RNA–Protein interactions for RNA: YOL073C

DSC2, Transcript of Multi-transmembrane subunit of the DSC ubiquitin ligase complex, yeast

Gene DSC2, Length 969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSC2	YOL073C	MGS1	P40151	587 aa		5.92	□□□□□ -1.46
DSC2	YOL073C	CTR1	P49573	406 aa		5.92	□□□□□ -1.46
DSC2	YOL073C	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
DSC2	YOL073C	DCS2	Q12123	353 aa		5.92	□□□□□ -1.46
DSC2	YOL073C	SEC15	P22224	910 aa		5.91	□□□□□ -1.46
DSC2	YOL073C	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
DSC2	YOL073C	PAF1	P38351	445 aa		5.91	□□□□□ -1.46
DSC2	YOL073C	TDA3	P38758	523 aa		5.91	□□□□□ -1.46
DSC2	YOL073C	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
DSC2	YOL073C	DNM1	P54861	757 aa		5.91	□□□□□ -1.46
DSC2	YOL073C	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
DSC2	YOL073C	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
DSC2	YOL073C	GLG1	P36143	616 aa		5.9	□□□□□ -1.46
DSC2	YOL073C	PIG2	P40187	538 aa		5.9	□□□□□ -1.46
DSC2	YOL073C	FHN1	P53279	174 aa		5.9	□□□□□ -1.46
DSC2	YOL073C	ATG4	P53867	494 aa		5.9	□□□□□ -1.46
DSC2	YOL073C	VHS3	Q08438	674 aa		5.9	□□□□□ -1.46
DSC2	YOL073C	MLH3	Q12083	715 aa		5.9	□□□□□ -1.46
DSC2	YOL073C	USV1	Q12132	391 aa		5.9	□□□□□ -1.46
DSC2	YOL073C	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.9	□□□□□ -1.46	not detected
DSC2	YOL073C	PSK1	P31374	1356 aa		5.9	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	SPT7	P35177	1332 aa		5.89	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	RAV1	P47104	1357 aa		5.89	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	PPZ2	P33329	710 aa		5.88	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	CKB2	P38930	258 aa		5.88	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	YMR210W	Q03649	449 aa		5.88	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	THI22	Q06490	572 aa		5.88	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	ABF1	P14164	731 aa		5.87	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	BCS1	P32839	456 aa		5.87	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	BIT2	P38346	545 aa		5.87	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	BDH2	P39713	417 aa		5.87	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	YIL166C	P40445	542 aa		5.87	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	RET2	P43621	546 aa		5.87	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	TAH11	P47112	604 aa		5.87	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	THI73	Q07904	523 aa		5.87	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		5.87	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	RSF2	P46974	1380 aa		5.86	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	PRP28	P23394	588 aa		5.86	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	YJR096W	P47137	282 aa		5.86	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	TAF3	Q12297	353 aa		5.86	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	POM34	Q12445	299 aa		5.86	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	NUP145	P49687	1317 aa		5.85	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.85	□□□□□ -1.47	not detected
DSC2	YOL073C	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	PET127	P32606	800 aa		5.85	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	ATF1	P40353	525 aa		5.85	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	DOT5	P40553	215 aa		5.85	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	YGR153W	P48238	217 aa		5.85	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	VPS36	Q06696	566 aa		5.85	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	SUT2	Q12286	268 aa		5.85	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	SPO11	P23179	398 aa		5.84	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	KIN82	P25341	720 aa		5.84	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	BEM4	P39011	633 aa		5.84	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	YIL077C	P40508	320 aa		5.84	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	YJR142W	P47173	342 aa		5.84	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	PMT3	P47190	753 aa		5.84	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	YLR407W	Q06070	228 aa		5.84	□□□□□ -1.47
DSC2	YOL073C	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
DSC2	YOL073C	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
DSC2	YOL073C	NPR2	P39923	615 aa		5.83	□□□□□ -1.48
DSC2	YOL073C	YGR151C	P53287	111 aa		5.83	□□□□□ -1.48
DSC2	YOL073C	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
DSC2	YOL073C	FUB1	P25659	250 aa		5.82	□□□□□ -1.48
DSC2	YOL073C	NTH1	P32356	751 aa		5.82	□□□□□ -1.48
DSC2	YOL073C	PEX2	P32800	271 aa		5.82	□□□□□ -1.48
DSC2	YOL073C	YKU70	P32807	602 aa		5.82	□□□□□ -1.48
DSC2	YOL073C	SET3	P36124	751 aa		5.82	□□□□□ -1.48
DSC2	YOL073C	GMH1	P36125	273 aa		5.82	□□□□□ -1.48
DSC2	YOL073C	BIT61	P47041	543 aa		5.82	□□□□□ -1.48
DSC2	YOL073C	MPS3	P47069	682 aa		5.82	□□□□□ -1.48
DSC2	YOL073C	RFX1	P48743	811 aa		5.82	□□□□□ -1.48
DSC2	YOL073C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
DSC2	YOL073C	YML122C	Q03207	126 aa		5.82	□□□□□ -1.48
DSC2	YOL073C	YDL086W	Q07505	273 aa		5.82	□□□□□ -1.48
DSC2	YOL073C	RTC1	Q08281	1341 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DSC2	YOL073C	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
DSC2	YOL073C	KCC4	P25389	1037 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DSC2	YOL073C	COS111	P38308	924 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DSC2	YOL073C	SPC98	P53540	846 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DSC2	YOL073C	UME1	Q03010	460 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DSC2	YOL073C	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
DSC2	YOL073C	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DSC2	YOL073C	TY4B-J	P47024	1803 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DSC2	YOL073C	FKS3	Q04952	1785 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DSC2	YOL073C	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
DSC2	YOL073C	RPN13	O13563	156 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DSC2	YOL073C	YPT53	P36019	220 aa		5.8	□□□□□ -1.48

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