RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr275Q7TS18 319 aa10.86□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SergefQ80YD6 464 aa10.86□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 YbeyQ8CAV0 164 aa10.86□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fcrl1Q8R4Y0 343 aa10.86□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Scrt1Q99M85 348 aa10.86□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q9CQT9 129 aa10.86□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tceal8Q9CZY2 117 aa10.86□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nol3Q9D1X0 220 aa10.86□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpr37Q9QY42 600 aa10.86□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Angpt4Q9WVH6 509 aa10.86□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tet1Q3URK3 2007 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kcnk3O35111 409 aa10.86□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Foxl2O88470 375 aa10.86□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GusbP12265 648 aa10.86□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hoxb1P17919 297 aa10.86□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hist1h1dP43277 221 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppp1ccP63087 323 aa10.86□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm1527Q3V0P3 650 aa10.86□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr804Q7TRH7 314 aa10.86□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NelfaQ8BG30 530 aa10.86□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vash1Q8C1W1 375 aa10.86□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 A930004D18RikQ8C8W7 157 aa10.86□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cmc2Q8K199 79 aa10.86□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r36Q8R2E3 305 aa10.86□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1427Q8VFU9 311 aa10.86□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mob1aQ921Y0 216 aa10.86□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MpiQ924M7 423 aa10.86□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GhsrQ99P50 364 aa10.86□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sdf2l1Q9ESP1 221 aa10.86□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mapk7Q9WVS8 806 aa10.86□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc25a53A2AF28 346 aa10.86□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm17657E9PWY5 170 aa10.86□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ifna1P01572 189 aa10.86□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 F13bQ07968 669 aa10.86□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Snrnp70Q62376 448 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zpld1Q8BGZ8 415 aa10.86□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klhdc3Q8VEM9 382 aa10.86□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GmfbQ9CQI3 142 aa10.86□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rab32Q9CZE3 223 aa10.86□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr155Q9QZ22 319 aa10.86□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp942B8JJA7 486 aa10.85□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Amy2P00688 508 aa10.85□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ifna9P09235 190 aa10.85□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NdnP25233 325 aa10.85□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Egr3P43300 387 aa10.85□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc25a4P48962 298 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sdr39u1Q5M8N4 308 aa10.85□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PcolceQ61398 468 aa10.85□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr222Q7TS30 318 aa10.85□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc17a5Q8BN82 495 aa10.85□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Glo1Q9CPU0 184 aa10.85□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc25a22Q9D6M3 323 aa10.85□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbp1Q9QXD6 338 aa10.85□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ankdd1aA0A1L1ST07 508 aa10.85□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zdhhc22A0PK84 263 aa10.85□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm498D3YYH9 372 aa10.85□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lyz2P08905 148 aa10.85□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GbaP17439 515 aa10.85□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Polr2gP62488 172 aa10.85□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CluQ06890 448 aa10.85□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nxph2Q61199 261 aa10.85□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1026Q7TR90 307 aa10.85□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rab5aQ9CQD1 215 aa10.85□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppp1r27Q9D119 154 aa10.85□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cldn15Q9Z0S5 227 aa10.85□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ube2ql1A0PJN4 161 aa10.84□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ube2dnl2A2AFH2 155 aa10.84□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dhrs3O88876 302 aa10.84□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 BlkP16277 499 aa10.84□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fosl1P48755 273 aa10.84□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 6430531B16RikQ3V2J1 307 aa10.84□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trav5d-4Q5R1F6 114 aa10.84□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arg1Q61176 323 aa10.84□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rab35Q6PHN9 201 aa10.84□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr180Q7TS48 317 aa10.84□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Faap24Q8BHL6 221 aa10.84□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr494Q8VG07 314 aa10.84□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1240Q8VG73 314 aa10.84□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1270Q8VGP3 304 aa10.84□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr639Q8VGY8 316 aa10.84□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q8WUR0 141 aa10.84□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nxph3Q91VX5 252 aa10.84□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf672Q99LH4 468 aa10.84□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nup37Q9CWU9 326 aa10.84□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rpl7l1Q9D8M4 246 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ManbalQ9D8X0 85 aa10.84□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NgfrQ9Z0W1 417 aa10.84□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zzef1Q5SSH7 2924 aa10.84□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp982A2A8Q4 368 aa10.84□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r83E9Q0G7 864 aa10.84□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Csf3P09920 208 aa10.84□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gstp2P46425 210 aa10.84□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hist1h3aP68433 136 aa10.84□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hist1h3bP84228 136 aa10.84□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 BaxQ07813 192 aa10.84□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tsr3Q5HZH2 323 aa10.84□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klf3Q60980 344 aa10.84□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc35e3Q6PGC7 313 aa10.84□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cstl1Q80Y72 140 aa10.84□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trib3Q8K4K2 354 aa10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 102.2 ms