RNA–Protein interactions for RNA: YKL111C

YKL111C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKL111C, Length 336 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL111CYKL111C EUG1P32474 517 aa3.1□□□□□ -1.91
YKL111CYKL111C DID4P36108 232 aa3.1□□□□□ -1.91
YKL111CYKL111C SET3P36124 751 aa3.1□□□□□ -1.91
YKL111CYKL111C GPP2P40106 250 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
YKL111CYKL111C QRI1P43123 477 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
YKL111CYKL111C YMR210WQ03649 449 aa3.1□□□□□ -1.91
YKL111CYKL111C FAP7Q12055 197 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
YKL111CYKL111C SUT2Q12286 268 aa3.1□□□□□ -1.91
YKL111CYKL111C TAF3Q12297 353 aa3.1□□□□□ -1.91
YKL111CYKL111C GLN4P13188 809 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
YKL111CYKL111C ATP12P22135 325 aa3.09□□□□□ -1.91
YKL111CYKL111C PRP28P23394 588 aa3.09□□□□□ -1.91
YKL111CYKL111C SER1P33330 395 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
YKL111CYKL111C CDS1P38221 457 aa3.09□□□□□ -1.91
YKL111CYKL111C ENP1P38333 483 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
YKL111CYKL111C DUG1P43616 481 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
YKL111CYKL111C RFX1P48743 811 aa3.09□□□□□ -1.91
YKL111CYKL111C ATG4P53867 494 aa3.09□□□□□ -1.91
YKL111CYKL111C SSL2Q00578 843 aa3.09□□□□□ -1.91
YKL111CYKL111C TIM44Q01852 431 aa3.09□□□□□ -1.91
YKL111CYKL111C YHM2Q04013 314 aa3.09□□□□□ -1.91
YKL111CYKL111C YFT2Q06676 274 aa3.09□□□□□ -1.91
YKL111CYKL111C HBT1Q07653 1046 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
YKL111CYKL111C CHS5Q12114 671 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
YKL111CYKL111C MRH1Q12117 320 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
YKL111CYKL111C MF(ALPHA)2P32435 120 aa3.08□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C MTC7P32633 139 aa3.08□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C YKR075CP36155 307 aa3.08□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C KHA1P40309 873 aa3.08□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C NDC80P40460 691 aa3.08□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C YIL077CP40508 320 aa3.08□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C VID28P40547 921 aa3.08□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C NIT2P47016 307 aa3.08□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C MPS3P47069 682 aa3.08□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C YJR120WP47157 116 aa3.08□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C DIA2Q08496 732 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C USV1Q12132 391 aa3.08□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C TAD3Q9URQ3 322 aa3.08□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C ERG20P08524 352 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C PRE4P30657 266 aa3.07□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C YBR071WP38243 211 aa3.07□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C COS111P38308 924 aa3.07□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C PAF1P38351 445 aa3.07□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C CBR1P38626 284 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C YHR097CP38809 366 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C PIG2P40187 538 aa3.07□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C UBA2P52488 636 aa3.07□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C SNF12P53628 566 aa3.07□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C VBA4Q04602 768 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C CLF1Q12309 687 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C TMA17Q12513 150 aa3.07□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C ACO1P19414 778 aaKnown RBP RIP-Chip data3.06□□□□□ -1.92not detected
YKL111CYKL111C TSR4P25040 408 aa3.06□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C KIN82P25341 720 aa3.06□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C EMP70P32802 667 aa3.06□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C CTP1P38152 299 aa3.06□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C ARG2P40360 574 aa3.06□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C PXA1P41909 870 aa3.06□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C TAH11P47112 604 aa3.06□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C YDL183CP48569 320 aa3.06□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C TAF4P50105 388 aa3.06□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C VPS73P53142 486 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C YGR151CP53287 111 aa3.06□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C COG6P53959 839 aa3.06□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C PTA1Q01329 785 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C NSE5Q03718 556 aa3.06□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C IZH3Q07959 543 aa3.06□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C NOP56Q12460 504 aaKnown RBP RIP-Chip data3.06□□□□□ -1.92not detected
YKL111CYKL111C FUB1P25659 250 aa3.05□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C HEM12P32347 362 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C HXT4P32467 576 aa3.05□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C CRG1P38892 291 aaRIP-Chip data3.05□□□□□ -1.92not detected
YKL111CYKL111C YJL206CP39529 758 aa3.05□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C MIT1P40002 666 aa3.05□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C FTR1P40088 404 aa3.05□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C PRM2P40534 656 aa3.05□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C BFA1P47113 574 aa3.05□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C CTR1P49573 406 aa3.05□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C SKY1Q03656 742 aa3.05□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C YDL086WQ07505 273 aa3.05□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C TUP1P16649 713 aa3.04□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C PRP22P24384 1145 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C GLG1P36143 616 aa3.04□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C TDP1P38319 544 aa3.04□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C KSP1P38691 1029 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C DUN1P39009 513 aa3.04□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C BDH2P39713 417 aa3.04□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C IRC5P43610 853 aa3.04□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C STU2P46675 888 aa3.04□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C SPO1P53541 631 aa3.04□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C NGL1Q08213 363 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C RMP1Q12530 201 aa3.04□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C RPS9BP05755 195 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C AEP2P22136 580 aa3.03□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C KIN3P22209 435 aa3.03□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C RMA1P36001 430 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C YMC2P38087 329 aa3.03□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C TMN3P40071 706 aa3.03□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C NMA2P53204 395 aa3.03□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C TIM50Q02776 476 aa3.03□□□□□ -1.92
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