Protein–RNA interactions for Protein: P02525

Cryba1, Beta-crystallin A1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cryba1P02525 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Cryba1P02525 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cryba1P02525 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cryba1P02525 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cryba1P02525 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Cryba1P02525 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cryba1P02525 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cryba1P02525 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Cryba1P02525 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Cryba1P02525 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cryba1P02525 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cryba1P02525 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Cryba1P02525 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cryba1P02525 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Cryba1P02525 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cryba1P02525 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cryba1P02525 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cryba1P02525 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cryba1P02525 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cryba1P02525 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Cryba1P02525 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cryba1P02525 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cryba1P02525 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cryba1P02525 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cryba1P02525 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cryba1P02525 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cryba1P02525 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cryba1P02525 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Cryba1P02525 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cryba1P02525 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cryba1P02525 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cryba1P02525 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cryba1P02525 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cryba1P02525 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cryba1P02525 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cryba1P02525 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cryba1P02525 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cryba1P02525 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cryba1P02525 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cryba1P02525 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cryba1P02525 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cryba1P02525 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cryba1P02525 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cryba1P02525 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cryba1P02525 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cryba1P02525 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cryba1P02525 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cryba1P02525 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cryba1P02525 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cryba1P02525 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cryba1P02525 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cryba1P02525 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cryba1P02525 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cryba1P02525 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cryba1P02525 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cryba1P02525 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cryba1P02525 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cryba1P02525 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cryba1P02525 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cryba1P02525 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cryba1P02525 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cryba1P02525 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cryba1P02525 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cryba1P02525 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cryba1P02525 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cryba1P02525 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cryba1P02525 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cryba1P02525 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cryba1P02525 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cryba1P02525 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cryba1P02525 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cryba1P02525 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cryba1P02525 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cryba1P02525 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cryba1P02525 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cryba1P02525 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cryba1P02525 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cryba1P02525 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cryba1P02525 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cryba1P02525 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cryba1P02525 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cryba1P02525 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cryba1P02525 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cryba1P02525 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cryba1P02525 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cryba1P02525 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cryba1P02525 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cryba1P02525 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cryba1P02525 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cryba1P02525 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cryba1P02525 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cryba1P02525 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cryba1P02525 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cryba1P02525 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cryba1P02525 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cryba1P02525 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cryba1P02525 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cryba1P02525 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cryba1P02525 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cryba1P02525 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms