RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486539.1

CACNA2D1-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-211ENST00000486539 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP-0.22□□□□□ -2.44
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR56A4Q8NGH8 313 aa-0.22□□□□□ -2.44
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR4X1Q8NH49 305 aa-0.22□□□□□ -2.44
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR51F2Q8NH61 342 aa-0.22□□□□□ -2.44
CACNA2D1-211ENST00000486539 RNF133Q8WVZ7 376 aa-0.22□□□□□ -2.44
CACNA2D1-211ENST00000486539 UBE2E2Q96LR5 201 aa-0.22□□□□□ -2.44
CACNA2D1-211ENST00000486539 SMR3AQ99954 134 aa-0.22□□□□□ -2.44
CACNA2D1-211ENST00000486539 REEP1Q9H902 201 aa-0.22□□□□□ -2.44
CACNA2D1-211ENST00000486539 VPS37BQ9H9H4 285 aa-0.22□□□□□ -2.44
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa-0.22□□□□□ -2.44
CACNA2D1-211ENST00000486539 CMYA5Q8N3K9 4069 aa-0.22□□□□□ -2.44
CACNA2D1-211ENST00000486539 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 CACNA1SQ13698 1873 aa-0.22□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 MED14O60244 1454 aa-0.22□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 KDM5BQ9UGL1 1544 aa-0.23□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 AKAP9Q99996 3911 aa-0.23□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa-0.23□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa-0.23□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa-0.23□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 A0A0J9YX75 114 aa-0.23□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 GOLGA8JA6NMD2 632 aa-0.23□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 FNDC10F2Z333 226 aa-0.23□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 PLA2G10O15496 165 aa-0.23□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR2F2O95006 317 aa-0.23□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 TTC4O95801 387 aa-0.23□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 CDK1P06493 297 aa-0.23□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 GOLGA8HP0CJ92 632 aa-0.23□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 IL9P15248 144 aa-0.23□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 IMPA1P29218 277 aa-0.23□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 IFNAR2P48551 515 aa-0.23□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 IRF8Q02556 426 aa-0.23□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 C10orf91Q5T1B1 145 aa-0.23□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCDC183Q5T5S1 534 aa-0.23□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 PRNTQ86SH4 94 aa-0.23□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 NIT1Q86X76 327 aa-0.23□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa-0.23□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 NECAB1Q8N987 351 aa-0.23□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 MFSD8Q8NHS3 518 aa-0.23□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 UBA3Q8TBC4 463 aa-0.23□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMIGD2Q96BF3 282 aa-0.23□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC35G5Q96KT7 338 aa-0.23□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPZ1Q9BXG8 430 aa-0.23□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 XKR8Q9H6D3 395 aa-0.23□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 PRO0628Q9UI54 55 aa-0.23□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 AP3M1Q9Y2T2 418 aa-0.23□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR51B2Q9Y5P1 312 aa-0.23□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 MIA3Q5JRA6 1907 aa-0.23□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 KDM6BO15054 1643 aa-0.24□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa-0.24□□□□□ -2.45
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CACNA2D1-211ENST00000486539 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa-0.24□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 RGS5O15539 181 aa-0.24□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRAPPC3O43617 180 aa-0.24□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 NDUFS5O43920 106 aa-0.24□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 GPR75O95800 540 aa-0.24□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 GUCA1CO95843 209 aa-0.24□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 C1QCP02747 245 aa-0.24□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 GTF2F2P13984 249 aa-0.24□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 NBL1P41271 181 aa-0.24□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 RAB7AP51149 207 aa-0.24□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 MTPNP58546 118 aa-0.24□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP-0.24□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 SSX1Q16384 188 aa-0.24□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 RPEL1Q2QD12 228 aa-0.24□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF404Q494X3 552 aa-0.24□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa-0.24□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 LGALS9CQ6DKI2 356 aa-0.24□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 CENPPQ6IPU0 288 aa-0.24□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa-0.24□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 APRG1Q8IVJ8 170 aa-0.24□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC30A8Q8IWU4 369 aa-0.24□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM184AQ8NB25 1140 aa-0.24□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 ACBD4Q8NC06 268 aa-0.24□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR2M3Q8NG83 312 aa-0.24□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR4K2Q8NGD2 314 aa-0.24□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR2K2Q8NGT1 345 aa-0.24□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR6K6Q8NGW6 343 aa-0.24□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 ITFG1Q8TB96 612 aa-0.24□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR52B2Q96RD2 323 aa-0.24□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 CENPKQ9BS16 269 aa-0.24□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 CRACR2AQ9BSW2 395 aa-0.24□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPRR2GQ9BYE4 73 aa-0.24□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 UCK2Q9BZX2 261 aa-0.24□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 PKIBQ9C010 78 aa-0.24□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 SRRQ9GZT4 340 aa-0.24□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 ASB7Q9H672 318 aa-0.24□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP-0.24□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 TFR2Q9UP52 801 aa-0.24□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 CLUHO75153 1309 aa-0.24□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 TNIKQ9UKE5 1360 aa-0.24□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 ARAP3Q8WWN8 1544 aa-0.24□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 MUC4Q99102 2169 aa-0.25□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa-0.25□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa-0.25□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa-0.25□□□□□ -2.45
CACNA2D1-211ENST00000486539 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa-0.25□□□□□ -2.45
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