Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Hoxb1P17919 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Hoxb1P17919 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Hoxb1P17919 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hoxb1P17919 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hoxb1P17919 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hoxb1P17919 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Hoxb1P17919 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hoxb1P17919 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Hoxb1P17919 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hoxb1P17919 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hoxb1P17919 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hoxb1P17919 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Hoxb1P17919 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Hoxb1P17919 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hoxb1P17919 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxb1P17919 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hoxb1P17919 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Hoxb1P17919 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hoxb1P17919 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hoxb1P17919 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hoxb1P17919 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hoxb1P17919 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hoxb1P17919 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hoxb1P17919 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Hoxb1P17919 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hoxb1P17919 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hoxb1P17919 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hoxb1P17919 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hoxb1P17919 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hoxb1P17919 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hoxb1P17919 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxb1P17919 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Hoxb1P17919 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxb1P17919 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hoxb1P17919 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxb1P17919 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxb1P17919 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hoxb1P17919 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxb1P17919 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxb1P17919 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hoxb1P17919 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hoxb1P17919 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hoxb1P17919 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Hoxb1P17919 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hoxb1P17919 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxb1P17919 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hoxb1P17919 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxb1P17919 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxb1P17919 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxb1P17919 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxb1P17919 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxb1P17919 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxb1P17919 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxb1P17919 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxb1P17919 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxb1P17919 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxb1P17919 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxb1P17919 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxb1P17919 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxb1P17919 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxb1P17919 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxb1P17919 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxb1P17919 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxb1P17919 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxb1P17919 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxb1P17919 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxb1P17919 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxb1P17919 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxb1P17919 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxb1P17919 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxb1P17919 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxb1P17919 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxb1P17919 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxb1P17919 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxb1P17919 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxb1P17919 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxb1P17919 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxb1P17919 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxb1P17919 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxb1P17919 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxb1P17919 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxb1P17919 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxb1P17919 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxb1P17919 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxb1P17919 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxb1P17919 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxb1P17919 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxb1P17919 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxb1P17919 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxb1P17919 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxb1P17919 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxb1P17919 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxb1P17919 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxb1P17919 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxb1P17919 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxb1P17919 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxb1P17919 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxb1P17919 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxb1P17919 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 310.8 ms