RNA–Protein interactions for RNA: YGL137W

SEC27, Transcript of Essential beta'-coat protein of the COPI coatomer, yeast

Gene SEC27, Length 2,670 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SEC27	YGL137W	YAP6	Q03935	383 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	STP4	Q07351	490 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	KTR4	P38131	464 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	YHL041W	P38730	149 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	IRC5	P43610	853 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	PUS2	P53167	370 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	YPR027C	Q12079	277 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	NSI1	Q12457	570 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	VID28	P40547	921 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	CDC20	P26309	610 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	HXT4	P32467	576 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	SPC105	P53148	917 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	MRPL22	P53881	309 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	UBX4	P54730	416 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	OMS1	Q06668	471 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	PEX15	Q08215	383 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	SIC1	P38634	284 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	YHR112C	P38716	378 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	BUL1	P48524	976 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	GCN5	Q03330	439 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	NPC2	Q12408	173 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	DFG16	Q99234	619 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	MTC7	P32633	139 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	YNL195C	P40168	261 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	QRI7	P43122	407 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	YGR021W	P53212	290 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	VPS30	Q02948	557 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	LST4	P34239	828 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	SLD3	P53135	668 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	CDA2	Q06703	312 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	GPB1	Q08886	897 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	HOP1	P20050	605 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	PTP2	P29461	750 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	SNO2	P53823	222 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	ATG16	Q03818	150 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	NYV1	Q12255	253 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	KAR1	P11927	433 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	SED4	P25365	1065 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	KAR4	P25583	335 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	YKL222C	P35995	705 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	MAD2	P40958	196 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	MLC2	Q06580	163 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	VPS36	Q06696	566 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	YLR415C	O13578	112 aa		4.15	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	CTF13	P35203	478 aa		4.15	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	CDS1	P38221	457 aa		4.15	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	LYS9	P38999	446 aa		4.15	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	HIS6	P40545	261 aa		4.15	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	BUD8	P41698	603 aa		4.15	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	DIN7	Q12086	430 aa		4.15	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	SEG2	P34250	1132 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	PLB1	P39105	664 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	GET2	P40056	285 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	EXG2	P52911	562 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.14	□□□□□ -1.75	not detected
SEC27	YGL137W	EXO84	P38261	753 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	YDL183C	P48569	320 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	YLR224W	Q05947	369 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	YPL277C	Q08989	487 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	TGL5	Q12043	749 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	THI80	P35202	319 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	YAP3	P38749	330 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	RPP1	P38786	293 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	EMP65	P40085	556 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	TRM13	Q12383	476 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	PZF1	P39933	429 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	ERR3	P42222	437 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	RAV1	P47104	1357 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	HLR1	Q04429	423 aa		4.13	□□□□□ -1.75

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