RNA–Protein interactions for RNA: YML035C

AMD1, Transcript of AMP deaminase, yeast

Gene AMD1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AMD1	YML035C	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	RNT1	Q02555	471 aa		5.98	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	YDR278C	Q05612	105 aa		5.98	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	NUR1	Q12066	484 aa		5.98	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	EMP46	Q12396	444 aa		5.98	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	5.97	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	IDI1	P15496	288 aa		5.97	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	PCA1	P38360	1216 aa		5.97	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	LYS9	P38999	446 aa		5.97	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	ERP2	P39704	215 aa		5.97	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	DSN1	P40568	576 aa		5.97	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	INP52	P50942	1183 aa		5.97	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	PNG1	Q02890	363 aa		5.97	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	PRM6	Q04705	352 aa		5.97	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	TAF9	Q05027	157 aa		5.97	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	5.97	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	5.97	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	CDC8	P00572	216 aa		5.97	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	PRC1	P00729	532 aa		5.97	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	HIP1	P06775	603 aa		5.97	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	PGS1	P25578	521 aa		5.97	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	MED8	P38304	223 aa		5.97	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	STB5	P38699	743 aa		5.97	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	FHL1	P39521	936 aa		5.97	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	ARG2	P40360	574 aa		5.97	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	YJR079W	P47126	109 aa		5.97	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	RIM8	P53179	542 aa		5.97	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	CDC55	Q00362	526 aa		5.97	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	HEH2	Q03281	663 aa		5.97	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	YDL073W	Q07454	984 aa		5.97	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	NBP2	Q12163	236 aa		5.97	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	RGR1	P19263	1082 aa		5.96	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	DSS4	P32601	143 aa		5.96	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	YIL054W	P40524	105 aa		5.96	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	VPS25	P47142	202 aa		5.96	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	AIM32	Q04689	311 aa		5.96	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	THI7	Q05998	598 aa		5.96	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	FMP25	Q08023	583 aa		5.96	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	YRR1	Q12172	810 aa		5.96	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	HRT3	Q12347	344 aa		5.96	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	NFU1	P32860	256 aa		5.96	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	GCS1	P35197	352 aa		5.96	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	FMP10	P40098	244 aa		5.96	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	KHA1	P40309	873 aa		5.96	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	GUF1	P46943	645 aa		5.96	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	PEX31	P53203	462 aa		5.96	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	DDC1	Q08949	612 aa		5.96	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	RAD27	P26793	382 aa		5.95	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	GPI10	P30777	616 aa		5.95	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	HSL7	P38274	827 aa		5.95	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	5.95	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	5.95	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	5.95	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	THI20	Q08224	551 aa		5.95	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	MNL2	Q12205	849 aa		5.95	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	AHC1	Q12433	566 aa		5.95	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	RAD10	P06838	210 aa		5.95	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	YBR053C	P38235	358 aa		5.95	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	SAF1	P38352	637 aa		5.95	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	SAP185	P40856	1058 aa		5.95	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	CDC1	P40986	491 aa		5.95	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	YNL320W	P42840	284 aa		5.95	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	YML6	P51998	286 aa		5.95	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	SPO71	Q03868	1245 aa		5.95	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	HRD3	Q05787	833 aa		5.95	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	YDR018C	Q12185	396 aa		5.95	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	CDC27	P38042	758 aa		5.94	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	YMR134W	P40207	237 aa		5.94	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	PRK1	P40494	810 aa		5.94	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	HLJ1	P48353	224 aa		5.94	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	SND1	Q04007	877 aa		5.94	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	THI21	Q08975	551 aa		5.94	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	MAS1	P10507	462 aa		5.94	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	URK1	P27515	501 aa		5.94	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	YKR051W	P36142	418 aa		5.94	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.94	□□□□□ -1.46	not detected
AMD1	YML035C	SIF2	P38262	535 aa		5.94	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	MSG5	P38590	489 aa		5.94	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	SSP1	P38871	571 aa		5.94	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	AVT2	P39981	480 aa		5.94	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	NMD5	P46970	1048 aa		5.94	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	YJL045W	P47052	634 aa		5.94	□□□□□ -1.46

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