Protein–RNA interactions for Protein: P00688

Amy2, Pancreatic alpha-amylase, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amy2P00688 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Amy2P00688 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Amy2P00688 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Amy2P00688 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Amy2P00688 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Amy2P00688 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Amy2P00688 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Amy2P00688 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Amy2P00688 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Amy2P00688 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Amy2P00688 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Amy2P00688 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Amy2P00688 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Amy2P00688 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Amy2P00688 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Amy2P00688 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Amy2P00688 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Amy2P00688 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Amy2P00688 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Amy2P00688 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Amy2P00688 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Amy2P00688 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Amy2P00688 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Amy2P00688 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Amy2P00688 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Amy2P00688 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Amy2P00688 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Amy2P00688 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Amy2P00688 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Amy2P00688 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Amy2P00688 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Amy2P00688 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Amy2P00688 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Amy2P00688 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Amy2P00688 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Amy2P00688 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Amy2P00688 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Amy2P00688 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Amy2P00688 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Amy2P00688 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Amy2P00688 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Amy2P00688 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Amy2P00688 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Amy2P00688 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Amy2P00688 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Amy2P00688 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Amy2P00688 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Amy2P00688 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Amy2P00688 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Amy2P00688 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Amy2P00688 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Amy2P00688 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Amy2P00688 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Amy2P00688 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Amy2P00688 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Amy2P00688 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Amy2P00688 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Amy2P00688 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Amy2P00688 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Amy2P00688 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Amy2P00688 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Amy2P00688 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Amy2P00688 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Amy2P00688 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Amy2P00688 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Amy2P00688 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Amy2P00688 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Amy2P00688 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Amy2P00688 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Amy2P00688 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Amy2P00688 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Amy2P00688 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Amy2P00688 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Amy2P00688 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Amy2P00688 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Amy2P00688 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Amy2P00688 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Amy2P00688 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Amy2P00688 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Amy2P00688 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Amy2P00688 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Amy2P00688 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Amy2P00688 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Amy2P00688 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Amy2P00688 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Amy2P00688 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Amy2P00688 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Amy2P00688 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Amy2P00688 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Amy2P00688 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Amy2P00688 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Amy2P00688 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Amy2P00688 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Amy2P00688 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Amy2P00688 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Amy2P00688 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Amy2P00688 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Amy2P00688 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Amy2P00688 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Amy2P00688 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms