Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y56

Rbsn, Rabenosyn-5, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbsnQ80Y56 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35,76■■■■□ 3,32
RbsnQ80Y56 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,74■■■■□ 3,31
RbsnQ80Y56 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,43■■■■□ 3,26
RbsnQ80Y56 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,79■■■■□ 3,16
RbsnQ80Y56 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,27■■■■□ 3,08
RbsnQ80Y56 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34,03■■■■□ 3,04
RbsnQ80Y56 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
RbsnQ80Y56 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32,82■■■□□ 2,84
RbsnQ80Y56 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
RbsnQ80Y56 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,79
RbsnQ80Y56 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
RbsnQ80Y56 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32,39■■■□□ 2,78
RbsnQ80Y56 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,76
RbsnQ80Y56 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,13■■■□□ 2,73
RbsnQ80Y56 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
RbsnQ80Y56 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,88■■■□□ 2,69
RbsnQ80Y56 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31,83■■■□□ 2,69
RbsnQ80Y56 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,81■■■□□ 2,68
RbsnQ80Y56 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,77■■■□□ 2,68
RbsnQ80Y56 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31,77■■■□□ 2,68
RbsnQ80Y56 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,77■■■□□ 2,68
RbsnQ80Y56 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,76■■■□□ 2,67
RbsnQ80Y56 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31,76■■■□□ 2,67
RbsnQ80Y56 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
RbsnQ80Y56 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
RbsnQ80Y56 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31,24■■■□□ 2,59
RbsnQ80Y56 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
RbsnQ80Y56 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31,11■■■□□ 2,57
RbsnQ80Y56 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31,05■■■□□ 2,56
RbsnQ80Y56 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
RbsnQ80Y56 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
RbsnQ80Y56 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
RbsnQ80Y56 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,5
RbsnQ80Y56 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30,67■■■□□ 2,5
RbsnQ80Y56 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30,66■■■□□ 2,5
RbsnQ80Y56 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
RbsnQ80Y56 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
RbsnQ80Y56 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30,5■■■□□ 2,47
RbsnQ80Y56 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30,44■■■□□ 2,46
RbsnQ80Y56 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
RbsnQ80Y56 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,25■■■□□ 2,43
RbsnQ80Y56 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
RbsnQ80Y56 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,17■■■□□ 2,42
RbsnQ80Y56 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
RbsnQ80Y56 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
RbsnQ80Y56 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
RbsnQ80Y56 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
RbsnQ80Y56 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
RbsnQ80Y56 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30■■■□□ 2,39
RbsnQ80Y56 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
RbsnQ80Y56 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
RbsnQ80Y56 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29,88■■■□□ 2,37
RbsnQ80Y56 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
RbsnQ80Y56 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
RbsnQ80Y56 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
RbsnQ80Y56 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
RbsnQ80Y56 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29,81■■■□□ 2,36
RbsnQ80Y56 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,79■■■□□ 2,36
RbsnQ80Y56 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,36
RbsnQ80Y56 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
RbsnQ80Y56 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
RbsnQ80Y56 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
RbsnQ80Y56 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
RbsnQ80Y56 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29,6■■■□□ 2,33
RbsnQ80Y56 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,6■■■□□ 2,33
RbsnQ80Y56 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
RbsnQ80Y56 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
RbsnQ80Y56 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
RbsnQ80Y56 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
RbsnQ80Y56 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,43■■■□□ 2,3
RbsnQ80Y56 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29,42■■■□□ 2,3
RbsnQ80Y56 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
RbsnQ80Y56 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
RbsnQ80Y56 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
RbsnQ80Y56 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29,34■■■□□ 2,29
RbsnQ80Y56 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29,34■■■□□ 2,29
RbsnQ80Y56 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29,32■■■□□ 2,28
RbsnQ80Y56 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
RbsnQ80Y56 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29,24■■■□□ 2,27
RbsnQ80Y56 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
RbsnQ80Y56 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
RbsnQ80Y56 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29,21■■■□□ 2,27
RbsnQ80Y56 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
RbsnQ80Y56 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
RbsnQ80Y56 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
RbsnQ80Y56 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
RbsnQ80Y56 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
RbsnQ80Y56 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
RbsnQ80Y56 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28,97■■■□□ 2,23
RbsnQ80Y56 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
RbsnQ80Y56 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
RbsnQ80Y56 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
RbsnQ80Y56 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
RbsnQ80Y56 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
RbsnQ80Y56 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,85■■■□□ 2,21
RbsnQ80Y56 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
RbsnQ80Y56 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
RbsnQ80Y56 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
RbsnQ80Y56 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
RbsnQ80Y56 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,75■■■□□ 2,19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,6 ms