RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 A0A0J9YW62 118 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 TRAPPC13A5PLN9 417 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 FAM172BPA6NC97 362 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 GJE1A6NN92 205 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 CTDSP2O14595 271 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 WNT9BO14905 357 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 COQ9O75208 318 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 PTP4A3O75365 173 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 STX11O75558 287 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 TSPAN19P0C672 248 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 HSMCR30P0CW71 290 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 NPR2P20594 1047 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 COX5AP20674 150 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 COL8A2P25067 703 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 POU1F1P28069 291 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 LCN1P31025 176 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 SDC2P34741 201 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 RAD52P43351 418 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 EVX1P49640 407 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 PNLIPRP2P54317 469 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 RAB25P57735 213 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 TAS2R41P59536 307 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 TAS2R43P59537 309 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 PRPS1P60891 318 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 HSPB3Q12988 150 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 KCNJ8Q15842 424 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 HSD17B12Q53GQ0 312 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 FBXW9Q5XUX1 488 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 FRRS1Q6ZNA5 592 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 WDFY1Q8IWB7 410 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 MS4A15Q8N5U1 240 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 LSMEM1Q8N8F7 131 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 OR2T33Q8NG76 320 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 OR6F1Q8NGZ6 308 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 OR52P1PQ8NH57 321 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 GPR151Q8TDV0 419 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 ST7LQ8TDW4 575 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 PHF21AQ96BD5 680 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 RNFT2Q96EX2 444 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 KLHL15Q96M94 604 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 SDF2Q99470 211 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 B9D2Q9BPU9 175 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF426Q9BUY5 554 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 BARHL1Q9BZE3 327 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF350Q9GZX5 532 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 SLC22A4Q9H015 551 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 KCNN2Q9H2S1 579 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM185BQ9H7F4 350 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 ANKRA2Q9H9E1 313 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 ABCB10Q9NRK6 738 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 INIPQ9NRY2 104 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 BABAM2Q9NXR7 383 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 OPN4Q9UHM6 478 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 CLEC2DQ9UHP7 191 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF229Q9UJW7 825 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 ICAM5Q9UMF0 924 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 AUP1Q9Y679 476 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 A0A087WZY1 265 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 FABP12A6NFH5 140 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 PRSS47A8MTI9 375 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 K7EIL1 84 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 TO15178 435 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 IDH3BO43837 385 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 ATP6V1G1O75348 118 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 NKX2-2O95096 273 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 LYPD3O95274 346 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 IGHV3-9P01782 118 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 CT62P0C5K7 136 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 LYL1P12980 280 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 IL7P13232 177 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 CPMP14384 443 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 EVI2BP34910 448 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 SFTPDP35247 375 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 ETV1P50549 477 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 BTG1P62324 171 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 LCN2P80188 198 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 TGFBR3Q03167 851 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 C17orf67Q0P5P2 114 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 GALEQ14376 348 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF79Q15937 498 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 GABRA6Q16445 453 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 GPAT3Q53EU6 434 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 MZT2BQ6NZ67 158 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF620Q6ZNG0 422 aa5.16□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms