RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 WNT10AQ9GZT5 417 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 KLK15Q9H2R5 256 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 ENY2Q9NPA8 101 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 SERTAD4Q9NUC0 356 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 FKBP11Q9NYL4 201 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 RFNGQ9Y644 331 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 NOTCH2Q04721 2471 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 VPS13CQ709C8 3753 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 F8P00451 2351 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 ZANQ9Y493 2812 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 NAV3Q8IVL0 2385 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 TEX15Q9BXT5 2789 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 RNF222A6NCQ9 220 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 MFSD2BA6NFX1 497 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 PMS2P5A8MQ11 134 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM90A26D6RGX4 464 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 CLDN34H7C241 214 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 M0QZK8 103 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 AP4M1O00189 453 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 IGHV3-11P01762 117 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 CRYBA1P05813 215 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 PF4V1P10720 104 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 CTRB1P17538 263 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 NPY1RP25929 384 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 PPIFP30405 207 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 CYCSP99999 105 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 CTRB2Q6GPI1 263 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 TCTE3Q8IZS6 198 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM252Q8N6L7 170 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 KLHDC1Q8N7A1 406 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 OR52E5Q8NH55 327 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 OR2T6Q8NHC8 308 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC01006Q8NI28 216 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 THAP6Q8TBB0 222 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 SMIM8Q96KF7 97 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 HIPK2Q9H2X6 1198 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 WFDC1Q9HC57 220 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 TNCP24821 2201 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 CREBBPQ92793 2442 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 FBN3Q75N90 2809 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 HIVEP1P15822 2718 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A1W2PRX2 142 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 PSMB11A5LHX3 300 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 E5RGE8 158 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 MED6O75586 246 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 TSPAN9O75954 239 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 MT-CO2P00403 227 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 TRBV12-3P01733 135 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 C1QBP02746 253 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 RLN2P04090 185 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 IFNA4P05014 189 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 OR8U8P0C7N1 319 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 CD28P10747 220 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 DEFA4P12838 97 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 LYL1P12980 280 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 RPL12P30050 165 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 SNCAP37840 140 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 TPPP2P59282 170 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 ERHP84090 104 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 RHOGP84095 191 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 CFHR3Q02985 330 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 SCGB2A2Q13296 93 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 CLINT1Q14677 625 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 BSXQ3C1V8 233 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 ZFP69Q49AA0 526 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 ETV3LQ6ZN32 361 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF546Q86UE3 836 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 NOXA1Q86UR1 476 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 Q8N2B8 174 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 TTC9CQ8N5M4 171 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 JMJD8Q96S16 334 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 RAB40CQ96S21 281 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 FBXL7Q9UJT9 491 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 TNFSF18Q9UNG2 199 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa4.68□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa4.68□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa4.68□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 SMCO3A2RU48 225 aa4.68□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 ANKRD34BA5PLL1 514 aa4.68□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 NPIPB5A8MRT5 1133 aa4.68□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 PRSS46E5RG02 174 aa4.68□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 K7EIM0 57 aa4.68□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 TRGV3P03979 118 aa4.68□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 IGF1P05019 195 aa4.68□□□□□ -1.66
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