RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF580Q9UK33 172 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 FBXO7Q9Y3I1 522 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 MPTX1A8MV57 137 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 SEC14L6B5MCN3 397 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 IGLV1-40P01703 118 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 DUTP33316 252 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 TPPP2P59282 170 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP10-11P60412 298 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 B2MP61769 119 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 VMA21Q3ZAQ7 101 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 AKIRIN2Q53H80 203 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 C9orf66Q5T8R8 295 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF645Q8N7E2 425 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 BEST4Q8NFU0 473 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 OR5T1Q8NG75 326 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 SCARB1Q8WTV0 552 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 ASB13Q8WXK3 278 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 SLC25A38Q96DW6 304 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 PHB2Q99623 299 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 GNB4Q9HAV0 340 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 IFT46Q9NQC8 304 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 NUDT15Q9NV35 164 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 ANXA10Q9UJ72 324 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 SPATA2Q9UM82 520 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 OR2W1Q9Y3N9 320 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 TRAV6A0A075B6T7 132 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 A0A0A6YYH2 397 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 A6NJ64 397 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 MPPED1O15442 326 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 SSX5O60225 188 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 SOX15O60248 233 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 FCGR3BO75015 233 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 ACTL6BO94805 426 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 IGHV3-11P01762 117 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 TRGV3P03979 118 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 OR8U8P0C7N1 319 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 FCGR2CP31995 323 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 AP3S2P59780 193 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 DGCR2P98153 550 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF616Q08AN1 781 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 PJVKQ0ZLH3 352 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM177Q53S58 311 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 OR2B11Q5JQS5 317 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 KCTD9Q7L273 389 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 GVQW1Q8N7I0 195 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 SAMD12Q8N8I0 201 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 C15orf40Q8WUR7 153 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 SMIM4Q8WVI0 70 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 GIMAP1Q8WWP7 306 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 C5orf30Q96GV9 206 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 LINC00052Q96N35 136 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 AUNIPQ9H7T9 357 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 MEIS3P1A6NDR6 274 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 MSGN1A6NI15 193 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 LINC00473A8K010 186 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 LINC01619G3V211 115 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 TSPAN4O14817 238 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 XRCC3O43542 346 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 SSNA1O43805 119 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 RAMP3O60896 148 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 IGLV2-23P01705 113 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 NMBP08949 121 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 APELAP0DMC3 54 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 PTHLHP12272 177 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 CXCL2P19875 107 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 ECI1P42126 302 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 CBX5P45973 191 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 FXYD4P59646 89 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 S100A12P80511 92 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 BTN1A1Q13410 526 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 TNXAQ16473 311 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 UBE2NLQ5JXB2 153 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM69Q5SWH9 247 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 HOGA1Q86XE5 327 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 TEX45Q8NA69 505 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 OR2T35Q8NGX2 323 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 MYOZ3Q8TDC0 251 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 SECTM1Q8WVN6 248 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM68Q96MH6 324 aa6.46□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.3 ms