RNA–Protein interactions for RNA: Q0055

AI2, Reverse transcriptase required for splicing of the COX1 pre-mRNA, yeast

Gene AI2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI2	Q0055	SNF12	P53628	566 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	HIM1	Q06674	414 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	NUR1	Q12066	484 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	RTN2	Q12443	393 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	ARG3	P05150	338 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	PPH3	P32345	308 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	MET28	P40573	187 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	IML2	P47031	731 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	TCB2	P48231	1178 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	INN1	P53901	409 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	JIP3	O13555	125 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	PMS1	P14242	873 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	ACE2	P21192	770 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	SEC65	P29478	273 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	NGG1	P32494	702 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	TGL1	P34163	548 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	YKL100C	P34248	587 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	SIF2	P38262	535 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	LYS9	P38999	446 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	RAD26	P40352	1085 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	SEC9	P40357	651 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	JEM1	P40358	645 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	VPS53	P47061	822 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	PEF1	P53238	335 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	DAM1	P53267	343 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	BTN2	P53286	410 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	YML119W	Q03208	357 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	TAH18	Q12181	623 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	SUL2	Q12325	893 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	ENA1	P13587	1091 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	MRP20	P32387	263 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	MIC60	P36112	540 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	THI2	P38141	450 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	HSL7	P38274	827 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	POL31	P46957	487 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	YGR045C	P53229	120 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	ENA2	Q01896	1091 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	YPL107W	Q02873	248 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	ESC8	Q08119	714 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	ENA5	Q12691	1091 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	YLR464W	P0CX17	216 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	CNS1	P33313	385 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	SAS3	P34218	831 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	MCM7	P38132	845 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	YEL076C	P39971	216 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	SMK1	P41808	388 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	GCV1	P48015	400 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	GUP1	P53154	560 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	RPN14	P53196	417 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	YNR068C	P53754	272 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	ACS1	Q01574	713 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	MRPL13	Q02204	264 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	YAP6	Q03935	383 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	VAM6	Q07468	1049 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	ACM1	Q08981	209 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	ICL2	Q12031	575 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	SFG1	Q12507	346 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	PTC5	Q12511	572 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	SAM35	P14693	329 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	ERS1	P17261	260 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	BET2	P20133	325 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	ARG1	P22768	420 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	STE50	P25344	346 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	FUN30	P31380	1131 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	YRO2	P38079	344 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	EHT1	P38295	451 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	MET18	P40469	1032 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	BUD8	P41698	603 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	TOF1	P53840	1238 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92

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