Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B652

Trav5-4, T cell receptor alpha variable 5-4 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav5-4A0A075B652 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29,65■■■□□ 2,34
Trav5-4A0A075B652 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Trav5-4A0A075B652 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Trav5-4A0A075B652 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Trav5-4A0A075B652 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Trav5-4A0A075B652 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Trav5-4A0A075B652 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26,42■■□□□ 1,82
Trav5-4A0A075B652 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26,29■■□□□ 1,8
Trav5-4A0A075B652 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Trav5-4A0A075B652 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25,9■■□□□ 1,74
Trav5-4A0A075B652 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Trav5-4A0A075B652 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
Trav5-4A0A075B652 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25,63■■□□□ 1,69
Trav5-4A0A075B652 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Trav5-4A0A075B652 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
Trav5-4A0A075B652 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25,43■■□□□ 1,66
Trav5-4A0A075B652 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Trav5-4A0A075B652 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Trav5-4A0A075B652 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Trav5-4A0A075B652 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Trav5-4A0A075B652 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Trav5-4A0A075B652 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Trav5-4A0A075B652 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Trav5-4A0A075B652 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Trav5-4A0A075B652 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Trav5-4A0A075B652 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Trav5-4A0A075B652 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24,89■■□□□ 1,58
Trav5-4A0A075B652 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24,84■■□□□ 1,57
Trav5-4A0A075B652 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Trav5-4A0A075B652 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Trav5-4A0A075B652 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Trav5-4A0A075B652 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Trav5-4A0A075B652 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,68■■□□□ 1,54
Trav5-4A0A075B652 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Trav5-4A0A075B652 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Trav5-4A0A075B652 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Trav5-4A0A075B652 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Trav5-4A0A075B652 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Trav5-4A0A075B652 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,5
Trav5-4A0A075B652 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Trav5-4A0A075B652 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24,29■■□□□ 1,48
Trav5-4A0A075B652 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24,29■■□□□ 1,48
Trav5-4A0A075B652 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,25■■□□□ 1,47
Trav5-4A0A075B652 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,17■■□□□ 1,46
Trav5-4A0A075B652 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24,11■■□□□ 1,45
Trav5-4A0A075B652 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Trav5-4A0A075B652 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24,05■■□□□ 1,44
Trav5-4A0A075B652 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Trav5-4A0A075B652 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Trav5-4A0A075B652 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Trav5-4A0A075B652 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Trav5-4A0A075B652 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Trav5-4A0A075B652 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Trav5-4A0A075B652 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Trav5-4A0A075B652 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,57■■□□□ 1,36
Trav5-4A0A075B652 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,54■■□□□ 1,36
Trav5-4A0A075B652 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Trav5-4A0A075B652 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Trav5-4A0A075B652 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23,51■■□□□ 1,35
Trav5-4A0A075B652 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Trav5-4A0A075B652 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,44■■□□□ 1,34
Trav5-4A0A075B652 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Trav5-4A0A075B652 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23,42■■□□□ 1,34
Trav5-4A0A075B652 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Trav5-4A0A075B652 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,4■■□□□ 1,34
Trav5-4A0A075B652 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Trav5-4A0A075B652 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Trav5-4A0A075B652 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Trav5-4A0A075B652 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Trav5-4A0A075B652 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23,29■■□□□ 1,32
Trav5-4A0A075B652 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23,24■■□□□ 1,31
Trav5-4A0A075B652 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23,22■■□□□ 1,31
Trav5-4A0A075B652 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,21■■□□□ 1,31
Trav5-4A0A075B652 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,2■■□□□ 1,3
Trav5-4A0A075B652 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,18■■□□□ 1,3
Trav5-4A0A075B652 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Trav5-4A0A075B652 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23,16■■□□□ 1,3
Trav5-4A0A075B652 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Trav5-4A0A075B652 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Trav5-4A0A075B652 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Trav5-4A0A075B652 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,28
Trav5-4A0A075B652 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Trav5-4A0A075B652 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Trav5-4A0A075B652 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Trav5-4A0A075B652 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23,02■■□□□ 1,28
Trav5-4A0A075B652 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Trav5-4A0A075B652 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Trav5-4A0A075B652 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Trav5-4A0A075B652 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Trav5-4A0A075B652 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Trav5-4A0A075B652 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Trav5-4A0A075B652 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,26
Trav5-4A0A075B652 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,89■■□□□ 1,25
Trav5-4A0A075B652 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Trav5-4A0A075B652 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Trav5-4A0A075B652 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Trav5-4A0A075B652 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Trav5-4A0A075B652 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,81■■□□□ 1,24
Trav5-4A0A075B652 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22,8■■□□□ 1,24
Trav5-4A0A075B652 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22,79■■□□□ 1,24
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