RNA–Protein interactions for RNA: YLR369W

SSQ1, Transcript of Mitochondrial hsp70-type molecular chaperone, yeastyeast

Gene SSQ1, Length 1,974 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSQ1YLR369W DBP7P36120 742 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W GRX7P38068 203 aa2.63□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W LAM4P38800 1345 aa2.63□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W CHS7P38843 316 aa2.63□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W YTA12P40341 825 aa2.63□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W PIP2P52960 996 aa2.63□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W NAN1Q02931 896 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W VPS72Q03388 795 aa2.63□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W YMR321CQ04898 105 aa2.63□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W NPC2Q12408 173 aa2.63□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W YOL098CQ12496 1037 aa2.63□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W RAD18P10862 487 aa2.63□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W PRE8P23639 250 aa2.63□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W PPZ1P26570 692 aa2.63□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W SHP1P34223 423 aa2.63□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W STB5P38699 743 aa2.63□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W TVP23P38962 199 aa2.63□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W FUN12P39730 1002 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W PFD1P46988 109 aa2.63□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W YJL049WP47048 450 aa2.63□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W RAI1P53063 387 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W YNL193WP53870 558 aa2.63□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W SFB2P53953 876 aa2.63□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W SLD5Q03406 294 aa2.63□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W FKS1P38631 1876 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W SAM1P10659 382 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W NPP1P25353 742 aa2.62□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W HBS1P32769 611 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W STE5P32917 917 aa2.62□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W YKR018CP36114 725 aa2.62□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W TIM54P47045 478 aa2.62□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W AZR1P50080 613 aa2.62□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W PHO23P50947 330 aa2.62□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W TMA64Q04600 565 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W RPN7Q06103 429 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W SKG3Q06315 1026 aa2.62□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W UPC2Q12151 913 aa2.62□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W ERP3Q12403 225 aa2.62□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W FMP27Q06179 2628 aa2.62□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W CYB2P00175 591 aa2.61□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W ADE8P04161 214 aa2.61□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W PIF1P07271 859 aa2.61□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W SWI6P09959 803 aa2.61□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W POL3P15436 1097 aa2.61□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W STE14P32584 239 aa2.61□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W TGL1P34163 548 aa2.61□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W MSS4P38994 779 aa2.61□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W HUL4P40985 892 aa2.61□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W CCM1P48237 864 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W MET13P53128 600 aa2.61□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W SLI1P53304 468 aa2.61□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W IRC10Q08118 586 aa2.61□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W CDC53Q12018 815 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W RRI2Q12348 645 aa2.61□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W TRM11Q12463 433 aa2.61□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W CCH1P50077 2039 aa2.61□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W PFK1P16861 987 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W MCM4P30665 933 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W SYN8P31377 255 aa2.61□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W AAR2P32357 355 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W TIM23P32897 222 aa2.61□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W YKL091CP33324 310 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W TFC4P33339 1025 aa2.61□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W PHO88P38264 188 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W BUL1P48524 976 aa2.61□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W UTP8P53276 713 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W SOL4P53315 255 aa2.61□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W SUN4P53616 420 aa2.61□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W ECM16Q04217 1267 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W LCD1Q04377 747 aa2.61□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W GUD1Q07729 489 aa2.61□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W FMP25Q08023 583 aa2.61□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W LAS17Q12446 633 aa2.61□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W IRA1P18963 3092 aa2.6□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W SAM2P19358 384 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W KAR4P25583 335 aa2.6□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W CHS3P29465 1165 aa2.6□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W STE13P33894 931 aa2.6□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W YBR184WP38299 523 aa2.6□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W PNG1Q02890 363 aa2.6□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W SPH1Q06160 661 aa2.6□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W YPR196WQ06595 470 aa2.6□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W NOT3P06102 836 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W MAS2P11914 482 aa2.6□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W STI1P15705 589 aaKnown RBP RIP-Chip data2.6□□□□□ -1.99not detected
SSQ1YLR369W TKL1P23254 680 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W MBR1P23493 339 aa2.6□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W CDC11P32458 415 aa2.6□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W HUL5P53119 910 aa2.6□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W WHI4Q07655 649 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W ATG11Q12527 1178 aa2.6□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W SNA3P14359 133 aa2.59□□□□□ -2
SSQ1YLR369W SED4P25365 1065 aa2.59□□□□□ -2
SSQ1YLR369W HRR25P29295 494 aaKnown RBP2.59□□□□□ -2
SSQ1YLR369W MCR1P36060 302 aaKnown RBP2.59□□□□□ -2
SSQ1YLR369W YRO2P38079 344 aa2.59□□□□□ -2
SSQ1YLR369W REG2P38232 338 aa2.59□□□□□ -2
SSQ1YLR369W ARP1P38696 384 aa2.59□□□□□ -2
SSQ1YLR369W TOK1P40310 691 aa2.59□□□□□ -2
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