RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460759.1

NISCH-203, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 565 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-203ENST00000460759 C22orf15Q8WYQ4 148 aa10.23□□□□□ -0.77
NISCH-203ENST00000460759 SLC35E1Q96K37 410 aa10.23□□□□□ -0.77
NISCH-203ENST00000460759 NF1P21359 2839 aa10.23□□□□□ -0.77
NISCH-203ENST00000460759 SMCO3A2RU48 225 aa10.22□□□□□ -0.77
NISCH-203ENST00000460759 A6NDX4 124 aa10.22□□□□□ -0.77
NISCH-203ENST00000460759 BTBD17A6NE02 478 aa10.22□□□□□ -0.77
NISCH-203ENST00000460759 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
NISCH-203ENST00000460759 H3BUX3 64 aa10.22□□□□□ -0.77
NISCH-203ENST00000460759 CD5LO43866 347 aa10.22□□□□□ -0.77
NISCH-203ENST00000460759 CRYGCP07315 174 aa10.22□□□□□ -0.77
NISCH-203ENST00000460759 FAM157CP0CG43 387 aa10.22□□□□□ -0.77
NISCH-203ENST00000460759 CTRB1P17538 263 aa10.22□□□□□ -0.77
NISCH-203ENST00000460759 AKR1C1Q04828 323 aa10.22□□□□□ -0.77
NISCH-203ENST00000460759 FBLN7Q53RD9 439 aa10.22□□□□□ -0.77
NISCH-203ENST00000460759 CTRB2Q6GPI1 263 aa10.22□□□□□ -0.77
NISCH-203ENST00000460759 TEPPQ6URK8 271 aa10.22□□□□□ -0.77
NISCH-203ENST00000460759 BTNL8Q6UX41 500 aa10.22□□□□□ -0.77
NISCH-203ENST00000460759 SLC16A13Q7RTY0 426 aa10.22□□□□□ -0.77
NISCH-203ENST00000460759 TMEM144Q7Z5S9 345 aa10.22□□□□□ -0.77
NISCH-203ENST00000460759 PIFOQ8TCI5 191 aa10.22□□□□□ -0.77
NISCH-203ENST00000460759 NPCDR1Q9BY65 106 aa10.22□□□□□ -0.77
NISCH-203ENST00000460759 SH3BGRL3Q9H299 93 aa10.22□□□□□ -0.77
NISCH-203ENST00000460759 PARP11Q9NR21 331 aa10.22□□□□□ -0.77
NISCH-203ENST00000460759 PFDN2Q9UHV9 154 aa10.22□□□□□ -0.77
NISCH-203ENST00000460759 VPS13CQ709C8 3753 aa10.22□□□□□ -0.77
NISCH-203ENST00000460759 ITPR3Q14573 2671 aa10.21□□□□□ -0.77
NISCH-203ENST00000460759 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa10.21□□□□□ -0.77
NISCH-203ENST00000460759 PRH1P02810 166 aa10.21□□□□□ -0.77
NISCH-203ENST00000460759 AREGP15514 252 aa10.21□□□□□ -0.77
NISCH-203ENST00000460759 OPRK1P41145 380 aa10.21□□□□□ -0.77
NISCH-203ENST00000460759 CAMLGP49069 296 aa10.21□□□□□ -0.77
NISCH-203ENST00000460759 RUNX1Q01196 453 aa10.21□□□□□ -0.77
NISCH-203ENST00000460759 SCGB2A2Q13296 93 aa10.21□□□□□ -0.77
NISCH-203ENST00000460759 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
NISCH-203ENST00000460759 TREML4Q6UXN2 200 aa10.21□□□□□ -0.77
NISCH-203ENST00000460759 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
NISCH-203ENST00000460759 TTC9CQ8N5M4 171 aa10.21□□□□□ -0.77
NISCH-203ENST00000460759 SGMS2Q8NHU3 365 aa10.21□□□□□ -0.77
NISCH-203ENST00000460759 PRDM13Q9H4Q3 707 aa10.21□□□□□ -0.77
NISCH-203ENST00000460759 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
NISCH-203ENST00000460759 TEX46H3BTG2 121 aa10.2□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 DEFA4P12838 97 aa10.2□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 HNF1AP20823 631 aa10.2□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 RSG1Q9BU20 258 aa10.2□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa10.2□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa10.2□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 THYN1Q9P016 225 aa10.2□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 REG1AP05451 166 aa10.19□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 RAB2AP61019 212 aa10.19□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 NDPQ00604 133 aa10.19□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 DEFB112Q30KQ8 113 aa10.19□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 TMEM41BQ5BJD5 291 aa10.19□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 Q6ZRG5 221 aa10.19□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 COMMD1Q8N668 190 aa10.19□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 WNT10AQ9GZT5 417 aa10.19□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 ZNF580Q9UK33 172 aa10.19□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 HBE1P02100 147 aa10.18□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 IER3P46695 156 aa10.18□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 RPL29P47914 159 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 GAMTQ14353 236 aa10.18□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 KLK9Q2XQG4 91 aa10.18□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 AKIRIN2Q53H80 203 aa10.18□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 PXDC1Q5TGL8 231 aa10.18□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 Q6YL49 198 aa10.18□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 IL34Q6ZMJ4 242 aa10.18□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 COMMD7Q86VX2 200 aa10.18□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 TMEM219Q86XT9 240 aa10.18□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 THAP8Q8NA92 274 aa10.18□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 LFNGQ8NES3 379 aa10.18□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 LYPD6BQ8NI32 183 aa10.18□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 MISP3Q96FF7 219 aa10.18□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 GGTLC1Q9BX51 225 aa10.18□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 TMEM160Q9NX00 188 aa10.18□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 KLK9Q9UKQ9 250 aa10.18□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 NAV3Q8IVL0 2385 aa10.18□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 ABCA1O95477 2261 aa10.18□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 PLXNB1O43157 2135 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 ATP6V1G1O75348 118 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 SCGB2A1O75556 95 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 TSPAN15O95858 294 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 M6PRP20645 277 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 SELENOTP62341 195 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 ZNF616Q08AN1 781 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 FFAR4Q5NUL3 377 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 SPNS3Q6ZMD2 512 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 TMEM86BQ8N661 226 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 TMEM116Q8NCL8 245 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 FAM213BQ8TBF2 198 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 CXorf58Q96LI9 332 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 MGST2Q99735 147 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 HSPB9Q9BQS6 159 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 VPREB3Q9UKI3 123 aa10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms