RNA–Protein interactions for RNA: YOR075W

UFE1, Transcript of t-SNARE protein required for retrograde vesicular traffic, yeast

Gene UFE1, Length 1,041 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UFE1	YOR075W	SEC15	P22224	910 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	BCS1	P32839	456 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	ARG2	P40360	574 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	NDC80	P40460	691 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	PPN1	Q04119	674 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	YPS7	Q06325	596 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	MTH1	P35198	433 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	PXA1	P41909	870 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	IES1	P43579	692 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	STU2	P46675	888 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	GND2	P53319	492 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	ATG4	P53867	494 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	IRC10	Q08118	586 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	DUN1	P39009	513 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	BUD8	P41698	603 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	SPO1	P53541	631 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	NSE5	Q03718	556 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	STP4	Q07351	490 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	TRE2	Q08693	809 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	MLH3	Q12083	715 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	RMP1	Q12530	201 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	ABF1	P14164	731 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	CDC43	P18898	376 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	EUG1	P32474	517 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	FAT1	P38225	669 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	PAF1	P38351	445 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	YIL077C	P40508	320 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	VID28	P40547	921 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	USV1	Q12132	391 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	TMA17	Q12513	150 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	AEP2	P22136	580 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	KIN3	P22209	435 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	NTH1	P32356	751 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	COS111	P38308	924 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	YJL206C	P39529	758 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	NIT2	P47016	307 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	MPS3	P47069	682 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	RFX1	P48743	811 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	CTR1	P49573	406 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	TAF4	P50105	388 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	SKY1	Q03656	742 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	YFT2	Q06676	274 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	YPR027C	Q12079	277 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
UFE1	YOR075W	DMC1	P25453	334 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	MRC1	P25588	1096 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	CTP1	P38152	299 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	YBR071W	P38243	211 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	BDH2	P39713	417 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	TAF3	Q12297	353 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	CDC26	P14724	124 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	SET3	P36124	751 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	GLG1	P36143	616 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	YGR151C	P53287	111 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	YDL086W	Q07505	273 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UFE1	YOR075W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
UFE1	YOR075W	PRE4	P30657	266 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UFE1	YOR075W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UFE1	YOR075W	DAL3	P32459	195 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UFE1	YOR075W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
UFE1	YOR075W	FDC1	Q03034	503 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UFE1	YOR075W	HLR1	Q04429	423 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UFE1	YOR075W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
UFE1	YOR075W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
UFE1	YOR075W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
UFE1	YOR075W	FUB1	P25659	250 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UFE1	YOR075W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UFE1	YOR075W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UFE1	YOR075W	KHA1	P40309	873 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UFE1	YOR075W	PRM2	P40534	656 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UFE1	YOR075W	YJR120W	P47157	116 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UFE1	YOR075W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
UFE1	YOR075W	DGR2	P32330	852 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UFE1	YOR075W	GMH1	P36125	273 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UFE1	YOR075W	UBS1	P38290	277 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UFE1	YOR075W	EMP65	P40085	556 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UFE1	YOR075W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
UFE1	YOR075W	COG6	P53959	839 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UFE1	YOR075W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
UFE1	YOR075W	HXT4	P32467	576 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UFE1	YOR075W	APL3	P38065	1025 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UFE1	YOR075W	TDP1	P38319	544 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UFE1	YOR075W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64

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