Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y56

Rbsn, Rabenosyn-5, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbsnQ80Y56 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
RbsnQ80Y56 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
RbsnQ80Y56 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
RbsnQ80Y56 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
RbsnQ80Y56 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RbsnQ80Y56 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
RbsnQ80Y56 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RbsnQ80Y56 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
RbsnQ80Y56 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RbsnQ80Y56 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
RbsnQ80Y56 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RbsnQ80Y56 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
RbsnQ80Y56 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RbsnQ80Y56 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RbsnQ80Y56 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RbsnQ80Y56 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
RbsnQ80Y56 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
RbsnQ80Y56 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
RbsnQ80Y56 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
RbsnQ80Y56 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
RbsnQ80Y56 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
RbsnQ80Y56 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
RbsnQ80Y56 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
RbsnQ80Y56 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RbsnQ80Y56 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
RbsnQ80Y56 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
RbsnQ80Y56 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RbsnQ80Y56 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
RbsnQ80Y56 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
RbsnQ80Y56 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RbsnQ80Y56 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RbsnQ80Y56 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RbsnQ80Y56 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
RbsnQ80Y56 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
RbsnQ80Y56 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RbsnQ80Y56 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RbsnQ80Y56 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RbsnQ80Y56 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RbsnQ80Y56 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
RbsnQ80Y56 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RbsnQ80Y56 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RbsnQ80Y56 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RbsnQ80Y56 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RbsnQ80Y56 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RbsnQ80Y56 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RbsnQ80Y56 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RbsnQ80Y56 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RbsnQ80Y56 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RbsnQ80Y56 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30■■■□□ 2.39
RbsnQ80Y56 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RbsnQ80Y56 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RbsnQ80Y56 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RbsnQ80Y56 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RbsnQ80Y56 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RbsnQ80Y56 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RbsnQ80Y56 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RbsnQ80Y56 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RbsnQ80Y56 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RbsnQ80Y56 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
RbsnQ80Y56 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RbsnQ80Y56 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RbsnQ80Y56 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RbsnQ80Y56 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RbsnQ80Y56 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
RbsnQ80Y56 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
RbsnQ80Y56 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RbsnQ80Y56 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RbsnQ80Y56 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RbsnQ80Y56 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RbsnQ80Y56 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RbsnQ80Y56 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RbsnQ80Y56 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RbsnQ80Y56 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RbsnQ80Y56 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RbsnQ80Y56 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RbsnQ80Y56 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
RbsnQ80Y56 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RbsnQ80Y56 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RbsnQ80Y56 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RbsnQ80Y56 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RbsnQ80Y56 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RbsnQ80Y56 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
RbsnQ80Y56 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RbsnQ80Y56 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RbsnQ80Y56 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RbsnQ80Y56 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RbsnQ80Y56 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RbsnQ80Y56 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RbsnQ80Y56 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RbsnQ80Y56 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RbsnQ80Y56 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RbsnQ80Y56 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RbsnQ80Y56 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RbsnQ80Y56 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RbsnQ80Y56 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RbsnQ80Y56 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RbsnQ80Y56 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RbsnQ80Y56 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RbsnQ80Y56 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RbsnQ80Y56 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms