Protein–RNA interactions for Protein: Q8K199

Cmc2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmc2Q8K199 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Cmc2Q8K199 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28,98■■■□□ 2,23
Cmc2Q8K199 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2,07
Cmc2Q8K199 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Cmc2Q8K199 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27,2■■□□□ 1,94
Cmc2Q8K199 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Cmc2Q8K199 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Cmc2Q8K199 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Cmc2Q8K199 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Cmc2Q8K199 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Cmc2Q8K199 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Cmc2Q8K199 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Cmc2Q8K199 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Cmc2Q8K199 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26,02■■□□□ 1,76
Cmc2Q8K199 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Cmc2Q8K199 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,75
Cmc2Q8K199 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25,71■■□□□ 1,71
Cmc2Q8K199 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Cmc2Q8K199 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25,56■■□□□ 1,68
Cmc2Q8K199 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Cmc2Q8K199 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Cmc2Q8K199 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Cmc2Q8K199 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Cmc2Q8K199 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
Cmc2Q8K199 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25,13■■□□□ 1,61
Cmc2Q8K199 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Cmc2Q8K199 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Cmc2Q8K199 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Cmc2Q8K199 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Cmc2Q8K199 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24,9■■□□□ 1,58
Cmc2Q8K199 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Cmc2Q8K199 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Cmc2Q8K199 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Cmc2Q8K199 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,82■■□□□ 1,56
Cmc2Q8K199 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,82■■□□□ 1,56
Cmc2Q8K199 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24,82■■□□□ 1,56
Cmc2Q8K199 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,55
Cmc2Q8K199 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24,6■■□□□ 1,53
Cmc2Q8K199 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Cmc2Q8K199 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Cmc2Q8K199 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Cmc2Q8K199 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Cmc2Q8K199 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24,41■■□□□ 1,5
Cmc2Q8K199 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,41■■□□□ 1,5
Cmc2Q8K199 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Cmc2Q8K199 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Cmc2Q8K199 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24,32■■□□□ 1,48
Cmc2Q8K199 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24,31■■□□□ 1,48
Cmc2Q8K199 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Cmc2Q8K199 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Cmc2Q8K199 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
Cmc2Q8K199 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Cmc2Q8K199 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Cmc2Q8K199 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
Cmc2Q8K199 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,09■■□□□ 1,45
Cmc2Q8K199 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Cmc2Q8K199 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Cmc2Q8K199 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Cmc2Q8K199 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Cmc2Q8K199 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Cmc2Q8K199 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
Cmc2Q8K199 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
Cmc2Q8K199 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23,86■■□□□ 1,41
Cmc2Q8K199 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23,86■■□□□ 1,41
Cmc2Q8K199 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,83■■□□□ 1,41
Cmc2Q8K199 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Cmc2Q8K199 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,76■■□□□ 1,39
Cmc2Q8K199 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Cmc2Q8K199 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Cmc2Q8K199 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Cmc2Q8K199 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Cmc2Q8K199 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Cmc2Q8K199 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Cmc2Q8K199 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Cmc2Q8K199 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Cmc2Q8K199 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Cmc2Q8K199 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Cmc2Q8K199 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,44■■□□□ 1,34
Cmc2Q8K199 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23,41■■□□□ 1,34
Cmc2Q8K199 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Cmc2Q8K199 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Cmc2Q8K199 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Cmc2Q8K199 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,28■■□□□ 1,32
Cmc2Q8K199 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Cmc2Q8K199 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Cmc2Q8K199 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23,21■■□□□ 1,31
Cmc2Q8K199 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Cmc2Q8K199 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Cmc2Q8K199 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Cmc2Q8K199 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23,09■■□□□ 1,29
Cmc2Q8K199 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23,09■■□□□ 1,29
Cmc2Q8K199 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Cmc2Q8K199 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23,05■■□□□ 1,28
Cmc2Q8K199 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Cmc2Q8K199 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Cmc2Q8K199 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Cmc2Q8K199 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Cmc2Q8K199 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Cmc2Q8K199 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Cmc2Q8K199 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,3 ms