Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S5

Cldn15, Claudin-15, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn15Q9Z0S5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30,13■■■□□ 2,41
Cldn15Q9Z0S5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Cldn15Q9Z0S5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Cldn15Q9Z0S5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Cldn15Q9Z0S5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,6■■■□□ 2,01
Cldn15Q9Z0S5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Cldn15Q9Z0S5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Cldn15Q9Z0S5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26,79■■□□□ 1,88
Cldn15Q9Z0S5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26,77■■□□□ 1,88
Cldn15Q9Z0S5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Cldn15Q9Z0S5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Cldn15Q9Z0S5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26,25■■□□□ 1,79
Cldn15Q9Z0S5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Cldn15Q9Z0S5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25,87■■□□□ 1,73
Cldn15Q9Z0S5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25,85■■□□□ 1,73
Cldn15Q9Z0S5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Cldn15Q9Z0S5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Cldn15Q9Z0S5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Cldn15Q9Z0S5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Cldn15Q9Z0S5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Cldn15Q9Z0S5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Cldn15Q9Z0S5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Cldn15Q9Z0S5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Cldn15Q9Z0S5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Cldn15Q9Z0S5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Cldn15Q9Z0S5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25,24■■□□□ 1,63
Cldn15Q9Z0S5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Cldn15Q9Z0S5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Cldn15Q9Z0S5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Cldn15Q9Z0S5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25,13■■□□□ 1,61
Cldn15Q9Z0S5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Cldn15Q9Z0S5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Cldn15Q9Z0S5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Cldn15Q9Z0S5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Cldn15Q9Z0S5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Cldn15Q9Z0S5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,91■■□□□ 1,58
Cldn15Q9Z0S5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Cldn15Q9Z0S5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Cldn15Q9Z0S5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Cldn15Q9Z0S5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24,74■■□□□ 1,55
Cldn15Q9Z0S5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24,65■■□□□ 1,54
Cldn15Q9Z0S5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24,64■■□□□ 1,54
Cldn15Q9Z0S5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Cldn15Q9Z0S5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Cldn15Q9Z0S5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,46■■□□□ 1,51
Cldn15Q9Z0S5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,46■■□□□ 1,51
Cldn15Q9Z0S5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Cldn15Q9Z0S5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24,26■■□□□ 1,47
Cldn15Q9Z0S5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
Cldn15Q9Z0S5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
Cldn15Q9Z0S5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Cldn15Q9Z0S5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Cldn15Q9Z0S5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Cldn15Q9Z0S5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Cldn15Q9Z0S5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
Cldn15Q9Z0S5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,98■■□□□ 1,43
Cldn15Q9Z0S5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Cldn15Q9Z0S5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,96■■□□□ 1,43
Cldn15Q9Z0S5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23,92■■□□□ 1,42
Cldn15Q9Z0S5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,41
Cldn15Q9Z0S5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Cldn15Q9Z0S5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Cldn15Q9Z0S5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Cldn15Q9Z0S5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Cldn15Q9Z0S5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,76■■□□□ 1,39
Cldn15Q9Z0S5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Cldn15Q9Z0S5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,75■■□□□ 1,39
Cldn15Q9Z0S5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Cldn15Q9Z0S5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Cldn15Q9Z0S5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Cldn15Q9Z0S5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,66■■□□□ 1,38
Cldn15Q9Z0S5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Cldn15Q9Z0S5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23,66■■□□□ 1,38
Cldn15Q9Z0S5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,65■■□□□ 1,38
Cldn15Q9Z0S5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Cldn15Q9Z0S5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23,62■■□□□ 1,37
Cldn15Q9Z0S5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Cldn15Q9Z0S5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23,57■■□□□ 1,36
Cldn15Q9Z0S5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23,56■■□□□ 1,36
Cldn15Q9Z0S5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23,56■■□□□ 1,36
Cldn15Q9Z0S5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Cldn15Q9Z0S5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Cldn15Q9Z0S5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,34
Cldn15Q9Z0S5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Cldn15Q9Z0S5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23,38■■□□□ 1,33
Cldn15Q9Z0S5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Cldn15Q9Z0S5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,34■■□□□ 1,33
Cldn15Q9Z0S5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Cldn15Q9Z0S5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Cldn15Q9Z0S5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Cldn15Q9Z0S5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Cldn15Q9Z0S5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Cldn15Q9Z0S5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23,18■■□□□ 1,3
Cldn15Q9Z0S5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23,16■■□□□ 1,3
Cldn15Q9Z0S5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Cldn15Q9Z0S5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Cldn15Q9Z0S5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,1■■□□□ 1,29
Cldn15Q9Z0S5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Cldn15Q9Z0S5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23,07■■□□□ 1,28
Cldn15Q9Z0S5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23,06■■□□□ 1,28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,9 ms