RNA–Protein interactions for RNA: YBL048W

RRT1, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene RRT1, Length 312 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRT1	YBL048W	RSC9	Q03124	581 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RRT1	YBL048W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RRT1	YBL048W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRT1	YBL048W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RRT1	YBL048W	CNE1	P27825	502 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRT1	YBL048W	YKU70	P32807	602 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRT1	YBL048W	PXL1	P36166	706 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRT1	YBL048W	APD1	P38281	316 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRT1	YBL048W	SPC97	P38863	823 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRT1	YBL048W	BST1	P43571	1029 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRT1	YBL048W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RRT1	YBL048W	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRT1	YBL048W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRT1	YBL048W	SFL1	P20134	766 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRT1	YBL048W	ASK1	P35734	292 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRT1	YBL048W	MAL31	P38156	614 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRT1	YBL048W	TMN3	P40071	706 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRT1	YBL048W	PCI8	P40512	444 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRT1	YBL048W	SNO3	P43544	222 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRT1	YBL048W	YIP4	P53093	235 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRT1	YBL048W	COQ6	P53318	479 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRT1	YBL048W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RRT1	YBL048W	TSR4	P25040	408 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RRT1	YBL048W	MRPL9	P31334	269 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RRT1	YBL048W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.08	□□□□□ -1.76	not detected
RRT1	YBL048W	NUP82	P40368	713 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RRT1	YBL048W	BUD8	P41698	603 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RRT1	YBL048W	FDC1	Q03034	503 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RRT1	YBL048W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RRT1	YBL048W	YDL073W	Q07454	984 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RRT1	YBL048W	MRPL7	P36519	292 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RRT1	YBL048W	EXO1	P39875	702 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RRT1	YBL048W	MNT3	P40549	630 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RRT1	YBL048W	PXA1	P41909	870 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RRT1	YBL048W	YMR210W	Q03649	449 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RRT1	YBL048W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RRT1	YBL048W	YLR407W	Q06070	228 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RRT1	YBL048W	YPS7	Q06325	596 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RRT1	YBL048W	YLR125W	Q12138	136 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RRT1	YBL048W	WHI2	P12611	486 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RRT1	YBL048W	YKR075C	P36155	307 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RRT1	YBL048W	PPE1	P38796	400 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RRT1	YBL048W	SPO1	P53541	631 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RRT1	YBL048W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RRT1	YBL048W	PHO8	P11491	566 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRT1	YBL048W	GSY2	P27472	705 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRT1	YBL048W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RRT1	YBL048W	JHD1	P40034	492 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRT1	YBL048W	BSP1	Q06604	576 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRT1	YBL048W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RRT1	YBL048W	YJL043W	P47053	257 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RRT1	YBL048W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
RRT1	YBL048W	BUD17	P53727	317 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RRT1	YBL048W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
RRT1	YBL048W	MFM1	Q02783	413 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RRT1	YBL048W	PPN1	Q04119	674 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RRT1	YBL048W	HLR1	Q04429	423 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RRT1	YBL048W	STP4	Q07351	490 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RRT1	YBL048W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.03	□□□□□ -1.76	not detected
RRT1	YBL048W	PRE4	P30657	266 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RRT1	YBL048W	YFL015C	P43578	164 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RRT1	YBL048W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
RRT1	YBL048W	YLR001C	Q07895	862 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RRT1	YBL048W	CRC1	Q12289	327 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RRT1	YBL048W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
RRT1	YBL048W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RRT1	YBL048W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RRT1	YBL048W	CDS1	P38221	457 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RRT1	YBL048W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.02	□□□□□ -1.77	not detected
RRT1	YBL048W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RRT1	YBL048W	FTR1	P40088	404 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RRT1	YBL048W	MET13	P53128	600 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RRT1	YBL048W	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RRT1	YBL048W	SWI6	P09959	803 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RRT1	YBL048W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
RRT1	YBL048W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
RRT1	YBL048W	YPR089W	O13585	888 aa		4	□□□□□ -1.77
RRT1	YBL048W	HOP1	P20050	605 aa		4	□□□□□ -1.77
RRT1	YBL048W	THI4	P32318	326 aa		4	□□□□□ -1.77
RRT1	YBL048W	YPT10	P38146	199 aa		4	□□□□□ -1.77
RRT1	YBL048W	OPT1	P40897	799 aa		4	□□□□□ -1.77
RRT1	YBL048W	TDA10	P42938	290 aa		4	□□□□□ -1.77
RRT1	YBL048W	TIM50	Q02776	476 aa		4	□□□□□ -1.77
RRT1	YBL048W	NUP53	Q03790	475 aa		4	□□□□□ -1.77
RRT1	YBL048W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
RRT1	YBL048W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
RRT1	YBL048W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RRT1	YBL048W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RRT1	YBL048W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RRT1	YBL048W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RRT1	YBL048W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RRT1	YBL048W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
RRT1	YBL048W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
RRT1	YBL048W	SAP4	P53036	818 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RRT1	YBL048W	GUD1	Q07729	489 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RRT1	YBL048W	NTG2	Q08214	380 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RRT1	YBL048W	TGS1	Q12052	315 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RRT1	YBL048W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
RRT1	YBL048W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
RRT1	YBL048W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77

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