RNA–Protein interactions for RNA: YKL163W

PIR3, Transcript of O-glycosylated covalently-bound cell wall protein, yeastyeast

Gene PIR3, Length 978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PIR3YKL163W BNA1P47096 177 aa4.57□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W GTF1P53260 183 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W BTN2P53286 410 aa4.57□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W MEP3P53390 489 aa4.57□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W GSF2Q04697 403 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W YLR287CQ05881 355 aa4.57□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W TMA10Q06177 86 aa4.57□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W PEX15Q08215 383 aa4.57□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W RPL11BQ3E757 174 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W CDC6P09119 513 aa4.56□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W KIN2P13186 1147 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W FRD1P32614 470 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W PCM1P38628 557 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W YGR153WP48238 217 aa4.56□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W GCV2P49095 1034 aa4.56□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W YGR016WP53209 190 aa4.56□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W RBG2P53295 368 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W TRM44Q02648 567 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W SKY1Q03656 742 aa4.56□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W ACK1Q07622 623 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W ALE1Q08548 619 aa4.56□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W GPB1Q08886 897 aa4.56□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W TAH18Q12181 623 aa4.56□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W BI4P03879 638 aa4.55□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W SES1P07284 462 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W CMK1P27466 446 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W PET309P32522 965 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W LST4P34239 828 aa4.55□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W UBS1P38290 277 aa4.55□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W GUS1P46655 708 aaKnown RBP RIP-Chip data4.55□□□□□ -1.68not detected
PIR3YKL163W YML6P51998 286 aa4.55□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W VPS4P52917 437 aa4.55□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W ZIP2P53061 704 aa4.55□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W DAM1P53267 343 aa4.55□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W YGR117CP53270 476 aa4.55□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W CNM67P53865 581 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W LCD1Q04377 747 aa4.55□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W RXT3Q07458 294 aa4.55□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W GNT1Q12096 491 aa4.55□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W HSH49Q99181 213 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W HPR1P17629 752 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W SEC18P18759 758 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W ACE2P21192 770 aa4.54□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W HOG1P32485 435 aa4.54□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W XRS2P33301 854 aa4.54□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W RKM3P38222 552 aa4.54□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W RXT2P38255 430 aa4.54□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W SRP72P38688 640 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W PES4P39684 611 aa4.54□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W NOP16P40007 231 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W ERR3P42222 437 aa4.54□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W MRPL19P53875 158 aa4.54□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W UBP16Q02863 499 aa4.54□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W ATG33Q06485 197 aa4.54□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W YPR027CQ12079 277 aa4.54□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W RRG1Q12167 365 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W YPL066WQ12194 479 aa4.54□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W YOL114CQ12322 202 aa4.54□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W KCS1Q12494 1050 aa4.54□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W CSR2Q12734 1121 aa4.54□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W SMC6Q12749 1114 aa4.54□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W TY1B-AO13527 1196 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W SAN1P22470 610 aa4.53□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W DAL3P32459 195 aa4.53□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W NGG1P32494 702 aa4.53□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W RPT3P33298 428 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W SLA2P33338 968 aa4.53□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W YRO2P38079 344 aa4.53□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W AKL1P38080 1108 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W TDA3P38758 523 aa4.53□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W RPN10P38886 268 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W PNT1P38969 423 aa4.53□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W MEP1P40260 492 aa4.53□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W CCT5P40413 562 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W HFM1P51979 1187 aa4.53□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W MCM6P53091 1017 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W TEP1P53916 434 aa4.53□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W PTA1Q01329 785 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W PKH1Q03407 766 aa4.53□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W MSC2Q03455 724 aa4.53□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W YAP6Q03935 383 aa4.53□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W YDR514CQ04408 483 aa4.53□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W TDA9Q04545 1251 aa4.53□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W EIS1Q05050 843 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W DUS3Q06053 668 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W SPP382Q06411 708 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W RSC3Q06639 885 aa4.53□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W YCG1Q06680 1035 aa4.53□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W GUP2Q08929 609 aa4.53□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W ACM1Q08981 209 aa4.53□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W HSP42Q12329 375 aa4.53□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W PNS1Q12412 539 aa4.53□□□□□ -1.68
PIR3YKL163W SPO16P17122 198 aa4.52□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W HCA4P20448 770 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W EMC1P25574 760 aa4.52□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W AAD3P25612 363 aa4.52□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W RAD16P31244 790 aa4.52□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W DBF4P32325 704 aa4.52□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W ECM32P32644 1121 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W REC104P33323 182 aa4.52□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.3 ms