RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453410.1

C9orf135-AS1-202, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf135-AS1, Length 975 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 H3BUX3 64 aa9.04□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RAB27BO00194 218 aa9.04□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CD36P16671 472 aa9.04□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MYL9P24844 172 aa9.04□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SSTR5P35346 364 aa9.04□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GLP1RP43220 463 aa9.04□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KIR2DS4P43632 304 aa9.04□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF137PP52743 207 aa9.04□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SCAND1P57086 179 aa9.04□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR10A3P58181 314 aa9.04□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ACTG1P63261 375 aa9.04□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HTD2P86397 168 aa9.04□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 P2RY14Q15391 338 aa9.04□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM189A2Q15884 450 aa9.04□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SSX2Q16385 188 aa9.04□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C6orf183Q5T699 404 aa9.04□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 Q6ZPA2 131 aa9.04□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF439Q8NDP4 499 aa9.04□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 YIPF6Q96EC8 236 aa9.04□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CYYR1Q96J86 154 aa9.04□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NEDD4LQ96PU5 975 aa9.04□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OCSTAMPQ9BR26 566 aa9.04□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NICN1Q9BSH3 213 aa9.04□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAAP24Q9BTP7 215 aa9.04□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF747Q9BV97 191 aa9.04□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MMP28Q9H239 520 aa9.04□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR51E2Q9H255 320 aa9.04□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RAB9BQ9NP90 201 aa9.04□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GFOD1Q9NXC2 390 aa9.04□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SSR3Q9UNL2 185 aa9.04□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRAV39A0A0B4J263 110 aa9.03□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BTBD17A6NE02 478 aa9.03□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SOCS1O15524 211 aa9.03□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CEACAM3P40198 252 aa9.03□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CLDN12P56749 244 aa9.03□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HMGN3Q15651 99 aa9.03□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PLAC9Q5JTB6 97 aa9.03□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 Q6ZSV7 163 aa9.03□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C6orf201Q7Z4U5 140 aa9.03□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 THNSL2Q86YJ6 484 aa9.03□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 Q8N2B8 174 aa9.03□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR56B1Q8NGI3 324 aa9.03□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR4F5Q8NH21 305 aa9.03□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LINC01006Q8NI28 216 aa9.03□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RFESDQ8TAC1 157 aa9.03□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ARL11Q969Q4 196 aa9.03□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa9.03□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KCTD7Q96MP8 289 aa9.03□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KCNK15Q9H427 330 aa9.03□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP9.03□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ING3Q9NXR8 418 aa9.03□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TCF19Q9Y242 345 aa9.03□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KCNK7Q9Y2U2 307 aa9.03□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa9.02□□□□□ -0.97
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 UBE2QL1A1L167 161 aa9.02□□□□□ -0.97
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CLPSL1A2RUU4 121 aa9.02□□□□□ -0.97
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TOR1AO14656 332 aa9.02□□□□□ -0.97
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SPINT2O43291 252 aa9.02□□□□□ -0.97
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GADD45AP24522 165 aa9.02□□□□□ -0.97
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PAX6P26367 422 aa9.02□□□□□ -0.97
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RAG2P55895 527 aa9.02□□□□□ -0.97
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PLA2G7Q13093 441 aa9.02□□□□□ -0.97
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NEDD8Q15843 81 aa9.02□□□□□ -0.97
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa9.02□□□□□ -0.97
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LCE2CQ5TA81 110 aa9.02□□□□□ -0.97
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C12orf54Q6X4T0 127 aa9.02□□□□□ -0.97
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DTX3Q8N9I9 347 aa9.02□□□□□ -0.97
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR4K15Q8NH41 348 aa9.02□□□□□ -0.97
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NEK7Q8TDX7 302 aa9.02□□□□□ -0.97
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CCDC107Q8WV48 283 aa9.02□□□□□ -0.97
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CENPOQ9BU64 300 aa9.02□□□□□ -0.97
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TOLLIPQ9H0E2 274 aa9.02□□□□□ -0.97
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LIN7BQ9HAP6 207 aa9.02□□□□□ -0.97
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BEX1Q9HBH7 125 aa9.02□□□□□ -0.97
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TAF9BQ9HBM6 251 aa9.02□□□□□ -0.97
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RAB18Q9NP72 206 aa9.02□□□□□ -0.97
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa9.02□□□□□ -0.97
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MGAM2Q2M2H8 2515 aa9.02□□□□□ -0.97
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ITGB1BP1O14713 200 aa9.01□□□□□ -0.97
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 YPEL1O60688 119 aa9.01□□□□□ -0.97
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HBZP02008 142 aa9.01□□□□□ -0.97
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CRYBA1P05813 215 aa9.01□□□□□ -0.97
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MDKP21741 143 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NFYBP25208 207 aa9.01□□□□□ -0.97
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SDC2P34741 201 aa9.01□□□□□ -0.97
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 VEGFCP49767 419 aa9.01□□□□□ -0.97
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RAB13P51153 203 aa9.01□□□□□ -0.97
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF134P52741 427 aa9.01□□□□□ -0.97
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EFNB2P52799 333 aa9.01□□□□□ -0.97
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PROK1P58294 105 aa9.01□□□□□ -0.97
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MADCAM1Q13477 382 aa9.01□□□□□ -0.97
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EBI3Q14213 229 aa9.01□□□□□ -0.97
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP9.01□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.7 ms