RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469034.1

SUMO1-210, Transcript of small ubiquitin-like modifier 1, human

TSL 3

Gene SUMO1, Length 511 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUMO1-210	ENST00000469034	BCKDHB	P21953	392 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	CXCR1	P25024	350 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	PTAFR	P25105	342 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	ABCD3	P28288	659 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	CRABP1	P29762	137 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	MAS1L	P35410	378 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	THBS4	P35443	961 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	PMEL	P40967	661 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	ZNF84	P51523	738 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	EFNA3	P52797	238 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	F2RL1	P55085	397 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	TMEM50B	P56557	158 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	CLDN6	P56747	220 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	SLC26A5	P58743	744 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	RAP1B	P61224	184 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	RAP1A	P62834	184 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	MALL	Q13021	153 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	BIK	Q13323	160 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	RAB32	Q13637	225 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	ACTBL2	Q562R1	376 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	NAA40	Q86UY6	237 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	OOSP2	Q86WS3	158 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	GKN2	Q86XP6	184 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	YAF2	Q8IY57	180 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	PRR22	Q8IZ63	422 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	KDM8	Q8N371	416 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	OR4K15	Q8NH41	348 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	OR51F2	Q8NH61	342 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	YPEL4	Q96NS1	127 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	TAAR9	Q96RI9	348 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	CLCC1	Q96S66	551 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	MICU1	Q9BPX6	476 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	NICN1	Q9BSH3	213 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	CRB3	Q9BUF7	120 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	HRH4	Q9H3N8	390 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	TUBA4B	Q9H853	241 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	PARP11	Q9NR21	331 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	STARD10	Q9Y365	291 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034		H0YIG0	161 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034		H3BMH7	237 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	HCRTR2	O43614	444 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	GMFG	O60234	142 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	CST4	P01036	141 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	IFNA6	P05013	189 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	S100A8	P05109	93 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	FABP1	P07148	127 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	H2BFM	P0C1H6	154 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	HOXB2	P14652	356 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	HPGD	P15428	266 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	ZNF823	P16415	610 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	PGC	P20142	388 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	ANOS1	P23352	680 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	PTGER4	P35408	488 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	ID4	P47928	161 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	NPY4R	P50391	375 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	P2RY4	P51582	365 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	EMP2	P54851	167 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	STARD6	P59095	220 aa		4.1	□□□□□ -1.75

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