Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43.72■■■■■ 4.59
Pde6aP27664 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Pde6aP27664 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Pde6aP27664 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Pde6aP27664 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Pde6aP27664 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
Pde6aP27664 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Pde6aP27664 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
Pde6aP27664 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
Pde6aP27664 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Pde6aP27664 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Pde6aP27664 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
Pde6aP27664 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Pde6aP27664 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.76■■■■□ 3.47
Pde6aP27664 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Pde6aP27664 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
Pde6aP27664 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Pde6aP27664 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Pde6aP27664 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Pde6aP27664 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Pde6aP27664 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Pde6aP27664 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Pde6aP27664 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Pde6aP27664 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Pde6aP27664 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Pde6aP27664 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Pde6aP27664 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Pde6aP27664 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Pde6aP27664 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Pde6aP27664 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Pde6aP27664 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Pde6aP27664 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
Pde6aP27664 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Pde6aP27664 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Pde6aP27664 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Pde6aP27664 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Pde6aP27664 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Pde6aP27664 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Pde6aP27664 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Pde6aP27664 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Pde6aP27664 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Pde6aP27664 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Pde6aP27664 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Pde6aP27664 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Pde6aP27664 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Pde6aP27664 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Pde6aP27664 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Pde6aP27664 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Pde6aP27664 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Pde6aP27664 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Pde6aP27664 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Pde6aP27664 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Pde6aP27664 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Pde6aP27664 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Pde6aP27664 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Pde6aP27664 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Pde6aP27664 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Pde6aP27664 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Pde6aP27664 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Pde6aP27664 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Pde6aP27664 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
Pde6aP27664 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Pde6aP27664 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Pde6aP27664 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Pde6aP27664 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Pde6aP27664 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Pde6aP27664 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Pde6aP27664 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Pde6aP27664 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
Pde6aP27664 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Pde6aP27664 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Pde6aP27664 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Pde6aP27664 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Pde6aP27664 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Pde6aP27664 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Pde6aP27664 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Pde6aP27664 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Pde6aP27664 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Pde6aP27664 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Pde6aP27664 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Pde6aP27664 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Pde6aP27664 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Pde6aP27664 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Pde6aP27664 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Pde6aP27664 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Pde6aP27664 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Pde6aP27664 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Pde6aP27664 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Pde6aP27664 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Pde6aP27664 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Pde6aP27664 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Pde6aP27664 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Pde6aP27664 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Pde6aP27664 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Pde6aP27664 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Pde6aP27664 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Pde6aP27664 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Pde6aP27664 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Pde6aP27664 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Pde6aP27664 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.7 ms