0A075B5Q4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Ighv5-12A0A075B5Q4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Ighv5-12A0A075B5Q4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23,49■■□□□ 1,35
Ighv5-12A0A075B5Q4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23,47■■□□□ 1,35
Ighv5-12A0A075B5Q4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,46■■□□□ 1,35
Ighv5-12A0A075B5Q4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Ighv5-12A0A075B5Q4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,45■■□□□ 1,35
Ighv5-12A0A075B5Q4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Ighv5-12A0A075B5Q4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Ighv5-12A0A075B5Q4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,31■■□□□ 1,32
Ighv5-12A0A075B5Q4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Ighv5-12A0A075B5Q4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23,3■■□□□ 1,32
Ighv5-12A0A075B5Q4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Ighv5-12A0A075B5Q4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Ighv5-12A0A075B5Q4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23,22■■□□□ 1,31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Ighv5-12A0A075B5Q4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
Ighv5-12A0A075B5Q4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
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