RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000088652.5

Htatsf1-201, Transcript of HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Htatsf1, Length 2,810 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Cyp19a1P28649 503 aa18.52■□□□□ 0.56
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Sh3bp1P55194 680 aa18.52■□□□□ 0.56
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Ano10Q8BH79 659 aa18.52■□□□□ 0.56
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Cdca8Q8BHX3 289 aa18.52■□□□□ 0.56
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Golph3lQ8R088 285 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Clec11aO88200 328 aa18.52■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Tmem109Q3UBX0 243 aa18.52■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Fsd1Q7TPM6 496 aa18.52■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Fam160b2Q80YR2 744 aa18.52■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Ift57Q8BXG3 429 aa18.52■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Tomm22Q9CPQ3 142 aa18.52■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Dhx40Q6PE54 779 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Trim56Q80VI1 734 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Hnrnpul1Q8VDM6 859 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Fam114a1Q9D281 569 aa18.51■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Kcnq5Q9JK45 933 aa18.51■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Zeb2Q9R0G7 1215 aa18.51■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 ImmtQ8CAQ8 757 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Ubxn4Q8VCH8 506 aa18.51■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Appbp2Q9DAX9 585 aa18.51■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Ccdc112A0AUP1 442 aa18.5■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Stx1aO35526 288 aa18.5■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Rgs9O54828 675 aa18.5■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Pald1P70261 859 aa18.5■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Cct2P80314 535 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Zkscan4Q5SZT6 480 aa18.5■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Sik3Q6P4S6 1311 aa18.5■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Irx2P81066 474 aa18.5■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 ErmnQ5EBJ4 281 aa18.5■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Snw1Q9CSN1 536 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Zkscan5Q9Z1D8 819 aa18.5■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Gm29094F6Q785 221 aa18.5■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Ubap1lG3UW59 384 aa18.5■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Spty2d1Q68FG3 682 aa18.5■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Nxf7Q80SZ6 620 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Zkscan8Q8BSL0 588 aa18.5■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 MthfsQ9D110 203 aa18.5■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Casz1Q9CWL2 1761 aa18.49■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Pde4dQ01063 747 aa18.49■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 L1td1Q587J6 782 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Riok1Q922Q2 567 aa18.49■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Hdac6Q9Z2V5 1149 aa18.49■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Cyp2d34L7N463 504 aa18.49■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Ms4a1P19437 291 aa18.49■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Il17raQ60943 864 aa18.49■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Map10Q8BJS7 891 aa18.49■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 MetP16056 1379 aa18.49■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Nwd2Q6P5U7 1742 aa18.48■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Surf1P09925 306 aa18.48■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Gpr182P43142 395 aa18.48■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 GptQ8QZR5 496 aa18.48■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Greb1lB9EJV3 1913 aa18.48■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Nip7Q9CXK8 180 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Fkbp1aP26883 108 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 XpcP51612 930 aa18.47■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 LyarQ08288 388 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Cep63Q3UPP8 700 aa18.47■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Elf2Q9JHC9 593 aa18.47■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Rrp1P56183 494 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Igflr1Q3U4N7 345 aa18.47■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 BccipQ9CWI3 316 aa18.47■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Ube3bQ9ES34 1070 aa18.47■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Marf1Q8BJ34 1730 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Zbtb38Q3LR78 1197 aa18.46■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 BcanQ61361 883 aa18.46■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Dcaf5Q80T85 946 aa18.46■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Fbxo3Q9DC63 480 aa18.46■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Ccne2Q9Z238 404 aa18.46■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Sall1Q9ER74 1322 aa18.46■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Col3a1P08121 1464 aa18.46■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Lrp6O88572 1613 aa18.46■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Ssc5dQ8BV57 1371 aa18.46■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Q8BZJ8 459 aa18.46■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Srek1Q8BZX4 494 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Myh7Q91Z83 1935 aa18.46■□□□□ 0.55
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Znf568E9PYI1 671 aa18.45■□□□□ 0.54
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Cops6O88545 324 aa18.45■□□□□ 0.54
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Ercc3P49135 783 aa18.45■□□□□ 0.54
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Adam1aQ60813 791 aa18.45■□□□□ 0.54
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Ercc6lQ8BHK9 1240 aa18.45■□□□□ 0.54
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Odf2lQ9D478 642 aa18.45■□□□□ 0.54
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Fam84aQ9D650 292 aa18.45■□□□□ 0.54
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Col4a3bpQ9EQG9 624 aa18.45■□□□□ 0.54
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Akap11E9Q777 1895 aa18.45■□□□□ 0.54
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Cfap99A0A140LIX9 648 aa18.45■□□□□ 0.54
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Gpatch3Q8BIY1 525 aa18.45■□□□□ 0.54
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Cep55Q8BT07 462 aa18.45■□□□□ 0.54
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Alx1Q8C8B0 326 aa18.45■□□□□ 0.54
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Shisa4Q8CA71 197 aa18.45■□□□□ 0.54
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Naa16Q9DBB4 864 aa18.45■□□□□ 0.54
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Ccdc82Q6PG04 518 aa18.45■□□□□ 0.54
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Jmjd4Q8BFT6 427 aa18.45■□□□□ 0.54
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Vps33aQ9D2N9 598 aa18.45■□□□□ 0.54
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Samsn1P57725 372 aa18.44■□□□□ 0.54
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Anks1aP59672 1150 aa18.44■□□□□ 0.54
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 RbsnQ80Y56 783 aa18.44■□□□□ 0.54
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Brwd3A2AHJ4 1799 aa18.44■□□□□ 0.54
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Znf326O88291 580 aa18.44■□□□□ 0.54
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Prl3d1P18121 224 aa18.44■□□□□ 0.54
Htatsf1-201ENSMUST00000088652 Kcnj4P52189 445 aa18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 20.5 ms