Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Ifna9P09235 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ifna9P09235 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ifna9P09235 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ifna9P09235 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Ifna9P09235 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ifna9P09235 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ifna9P09235 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ifna9P09235 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ifna9P09235 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ifna9P09235 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Ifna9P09235 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ifna9P09235 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ifna9P09235 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ifna9P09235 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ifna9P09235 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ifna9P09235 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ifna9P09235 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ifna9P09235 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ifna9P09235 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ifna9P09235 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ifna9P09235 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ifna9P09235 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ifna9P09235 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ifna9P09235 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ifna9P09235 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ifna9P09235 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ifna9P09235 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ifna9P09235 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ifna9P09235 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ifna9P09235 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ifna9P09235 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ifna9P09235 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ifna9P09235 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ifna9P09235 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ifna9P09235 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ifna9P09235 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ifna9P09235 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ifna9P09235 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ifna9P09235 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ifna9P09235 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ifna9P09235 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ifna9P09235 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ifna9P09235 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ifna9P09235 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ifna9P09235 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ifna9P09235 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ifna9P09235 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ifna9P09235 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ifna9P09235 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ifna9P09235 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ifna9P09235 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ifna9P09235 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ifna9P09235 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ifna9P09235 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ifna9P09235 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ifna9P09235 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ifna9P09235 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ifna9P09235 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ifna9P09235 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ifna9P09235 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ifna9P09235 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ifna9P09235 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ifna9P09235 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ifna9P09235 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ifna9P09235 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ifna9P09235 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ifna9P09235 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ifna9P09235 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ifna9P09235 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ifna9P09235 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ifna9P09235 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ifna9P09235 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ifna9P09235 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ifna9P09235 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ifna9P09235 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ifna9P09235 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ifna9P09235 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ifna9P09235 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ifna9P09235 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ifna9P09235 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ifna9P09235 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ifna9P09235 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ifna9P09235 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ifna9P09235 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ifna9P09235 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ifna9P09235 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ifna9P09235 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ifna9P09235 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ifna9P09235 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ifna9P09235 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ifna9P09235 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ifna9P09235 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifna9P09235 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifna9P09235 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ifna9P09235 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ifna9P09235 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ifna9P09235 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifna9P09235 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ifna9P09235 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.9 ms