RNA–Protein interactions for RNA: YGR129W

SYF2, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF2, Length 648 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF2	YGR129W	HRT3	Q12347	344 aa		6.37	□□□□□ -1.39
SYF2	YGR129W	CDC6	P09119	513 aa		6.36	□□□□□ -1.39
SYF2	YGR129W	HSF1	P10961	833 aa		6.36	□□□□□ -1.39
SYF2	YGR129W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	6.36	□□□□□ -1.39
SYF2	YGR129W	TRM2	P33753	639 aa		6.36	□□□□□ -1.39
SYF2	YGR129W	GIP1	P38229	639 aa		6.36	□□□□□ -1.39
SYF2	YGR129W	PIH1	P38768	344 aa		6.36	□□□□□ -1.39
SYF2	YGR129W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	6.36	□□□□□ -1.39
SYF2	YGR129W	QDR2	P40474	542 aa		6.36	□□□□□ -1.39
SYF2	YGR129W	IES1	P43579	692 aa		6.36	□□□□□ -1.39
SYF2	YGR129W	RMD8	P43620	662 aa		6.36	□□□□□ -1.39
SYF2	YGR129W	SHE10	P53075	577 aa		6.36	□□□□□ -1.39
SYF2	YGR129W	NMA2	P53204	395 aa		6.36	□□□□□ -1.39
SYF2	YGR129W	VTC3	Q02725	835 aa		6.36	□□□□□ -1.39
SYF2	YGR129W	HER2	Q03557	464 aa		6.36	□□□□□ -1.39
SYF2	YGR129W	BSP1	Q06604	576 aa		6.36	□□□□□ -1.39
SYF2	YGR129W	TAF13	P11747	167 aa		6.35	□□□□□ -1.39
SYF2	YGR129W	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	6.35	□□□□□ -1.39
SYF2	YGR129W	RPC53	P25441	422 aa		6.35	□□□□□ -1.39
SYF2	YGR129W	RAD16	P31244	790 aa		6.35	□□□□□ -1.39
SYF2	YGR129W	CSE1	P33307	960 aa		6.35	□□□□□ -1.39
SYF2	YGR129W	TTI1	P36097	1038 aa		6.35	□□□□□ -1.39
SYF2	YGR129W	SIP3	P38717	1229 aa		6.35	□□□□□ -1.39
SYF2	YGR129W	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.35	□□□□□ -1.39	not detected
SYF2	YGR129W	YAT1	P80235	687 aa		6.35	□□□□□ -1.39
SYF2	YGR129W	CDD1	Q06549	142 aa		6.35	□□□□□ -1.39
SYF2	YGR129W	FLC1	Q08967	793 aa		6.35	□□□□□ -1.39
SYF2	YGR129W	TRS33	Q99394	268 aa		6.35	□□□□□ -1.39
SYF2	YGR129W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
SYF2	YGR129W	RPC31	P17890	251 aa		6.34	□□□□□ -1.39
SYF2	YGR129W	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
SYF2	YGR129W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.34	□□□□□ -1.39	not detected
SYF2	YGR129W	GAC1	P28006	793 aa		6.34	□□□□□ -1.39
SYF2	YGR129W	SWE1	P32944	819 aa		6.34	□□□□□ -1.39
SYF2	YGR129W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
SYF2	YGR129W	MNN4	P36044	1178 aa		6.34	□□□□□ -1.39
SYF2	YGR129W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
SYF2	YGR129W	YKE2	P52553	114 aa		6.34	□□□□□ -1.39
SYF2	YGR129W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
SYF2	YGR129W	YNR040W	P53736	256 aa		6.34	□□□□□ -1.39
SYF2	YGR129W	ARP5	P53946	755 aa		6.34	□□□□□ -1.39
SYF2	YGR129W	SEC5	P89102	971 aa		6.34	□□□□□ -1.39
SYF2	YGR129W	TIP41	Q12199	356 aa		6.34	□□□□□ -1.39
SYF2	YGR129W	TPK1	P06244	397 aa		6.33	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		6.33	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	YLR464W	P0CX17	216 aa		6.33	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		6.33	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		6.33	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	CBP3	P21560	335 aa		6.33	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	YSC83	P32792	385 aa		6.33	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	UTH1	P36135	365 aa		6.33	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	YKR051W	P36142	418 aa		6.33	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	YBR056W	P38081	501 aa		6.33	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	OCA5	P38738	679 aa		6.33	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	YHR054C	P38780	354 aa		6.33	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	HXT13	P39924	564 aa		6.33	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	YEL076C	P39971	216 aa		6.33	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	CBK1	P53894	756 aa		6.33	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	ADY4	Q05955	493 aa		6.33	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	YDL057W	Q07379	328 aa		6.33	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	NDJ1	Q12366	352 aa		6.33	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	ASF1	P32447	279 aa		6.32	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	STE5	P32917	917 aa		6.32	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	RAD55	P38953	406 aa		6.32	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	NUP82	P40368	713 aa		6.32	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	DMA2	P53924	522 aa		6.32	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	TAF10	Q12030	206 aa		6.32	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		6.31	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		6.31	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		6.31	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		6.31	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	KIN3	P22209	435 aa		6.31	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	TFB1	P32776	642 aa		6.31	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	UBP13	P38187	747 aa		6.31	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	YGR153W	P48238	217 aa		6.31	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.31	□□□□□ -1.4	not detected
SYF2	YGR129W	YOR296W	Q08748	1289 aa		6.31	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	MET4	P32389	672 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	SAP190	P36123	1033 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	LEU5	P38702	357 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	SDS3	P40505	327 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	GUP1	P53154	560 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	BUD9	P53226	547 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	TOF1	P53840	1238 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	WAR1	Q03631	944 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	SEG1	Q04279	960 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	YLR407W	Q06070	228 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	CUR1	Q06469	252 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4

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