RNA–Protein interactions for RNA: YJL004C

SYS1, Transcript of Integral membrane protein of the Golgi, yeast

Gene SYS1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYS1	YJL004C	PMT6	P42934	759 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYS1	YJL004C	YJR039W	P47107	1121 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYS1	YJL004C	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SYS1	YJL004C	NMA2	P53204	395 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYS1	YJL004C	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SYS1	YJL004C	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SYS1	YJL004C	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SYS1	YJL004C	ULA1	Q12059	462 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYS1	YJL004C	RKI1	Q12189	258 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYS1	YJL004C	TPK2	P06245	380 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYS1	YJL004C	PHO8	P11491	566 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYS1	YJL004C	NUP1	P20676	1076 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYS1	YJL004C	MSH2	P25847	964 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYS1	YJL004C	PEX6	P33760	1030 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYS1	YJL004C	MNN4	P36044	1178 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYS1	YJL004C	XBP1	P40489	647 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYS1	YJL004C	YIL077C	P40508	320 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYS1	YJL004C	RFX1	P48743	811 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYS1	YJL004C	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SYS1	YJL004C	KIN82	P25341	720 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	YMC1	P32331	307 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	NUP82	P40368	713 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	BUD6	P41697	788 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	UFO1	Q04511	668 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	ATG33	Q06485	197 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	ATG36	P46983	293 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	DIP5	P53388	608 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	YFT2	Q06676	274 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	VHS3	Q08438	674 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	RGT2	Q12300	763 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	HMG1	P12683	1054 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	APN1	P22936	367 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	PCL2	P25693	308 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	PET127	P32606	800 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	YKR075C	P36155	307 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	COS111	P38308	924 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	YHR202W	P38887	602 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	TAX4	P47030	604 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	HFD1	Q04458	532 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	GIN4	Q12263	1142 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	THI4	P32318	326 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	MAL31	P38156	614 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	BIT61	P47041	543 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	AIM14	P53109	570 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	VPS36	Q06696	566 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	DCS2	Q12123	353 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	YPT7	P32939	208 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	HOT13	P36078	116 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	SNF12	P53628	566 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	ORM2	Q06144	216 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	SFL1	P20134	766 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	MBR1	P23493	339 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	THI6	P41835	540 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	BFA1	P47113	574 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	MPS1	P54199	764 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	IRC3	Q06683	689 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	IZH3	Q07959	543 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	ELF1	P36053	145 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	BEM4	P39011	633 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	SCS3	P53012	380 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	CPR8	P53728	308 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	YMR210W	Q03649	449 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	ARG7	Q04728	441 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SYS1	YJL004C	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SYS1	YJL004C	OCA5	P38738	679 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SYS1	YJL004C	OSW7	P43611	510 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SYS1	YJL004C	YGL117W	P53133	265 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SYS1	YJL004C	AAD3	P25612	363 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SYS1	YJL004C	RIM4	P38741	713 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SYS1	YJL004C	PIH1	P38768	344 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SYS1	YJL004C	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SYS1	YJL004C	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SYS1	YJL004C	YUR1	P26725	428 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SYS1	YJL004C	STP1	Q00947	519 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SYS1	YJL004C	PPN1	Q04119	674 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SYS1	YJL004C	GUD1	Q07729	489 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SYS1	YJL004C	NTG2	Q08214	380 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SYS1	YJL004C	STE4	P18851	423 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYS1	YJL004C	YKU70	P32807	602 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYS1	YJL004C	PXA1	P41909	870 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYS1	YJL004C	SPO1	P53541	631 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYS1	YJL004C	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SYS1	YJL004C	TRS23	Q03784	219 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYS1	YJL004C	YLR407W	Q06070	228 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SYS1	YJL004C	ZPS1	Q12512	249 aa		4.04	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.3 ms