RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422596.1

TRDN-203, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 3

Gene TRDN, Length 776 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-203ENST00000422596 LATS2Q9NRM7 1088 aa6.73□□□□□ -1.33
TRDN-203ENST00000422596 BICRAQ9NZM4 1560 aa6.73□□□□□ -1.33
TRDN-203ENST00000422596 TGFB1P01137 390 aa6.72□□□□□ -1.33
TRDN-203ENST00000422596 VN1R5Q7Z5H4 357 aa6.72□□□□□ -1.33
TRDN-203ENST00000422596 SLC51AQ86UW1 340 aa6.72□□□□□ -1.33
TRDN-203ENST00000422596 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
TRDN-203ENST00000422596 WNT8BQ93098 351 aa6.72□□□□□ -1.33
TRDN-203ENST00000422596 MYRFLQ96LU7 910 aa6.72□□□□□ -1.33
TRDN-203ENST00000422596 EHD4Q9H223 541 aa6.72□□□□□ -1.33
TRDN-203ENST00000422596 OSGEPQ9NPF4 335 aa6.72□□□□□ -1.33
TRDN-203ENST00000422596 PCMTD2Q9NV79 361 aa6.72□□□□□ -1.33
TRDN-203ENST00000422596 PPP4R2Q9NY27 417 aa6.72□□□□□ -1.33
TRDN-203ENST00000422596 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.71□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 PREPP48147 710 aa6.71□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 CD97P48960 835 aa6.71□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 UVSSAQ2YD98 709 aa6.71□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 SETDB2Q96T68 719 aa6.71□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 TRAK1Q9UPV9 953 aa6.71□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 SPG7Q9UQ90 795 aa6.71□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 C19orf57Q0VDD7 668 aa6.7□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 NFIAQ12857 509 aa6.7□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa6.7□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 CCNJLQ8IV13 435 aa6.7□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 FAM20CQ8IXL6 584 aa6.7□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 GIPC2Q8TF65 315 aa6.7□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 BSNDQ8WZ55 320 aa6.7□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 TCF12Q99081 682 aa6.7□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 RUSC1Q9BVN2 902 aa6.7□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa6.7□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 LIN7BQ9HAP6 207 aa6.7□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 METTL12A8MUP2 240 aa6.69□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 SART1O43290 800 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 BMP3P12645 472 aa6.69□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 GNA15P30679 374 aa6.69□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 ITGAEP38570 1179 aa6.69□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 IKBKEQ14164 716 aa6.69□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 RNF43Q68DV7 783 aa6.69□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 PI16Q6UXB8 463 aa6.69□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 ASAP3Q8TDY4 903 aa6.69□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 BCO2Q9BYV7 579 aa6.69□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 RNF208Q9H0X6 261 aa6.69□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 PARP2Q9UGN5 583 aa6.69□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 GSC2O15499 205 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 DLGAP3O95886 979 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 DAB2P98082 770 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 GRM2Q14416 872 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 ANKRD34AQ69YU3 496 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 BEND4Q6ZU67 534 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 GLIS3Q8NEA6 775 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 FAM83CQ9BQN1 747 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 BCL11AQ9H165 835 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 KCNF1Q9H3M0 494 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 AK5Q9Y6K8 562 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 A0A096LPE4 126 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 A0A1W2PPZ6 126 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 PRR19A6NJB7 356 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 ARL4DP49703 201 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 FDX2Q6P4F2 183 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 NXPE4Q6UWF7 544 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 TMC4Q7Z404 712 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 CLEC10AQ8IUN9 316 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 OSBPL7Q9BZF2 842 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 MEGF11A6BM72 1044 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 COBLO75128 1261 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 ADAMTS4O75173 837 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 ITPKAP23677 461 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 GRIA4P48058 902 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 DBNDD2Q9BQY9 259 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 USP26Q9BXU7 913 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 C12orf49Q9H741 205 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa6.65□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 PSMD2Q13200 908 aa6.65□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 SGO2Q562F6 1265 aa6.65□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 SHKBP1Q8TBC3 707 aa6.65□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa6.65□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 ABCB6Q9NP58 842 aa6.65□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 RNF19AQ9NV58 838 aa6.65□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 FAM8A1Q9UBU6 413 aa6.65□□□□□ -1.34
TRDN-203ENST00000422596 SORBS3O60504 671 aa6.64□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 DRD2P14416 443 aa6.64□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 GSTT1P30711 240 aa6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms