RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063116.9

Msx1-201, Transcript of Homeobox protein MSX-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Msx1, Length 1,935 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gdf11Q9Z1W4 405 aa23.17■■□□□ 1.3
Msx1-201ENSMUST00000063116 Scn9aQ62205 1984 aa23.17■■□□□ 1.3
Msx1-201ENSMUST00000063116 Lipo1J3QME6 396 aa23.16■■□□□ 1.3
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mcm4P49717 862 aa23.16■■□□□ 1.3
Msx1-201ENSMUST00000063116 Spg7Q3ULF4 781 aa23.16■■□□□ 1.3
Msx1-201ENSMUST00000063116 Bms1Q6PGF5 1284 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
Msx1-201ENSMUST00000063116 Pla2g12bQ99P27 195 aa23.16■■□□□ 1.3
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tbc1d8Q9Z1A9 1134 aa23.16■■□□□ 1.3
Msx1-201ENSMUST00000063116 Nrxn2E9Q7X7 1710 aa23.16■■□□□ 1.3
Msx1-201ENSMUST00000063116 Vmn2r23E9PXI5 849 aa23.16■■□□□ 1.3
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tmem59lQ7TNI2 337 aa23.16■■□□□ 1.3
Msx1-201ENSMUST00000063116 Slc44a4Q91VA1 707 aa23.16■■□□□ 1.3
Msx1-201ENSMUST00000063116 RarsQ9D0I9 660 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
Msx1-201ENSMUST00000063116 Aox3G3X982 1335 aa23.15■■□□□ 1.3
Msx1-201ENSMUST00000063116 Znf638Q61464 1960 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
Msx1-201ENSMUST00000063116 Glg1Q61543 1175 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
Msx1-201ENSMUST00000063116 Q8C6G1 249 aa23.15■■□□□ 1.3
Msx1-201ENSMUST00000063116 DpydQ8CHR6 1025 aa23.15■■□□□ 1.3
Msx1-201ENSMUST00000063116 Zbtb43Q9DAI4 467 aa23.15■■□□□ 1.3
Msx1-201ENSMUST00000063116 Sil1Q9EPK6 465 aa23.15■■□□□ 1.3
Msx1-201ENSMUST00000063116 Pnpla6Q3TRM4 1355 aa23.15■■□□□ 1.3
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cdcp1Q5U462 833 aa23.14■■□□□ 1.3
Msx1-201ENSMUST00000063116 Agtpbp1Q641K1 1218 aa23.14■■□□□ 1.3
Msx1-201ENSMUST00000063116 Nol12Q8BG17 217 aa23.14■■□□□ 1.3
Msx1-201ENSMUST00000063116 Aox1O54754 1333 aa23.14■■□□□ 1.3
Msx1-201ENSMUST00000063116 Prdm1Q60636 856 aa23.14■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Me3Q8BMF3 604 aa23.14■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Uba5Q8VE47 403 aa23.14■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 CpdO89001 1377 aa23.13■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Med23Q80YQ2 1367 aa23.13■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm3893E9Q1I1 302 aa23.13■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ezh2Q61188 746 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Fam170aQ66LM6 333 aa23.13■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Nxf7Q80SZ6 620 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cep55Q8BT07 462 aa23.13■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 MlphQ91V27 590 aa23.13■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Pes1Q9EQ61 584 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Dock5B2RY04 1868 aa23.13■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Prss40A6H6T1 365 aa23.12■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Csrnp1P59054 583 aa23.12■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cct2P80314 535 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Usp48Q3V0C5 1052 aa23.12■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Smarcc2Q6PDG5 1213 aa23.12■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Bloc1s2Q9CWG9 143 aa23.12■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 HelbQ6NVF4 1074 aa23.12■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Fsd2Q8BZ52 692 aa23.12■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 WaslQ91YD9 501 aa23.12■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Bap1Q99PU7 728 aa23.12■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Epb41l3Q9WV92 929 aa23.12■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Zfp831A2ADM8 1628 aa23.12■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Btaf1E9QAE3 1848 aa23.11■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Zswim8Q3UHH1 1832 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Dennd3A2RT67 1274 aa23.11■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cd3dP04235 173 aa23.11■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Chrna5Q2MKA5 467 aa23.11■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Q3TYL0 343 aa23.11■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Esyt2Q3TZZ7 845 aa23.11■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ccdc174Q3U155 467 aa23.11■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Kif22Q3V300 660 aa23.11■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 ErfeQ6PGN1 340 aa23.11■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 DekQ7TNV0 380 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tmem179Q8BHH9 233 aa23.11■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Zfp113Q8C689 439 aa23.11■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Odf2lQ9D478 642 aa23.11■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Itgb4A2A863 1818 aa23.11■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 AfdnQ9QZQ1 1820 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Frmpd3A0A140LIW3 1774 aa23.11■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Pet2A2AHY8 747 aa23.1■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Pde6aP27664 859 aa23.1■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Spata5Q3UMC0 893 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Alg3Q8K2A8 438 aa23.1■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Trmt44Q9D2Q2 713 aa23.1■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Stag1Q9D3E6 1258 aa23.1■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Myh6Q02566 1938 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 PnnO35691 725 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Iffo2Q8R2V2 512 aa23.1■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cep57l1Q8VDS7 400 aa23.1■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tsc2Q61037 1814 aa23.09■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Spryd3E9Q9B3 442 aa23.09■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Pde11aP0C1Q2 933 aa23.09■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Fsd1Q7TPM6 496 aa23.09■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Krt84Q99M73 603 aa23.09■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Efcc1Q9JJF6 558 aa23.09■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ccdc85cE9Q6B2 420 aa23.08■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Olfr118Q7TRJ6 321 aa23.08■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ttc12Q8BW49 704 aa23.08■■□□□ 1.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Col20a1Q923P0 1320 aa23.08■■□□□ 1.28
Msx1-201ENSMUST00000063116 Znf326O88291 580 aa23.08■■□□□ 1.28
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gas1Q01721 343 aa23.08■■□□□ 1.28
Msx1-201ENSMUST00000063116 Slc44a1Q6X893 653 aa23.08■■□□□ 1.28
Msx1-201ENSMUST00000063116 Golgb1E9PVZ8 3238 aa23.07■■□□□ 1.28
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rgs9O54828 675 aa23.07■■□□□ 1.28
Msx1-201ENSMUST00000063116 Limch1Q3UH68 1057 aa23.07■■□□□ 1.28
Msx1-201ENSMUST00000063116 Adck5Q80V03 582 aa23.07■■□□□ 1.28
Msx1-201ENSMUST00000063116 WdpcpQ8C456 722 aa23.07■■□□□ 1.28
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rufy2Q8R4C2 606 aa23.07■■□□□ 1.28
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cyp2ab1S4R196 498 aa23.07■■□□□ 1.28
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ppfia3P60469 1194 aa23.06■■□□□ 1.28
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mum1l1Q4VA55 681 aa23.06■■□□□ 1.28
Msx1-201ENSMUST00000063116 Leo1Q5XJE5 667 aa23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 41.2 ms