RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 GNRHRP30968 328 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 RAG2P55895 527 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 BRWD1-AS2P59051 145 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 TSPAN5P62079 268 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 BAK1Q16611 211 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM95Q3KNT9 176 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 ABCA11PQ4W5N1 156 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 OR2B11Q5JQS5 317 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 VAX1Q5SQQ9 334 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 FAM71F2Q6NXP2 309 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 STEAP1BQ6NZ63 245 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 MFSD4AQ8N468 514 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 OR4C16Q8NGL9 310 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 OR2T10Q8NGZ9 312 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 LINC01006Q8NI28 216 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 MRGPRFQ96AM1 343 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 MOB3AQ96BX8 217 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF702PQ9H963 129 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM89A2RUT3 159 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 H7C2Y5 167 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 TAS2R19P59542 299 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 HERV-K104P61576 105 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 C11orf88Q6PI97 169 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 C5orf56Q8N8D9 126 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 Q8N9W7 124 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 DDB2Q92466 427 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 LINC01548A6NM66 108 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 TSPAN9O75954 239 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 PI3P19957 117 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 AWAT1Q58HT5 328 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 LIAT1Q6ZQX7 453 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 LHFPL1Q86WI0 220 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 BVESQ8NE79 360 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 AKIP1Q9NQ31 210 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 SLC35D1Q9NTN3 355 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 PTTG2Q9NZH5 202 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 RABL2BQ9UNT1 228 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 MOB4Q9Y3A3 225 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 NDUFA7O95182 113 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 IFNA6P05013 189 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 PPP5CP53041 499 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 RPL15P61313 204 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 MMDQ15546 238 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 PHLDA2Q53GA4 152 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 ACTBL2Q562R1 376 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 KCTD9Q7L273 389 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 RAB18Q9NP72 206 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 TPSG1Q9NRR2 321 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 SERTAD4Q9NUC0 356 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 WASHC3Q9Y3C0 194 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 RAMP3O60896 148 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 FCGR3BO75015 233 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 CRYZL1O95825 349 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 CSF1P09603 554 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 AKAIN1P0CW23 69 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 TBPP20226 339 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 MC5RP33032 325 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 THBS3P49746 956 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 KRTAP10-3P60369 221 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 C9orf152Q5JTZ5 239 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 C16orf82Q7Z2V1 217 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 ARRDC1Q8N5I2 433 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 OR51S1Q8NGJ8 323 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 OR4C13Q8NGP0 309 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 OR51H1Q8NH63 302 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 HSPB9Q9BQS6 159 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 FBXL15Q9H469 300 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 VWFP04275 2813 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 FCN1O00602 326 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 SLC22A5O76082 557 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 IGLV2-23P01705 113 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 APOA2P02652 100 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 RLN1P04808 185 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.265e-7■■■■□ 26.4
PDE4D-201ENST00000309641 RPS16P62249 146 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 Q8N2B8 174 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 GDPD1Q8N9F7 314 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 OR13C8Q8NGS7 320 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 OR4F5Q8NH21 305 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 TERB2Q8NHR7 220 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 MARCH1Q8TCQ1 289 aa7.2□□□□□ -1.26
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