RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 C5orf30Q96GV9 206 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 DLK1P80370 383 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 PSG7Q13046 419 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 ARV1Q9H2C2 271 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 C11orf1Q9H5F2 150 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 OR2W1Q9Y3N9 320 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 RNF115Q9Y4L5 304 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 KPTNQ9Y664 436 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 ZNF318Q5VUA4 2279 aa7.32□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 VDAC1P21796 283 aa7.32□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 NDUFA6P56556 154 aa7.32□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 RAB5BP61020 215 aa7.32□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 UBE2KP61086 200 aa7.32□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 ICAM4Q14773 271 aa7.32□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 ZNF726P1Q15940 193 aa7.32□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 ZNF585BQ52M93 769 aa7.32□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 LRTM2Q8N967 370 aa7.32□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 SPRY4Q9C004 299 aa7.32□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 IL36GQ9NZH8 169 aa7.32□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 CLDN1O95832 211 aa7.32□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 SELLP14151 372 aa7.32□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 IGHV1-2P23083 117 aa7.32□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 ECI1P42126 302 aa7.32□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 GLIPR1P48060 266 aa7.32□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 GNG3P63215 75 aa7.32□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 ID3Q02535 119 aa7.32□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 TMEM164Q5U3C3 297 aa7.32□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 ZNF429Q86V71 674 aa7.32□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 RPRMLQ8N4K4 120 aa7.32□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 LYPD6BQ8NI32 183 aa7.32□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 Q8WTZ3 238 aa7.32□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 TMEM56Q96MV1 263 aa7.32□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 OR2D2Q9H210 308 aa7.32□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 OR51I2Q9H344 312 aa7.32□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa7.32□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 ZGRF1Q86YA3 2104 aa7.32□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 MUC6Q6W4X9 2439 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 OR5H1A6NKK0 313 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 ST8SIA5O15466 376 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 OR8U8P0C7N1 319 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 UCP1P25874 307 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 GABRA2P47869 451 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 PPP1CBP62140 327 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 RTP5Q14D33 572 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 ZNF766Q5HY98 468 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 GCSAMLQ5JQS6 135 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 Q6P435 159 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 SPNS3Q6ZMD2 512 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 DRAM1Q8N682 238 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 SLC25A22Q9H936 323 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 RNF122Q9H9V4 155 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 PSENENQ9NZ42 101 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 DUSP13Q9UII6 198 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 IFNL4K9M1U5 179 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 DNPH1O43598 174 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 CLN5O75503 358 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 IGKV1D-33P01593 117 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 IGKV1-33P01594 117 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 SP9P0CG40 484 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 TUBG1P23258 451 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 RAB2AP61019 212 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 HLA-DRB3P79483 266 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 LRP11Q86VZ4 500 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 LILRB2Q8N423 598 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 FDCSPQ8NFU4 85 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 OR5A2Q8NGI9 324 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 C17orf98A8MV24 154 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 CYB5BO43169 146 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 SRP19P09132 144 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 UCP3P55916 312 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 PRSS8Q16651 343 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 FBXW9Q5XUX1 488 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 OR4C12Q96R67 309 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 IGF2RP11717 2491 aa7.3□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 TRAV20A0A0B4J274 112 aa7.3□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 C19orf67A6NJJ6 358 aa7.3□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 CEBPZOSA8MTT3 80 aa7.3□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 MLNRO43193 412 aa7.3□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 PITX3O75364 302 aa7.3□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 S1PR2O95136 353 aa7.3□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 HNF1AP20823 631 aa7.3□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 FGFRL1Q8N441 504 aa7.3□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 TMEM45BQ96B21 275 aa7.3□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa7.3□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 ZNRD1Q9P1U0 126 aa7.3□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 CACNA1BQ00975 2339 aa7.3□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms