Protein–RNA interactions for Protein: P08905

Lyz2, Lysozyme C-2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lyz2P08905 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30,23■■■□□ 2,43
Lyz2P08905 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Lyz2P08905 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Lyz2P08905 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Lyz2P08905 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Lyz2P08905 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Lyz2P08905 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27,28■■□□□ 1,96
Lyz2P08905 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Lyz2P08905 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27,01■■□□□ 1,91
Lyz2P08905 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Lyz2P08905 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Lyz2P08905 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26,5■■□□□ 1,83
Lyz2P08905 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Lyz2P08905 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26,37■■□□□ 1,81
Lyz2P08905 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Lyz2P08905 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Lyz2P08905 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Lyz2P08905 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Lyz2P08905 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Lyz2P08905 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,75
Lyz2P08905 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25,91■■□□□ 1,74
Lyz2P08905 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Lyz2P08905 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Lyz2P08905 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Lyz2P08905 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Lyz2P08905 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Lyz2P08905 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25,59■■□□□ 1,69
Lyz2P08905 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Lyz2P08905 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Lyz2P08905 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Lyz2P08905 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Lyz2P08905 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Lyz2P08905 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Lyz2P08905 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25,33■■□□□ 1,65
Lyz2P08905 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Lyz2P08905 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Lyz2P08905 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Lyz2P08905 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Lyz2P08905 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Lyz2P08905 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Lyz2P08905 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25,05■■□□□ 1,6
Lyz2P08905 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25,01■■□□□ 1,59
Lyz2P08905 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Lyz2P08905 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,94■■□□□ 1,58
Lyz2P08905 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24,89■■□□□ 1,57
Lyz2P08905 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24,84■■□□□ 1,57
Lyz2P08905 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Lyz2P08905 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Lyz2P08905 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24,8■■□□□ 1,56
Lyz2P08905 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Lyz2P08905 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Lyz2P08905 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Lyz2P08905 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24,48■■□□□ 1,51
Lyz2P08905 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Lyz2P08905 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Lyz2P08905 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24,3■■□□□ 1,48
Lyz2P08905 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Lyz2P08905 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
Lyz2P08905 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
Lyz2P08905 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
Lyz2P08905 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24,16■■□□□ 1,46
Lyz2P08905 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Lyz2P08905 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Lyz2P08905 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Lyz2P08905 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24,07■■□□□ 1,44
Lyz2P08905 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,06■■□□□ 1,44
Lyz2P08905 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Lyz2P08905 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Lyz2P08905 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,03■■□□□ 1,44
Lyz2P08905 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,02■■□□□ 1,44
Lyz2P08905 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
Lyz2P08905 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23,95■■□□□ 1,42
Lyz2P08905 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
Lyz2P08905 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,41
Lyz2P08905 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23,87■■□□□ 1,41
Lyz2P08905 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
Lyz2P08905 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Lyz2P08905 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Lyz2P08905 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23,77■■□□□ 1,4
Lyz2P08905 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Lyz2P08905 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Lyz2P08905 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Lyz2P08905 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Lyz2P08905 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23,66■■□□□ 1,38
Lyz2P08905 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,38
Lyz2P08905 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Lyz2P08905 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Lyz2P08905 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,6■■□□□ 1,37
Lyz2P08905 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Lyz2P08905 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Lyz2P08905 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23,56■■□□□ 1,36
Lyz2P08905 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Lyz2P08905 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,52■■□□□ 1,36
Lyz2P08905 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Lyz2P08905 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Lyz2P08905 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Lyz2P08905 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23,49■■□□□ 1,35
Lyz2P08905 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Lyz2P08905 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Lyz2P08905 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16,9 ms