RNA–Protein interactions for RNA: YJL177W

RPL17B, Transcript of Ribosomal 60S subunit protein L17B, yeastyeast

Gene RPL17B, Length 555 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPL17BYJL177W SEC15P22224 910 aa3.85□□□□□ -1.79
RPL17BYJL177W KIN82P25341 720 aa3.85□□□□□ -1.79
RPL17BYJL177W DAL3P32459 195 aa3.85□□□□□ -1.79
RPL17BYJL177W BIT2P38346 545 aa3.85□□□□□ -1.79
RPL17BYJL177W DUN1P39009 513 aa3.85□□□□□ -1.79
RPL17BYJL177W PIG2P40187 538 aa3.85□□□□□ -1.79
RPL17BYJL177W PXA1P41909 870 aa3.85□□□□□ -1.79
RPL17BYJL177W FHN1P53279 174 aa3.85□□□□□ -1.79
RPL17BYJL177W RCR2Q03446 210 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
RPL17BYJL177W TMN2Q04562 672 aa3.85□□□□□ -1.79
RPL17BYJL177W TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
RPL17BYJL177W RPS9BP05755 195 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
RPL17BYJL177W SSB1P11484 613 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
RPL17BYJL177W GLN4P13188 809 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
RPL17BYJL177W IME1P21190 360 aa3.84□□□□□ -1.79
RPL17BYJL177W PRP28P23394 588 aa3.84□□□□□ -1.79
RPL17BYJL177W PRP22P24384 1145 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
RPL17BYJL177W FEN2P25621 512 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
RPL17BYJL177W SEC6P32844 805 aa3.84□□□□□ -1.79
RPL17BYJL177W GPP2P40106 250 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
RPL17BYJL177W SSB2P40150 613 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
RPL17BYJL177W SDS3P40505 327 aa3.84□□□□□ -1.79
RPL17BYJL177W YIL077CP40508 320 aa3.84□□□□□ -1.79
RPL17BYJL177W BUD8P41698 603 aa3.84□□□□□ -1.79
RPL17BYJL177W GND2P53319 492 aa3.84□□□□□ -1.79
RPL17BYJL177W STP4Q07351 490 aa3.84□□□□□ -1.79
RPL17BYJL177W TRE2Q08693 809 aa3.84□□□□□ -1.79
RPL17BYJL177W MLH3Q12083 715 aa3.84□□□□□ -1.79
RPL17BYJL177W CHS5Q12114 671 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
RPL17BYJL177W RMP1Q12530 201 aa3.84□□□□□ -1.79
RPL17BYJL177W AEP2P22136 580 aa3.83□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W MTH1P35198 433 aa3.83□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W YBR071WP38243 211 aa3.83□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W COS111P38308 924 aa3.83□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W NDC80P40460 691 aa3.83□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W VID28P40547 921 aa3.83□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W IES1P43579 692 aa3.83□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W YJR120WP47157 116 aa3.83□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W SMX3P54999 86 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W SKY1Q03656 742 aa3.83□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W PPN1Q04119 674 aa3.83□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W YFT2Q06676 274 aa3.83□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W THR1P17423 357 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W PAF1P38351 445 aa3.82□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W ARG2P40360 574 aa3.82□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W NIT2P47016 307 aa3.82□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W RFX1P48743 811 aa3.82□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W CTR1P49573 406 aa3.82□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W RNR4P49723 345 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W ATG4P53867 494 aa3.82□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W YPR027CQ12079 277 aa3.82□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W USV1Q12132 391 aa3.82□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W CDC26P14724 124 aa3.81□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W CDC43P18898 376 aa3.81□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W MRC1P25588 1096 aa3.81□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W DGR2P32330 852 aa3.81□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W STU2P46675 888 aa3.81□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W MPS3P47069 682 aa3.81□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W TAF4P50105 388 aa3.81□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W SPC105P53148 917 aa3.81□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W FOL1P53848 824 aa3.81□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W IRC10Q08118 586 aa3.81□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W MRH1Q12117 320 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W NOP56Q12460 504 aaKnown RBP RIP-Chip data3.81□□□□□ -1.8not detected
RPL17BYJL177W ABF1P14164 731 aa3.8□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W HCA4P20448 770 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W ATP12P22135 325 aa3.8□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W KIN3P22209 435 aa3.8□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W SER1P33330 395 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W GLG1P36143 616 aa3.8□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W CTP1P38152 299 aa3.8□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W UBS1P38290 277 aa3.8□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W ENP2P48234 707 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W YGR151CP53287 111 aa3.8□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W SPO1P53541 631 aa3.8□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W COG6P53959 839 aa3.8□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W NSE5Q03718 556 aa3.8□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W YDL086WQ07505 273 aa3.8□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W ACO1P19414 778 aaKnown RBP RIP-Chip data3.79□□□□□ -1.8not detected
RPL17BYJL177W COX11P19516 300 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W FUB1P25659 250 aa3.79□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W PRE4P30657 266 aa3.79□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W NTH1P32356 751 aa3.79□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W MF(ALPHA)2P32435 120 aa3.79□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W MSS1P32559 526 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W SET3P36124 751 aa3.79□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W YHR033WP38690 423 aa3.79□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W YHR097CP38809 366 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W YJL206CP39529 758 aa3.79□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W KHA1P40309 873 aa3.79□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W SLD3P53135 668 aa3.79□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W NGL1Q08213 363 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W HXT4P32467 576 aa3.78□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W ENP1P38333 483 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W TMN3P40071 706 aa3.78□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W PRM2P40534 656 aa3.78□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W CCT7P42943 550 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W MSL5Q12186 476 aaKnown RBP RIP-Chip data3.78□□□□□ -1.8not detected
RPL17BYJL177W TAF3Q12297 353 aa3.78□□□□□ -1.8
RPL17BYJL177W GFA1P14742 717 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
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